Dossier

Biologie cellulaire : repousser les frontières du visible

L’évolution des techniques d’imagerie est indissociable de l’avancée des connaissances en biologie cellulaire, affinant notre compréhension de la cellule et des interactions intercellulaires.

Observation et acquisition d’images de cellules neurales, au microscope à fluorescence.
Observation et acquisition d’images de cellules neurales, au microscope à fluorescence.

© Cyril Frésillon / CNRS Photothèque

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Les progrès des technologies d’imagerie et de la biophysique ont permis des sauts d’échelle considérables dans l’observation des cellules, de leurs composants et de leurs comportements. Ils ont permis d’affiner nos connaissances des différents types cellulaires, de leurs fonctions, mais aussi de leur moyen de se diviser et de communiquer, par contact ou à distance.

Les microscopes optiques, qui reposent sur l’utilisation d’un faisceau lumineux, ont ouvert la voie aux microscopes électroniques, basés sur l’utilisation d’un faisceau d’électrons, et à la microscopie confocale, qui fait appel à l’utilisation d’un laser. Leur résolution révèle avec précision la structure externe et interne des organites. Couplés à l’usage de marqueurs biologiques, ces types de microscopes sont de formidables outils d’identification du trafic extracellulaire et des voies de signalisation intracellulaires.

Plus récemment, la microscopie super-résolution et le criblage haut débit d’objets biologiques 3D, permettent de franchir de nouvelles barrières de résolution. Au-delà de l’observation, il est désormais possible de manipuler des cellules une à une, à l’aide de microrobots télécommandés avec des pinces optiques.

Notre connaissance toujours plus fine de la machinerie cellulaire conduit même des scientifiques à concevoir des cellules artificielles ou à reprogrammer des cellules pour leur confier des tâches complètement différentes de leurs fonctions naturelles, porte ouverte à de nombreuses applications.

Découvrez en images un aperçu des recherches en biologie cellulaire menées dans les laboratoires du CNRS.

Mots clés : biophysique, ingénierie cellulaire, MEB (microscope électronique à balayage), MET (microscope électronique à transmission), confocale, imagerie, microfluidique, pinces optiques, cellule

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Coupe d'intestin grêle de souris observée en microscopie confocale multi-couleurs. Le marquage immunofluorescent révèle les cellules épithéliales (EpCAM) en cyan, les cellules de Paneth en gris, les lymphocytes T (CD3) en orange, les phagocytes (CD11c) en rouge, les leukocytes (CD45) en bleu foncé, le lysozyme M (via l'expression de la GFP) en vert et le collagène en jaune. L'image est obtenue par la combinaison de plusieurs lasers et d'un détecteur spectral permettant de distinguer une large…

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Coupe d'intestin grêle de souris observée en microscopie confocale multi-couleur
20170106_0005
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Activité hormonale dans des cellules d’Arabette des dames, "Arabidopsis thaliana", observée en microscopie confocale à fluorescence. Les chercheurs utilisent ici des marqueurs fluorescents codés génétiquement, le niveau d’expression et donc de l’activité hormonale est visible grâce à l’intensité du signal en microscopie confocale. La structure visible ici est un méristème apical caulinaire qui produit toutes les nouvelles fleurs (structures sphériques située en périphérie) d’une plante.

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Activité hormonale dans des cellules d’Arabette des dames en microscopie confocale à fluorescence
20170080_0012
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Imagerie in vivo de l’infection de cellules muqueuses par le VIH enregistrée par microscopie en temps réel et analysée à l’aide du logiciel Imaris. Pour visualiser les différents acteurs de l’infection, les cellules produisant le virus on été modifiées afin de produire un virus contenant des protéines fluorescente verte (GFP) et les cellules muqueuses génitales modifiées génétiquement pour exprimer en surface une protéine fluorescente rouge (RFP). Ensuite, les chercheurs reproduisent in vivo la…

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Analyse d’une imagerie in vivo de l’infection de cellules par le VIH
20190063_0004
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Soldats de l’immunité adaptative, les globules blancs forment une ligne de défense cruciale de notre organisme. Ici, à gauche, l’un de ces patrouilleurs, un lymphocyte T auxiliaire de 10 µm, est en pleine reconnaissance d’un intrus : à l’aide de sa trompe, il tâtonne la surface d’une microbille (5 µm) de plastique recouverte d’anticorps. Dans notre organisme, en guise de billes et d’anticorps, ce sont d’autres types de globules blancs qui éclairent les lymphocytes T en leur présentant des…

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20190063_0004
Gardes du corps aux aguets
20220122_0013
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L’autophagie est une voie de survie propre à la cellule : elle permet la destruction de pathogènes intracellulaires ou l’accès à une réserve en nutriments par le recyclage de ses membranes. Si elle n’est pas équilibrée, cela peut entraîner la mort de la cellule. Cette image présente la protéine RUFY3, impliquée dans le processus d’autophagie, dans un macrophage de souris - une cellule du système immunitaire chargée de phagocyter les corps étrangers. La couleur bleue illustre la présence de la…

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20220122_0013
La face cachée de la cellule
20170103_0017
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La formation embryonnaire des ganglions lymphatiques, petits organes essentiels à la réponse immunitaire, est désormais connue. Grâce à la microscopie à feuillet de lumière, les scientifiques ont pu déterminer les dynamiques à l’œuvre chez cet embryon de souris de 13,5 jours. En bleu, les cellules lymphoïdes (LTi), dérivant de l’endothélium hématogène, un tissu spécifique de l’embryon. Elles passent dans son foie où elles prolifèrent avant de migrer dans l’organisme pour donner naissance aux…

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20170103_0017
Little monster
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Ondulations spontanées de flagelles artificiels obtenus par autoassemblage de filaments d'actine et de myosines (un moteur moléculaire). Des scientifiques ont découvert que, plongés dans un bain de myosines, les filaments d'actine se rapprochent spontanément pour former des faisceaux d'environ 15 micromètres qui ondulent avec une période d'environ 10 secondes. L'image réunit 10 prises de vue de la même structure, à 1,4 seconde d'intervalle, ce qui permet de suivre une période du mouvement…

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Ondulations spontanées de flagelles artificiels obtenus par autoassemblage moléculaire
20200028_0013
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Manipulation d’une cellule à l’aide d’un microrobot sur une station de pinces optiques. Ce dispositif permet de manipuler des objets de taille micrométrique sans contact, grâce à la force résultant de la réfraction d’un faisceau laser. C’est le principe du piège optique. La télé-opération est utilisée pour des échantillons biologiques devant être confinés (cellules cancéreuses, bactéries, parasites, etc.). A l’écran, un microrobot sert d’intermédiaire : il est contrôlé via les pinces optiques…

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Manipulation d’une cellule à l’aide d’un microrobot sur une station de pinces optiques
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Manipulation d’une cellule à l’aide d’un microrobot sur une station de pinces optiques. Ce dispositif permet de manipuler des objets de taille micrométrique par un laser, selon le principe du piège optique. La télé-opération est utilisée pour des échantillons biologiques devant être confinés (cellules cancéreuses, bactéries, parasites, etc.). A l’écran, un microrobot sert d’intermédiaire de manipulation, pour éviter le contact direct entre le matériel biologique et le laser infrarouge qui est…

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Manipulation d’une cellule à l’aide d’un microrobot sur une station de pinces optiques
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Installation d’un échantillon dans le boîtier laser d’une station de pinces optiques. Ce dispositif permet de manipuler des objets de taille micrométrique sans contact, grâce à la force résultant de la réfraction d’un faisceau laser. C’est le principe du piège optique. La télé-opération est utilisée pour des échantillons biologiques devant être confinés (cellules cancéreuses, bactéries, parasites, etc.). Sur cette station, le retour visuel est complété par un retour de force en temps réel,…

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Installation d’un échantillon dans le boîtier laser d’une station de pinces optiques
20210064_0025
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Séparation magnétique dans une puce micro-fluidique avec micro-aimants NdFeB intégrés. Nora Dempsey est lauréate de la médaille de l’Innovation du CNRS 2021. Chercheuse à l’Institut Néel du CNRS, elle a été recrutée en 2001 au CNRS et elle s’est fait un nom en développant des procédés de synthèse de micro-aimants haute performance, dont elle contrôle la structure magnétique à différentes échelles. Ce savoir-faire, la physicienne l’exploite dans des collaborations avec des industriels, tel…

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Séparation magnétique dans une puce micro-fluidique avec micro-aimants NdFeB intégrés
20200095_0020
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Analyse morphologique et qualitative d’images de microscopie. Des cultures primaires de neurones ont été marquées pour détecter l’expression de diverses protéines. Les échantillons sont en cours d'observation sur un microscope confocal. Études réalisées dans l'équipe "Pathogénèse des infections virales du système nerveux central adulte et en développement", au plateau d'imagerie cellulaire de l'Institut Toulousain des maladies infectieuses et inflammatoires (Infinity).

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20200095_0020
Analyse morphologique et qualitative d’images de microscopie confocale
20170139_0016
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Etude du méristème apical caulinaire (sur la tige) d’une Arabette des dames, "Arabidopsis thaliana", en miscroscopie confocale à fluorescence. Le groupe de cellules situées au centre sont des cellules "souches", les cellules en périphérie ont la capacité de se différencier et ainsi de former les futures fleurs. Les fleurs d'une plante se développent de manière séquentielle, généralement l'une après l'autre. Chez l'Arabette, il faut compter environ 12 heures entre chaque nouvelle initiation de…

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20170139_0016
Etude d'un méristème apical caulinaire en miscroscopie confocale à fluorescence
20060001_0229
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Cellule du système nerveux, dite "gliale", en culture, vue en microscopie confocale observée par immunofluorescence. Cette cellule fournit des protéines indispensables au bon fonctionnement des neurones. En fluorescence rouge (marquage par un anticorps dirigé contre la ß-tubuline), apparaissent les microtubules. Des vésicules de sécrétion (petits points verts) contenant une anti-protéase étiquetée en vert par la GFP ("green fluorescent protein"), transportent ces protéines jusqu'à la surface de…

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20060001_0229
Cellule du système nerveux, dite "gliale", en culture, vue en microscopie confocale observée par imm
20180017_0001
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Cytosquelette de cellules cancéreuses. Cette image a été réalisée à l'aide d'un dispositif couplant microscopie de super résolution et criblage haut débit, sans intervention manuelle sur une plaque 96 puits. Ce dispositif permet de détecter et d'analyser la position et le mouvement de molécules uniques dans une plaque de 96 puits, de manière automatisée. Le microscope observe tour à tour chaque puits et l'analyse des données a lieu en temps réel, pendant l'acquisition, permettant ainsi un…

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Cytosquelette de cellules cancéreuses
20170139_0074
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Plateforme microfluidique. Les plantules d'Arabettes des dames, "Arabidopsis thaliana", sont placées dans des tubes reliés à une "puce" microfluidique. Le système racinaire peut alors se développer dans des canaux alimentés en milieu par des capillaires. L'expérimentateur peut varier de manière très rapide la composition de ce milieu et regarder l'impact à l'échelle cellulaire, en microscopie confocale spinning disk, sur plusieurs heures voire plusieurs jours. Les 16 canaux permettent de…

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Plateforme microfluidique
20210064_0027
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Puce micro-fluidique avec micro-aimants NdFeB intégrés pour la séparation magnétique. Nora Dempsey est lauréate de la médaille de l’Innovation du CNRS 2021. Chercheuse à l’Institut Néel du CNRS, elle a été recrutée en 2001 au CNRS et elle s’est fait un nom en développant des procédés de synthèse de micro-aimants haute performance, dont elle contrôle la structure magnétique à différentes échelles. Ce savoir-faire, la physicienne l’exploite dans des collaborations avec des industriels, tel Toyota…

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20210064_0027
Puce micro-fluidique avec micro-aimants NdFeB intégrés pour la séparation magnétique
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Des équipes de l'Ifremer ont trouvé au fond des océans une bactérie qui pourrait contribuer à l'essor de la médecine régénérative. L'objectif des équipes de l'unité de recherche Inserm 791 "Laboratoire d'ingénierie ostéo-articulaire et dentaire" et de l'Ifremer : fabriquer des gels injectables capables de stimuler la régénération de cartilage ou d'os à partir des cellules souches. Leur ingrédient clé : un polysaccharide produit par une bactérie d'origine marine répondant au doux nom d…

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Des bactéries réparatrices
20210044_0007
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Trajectoires simulées des récepteurs membranaires dans une dendrite, le prolongement d'un neurone. Les récepteurs alternent entre des périodes de diffusion libre rapide dans la dendrite (traces rouges) et un mouvement confiné à l’intérieur des synapses qui sont les lieux de communication entre neurones (traces bleues). Cette image a été générée à l'aide de FluoSim, un logiciel créé au sein de l’équipe Molécules d’adhérence cellulaire dans l’assemblage synaptique de l’IINS. Il permet de simuler…

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20210044_0007
Trajectoires simulées des récepteurs membranaires dans une dendrite
19950001_0573
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Photographie au microscope électronique d'un hépatocyte de souris. La cellule présente des villosités, un noyau entouré d'une membrane nucléaire où sont accollées des mottes de chromatine ; on voit un nucléole et une masse de chromatine arrondie. Le cytoplasme contient de nombreuses mitochondries, de l'ergastoplasme, des vacuoles. Grossissement x 12.000.

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Photographie au microscope électronique d'un hépatocyte de souris. La cellule présente des villosité
20170139_0073
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Plateforme microfluidique. Les plantules d'Arabettes des dames, "Arabidopsis thaliana", sont placées dans des tubes reliés à une "puce" microfluidique. Le système racinaire peut alors se développer dans des canaux alimentés en milieu par des capillaires. L'expérimentateur peut varier de manière très rapide la composition de ce milieu et regarder l'impact à l'échelle cellulaire, en microscopie confocale spinning disk, sur plusieurs heures voire plusieurs jours. Les 16 canaux permettent de…

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Plateforme microfluidique
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Concepteur de cellules artificielles, Franck Molina reprogramme le vivant pour des applications de diagnostic. Il obtient ainsi des détecteurs rapides, bon marché, qui changent de couleur en présence de certains biomarqueurs. Ses travaux ont fait l'objet de nombreux transferts industriels. Directeur de recherche CNRS au laboratoire Modélisation et ingénierie des systèmes complexes biologiques pour le diagnostic (Sys2Diag), qu'il dirige, Franck Molina est…

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Médaille de l'innovation 2020 : Franck Molina, chercheur en biotechnologies
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Portrait de Vincent Baylé, lauréat de la Médaille de Cristal 2020 du CNRS, ingénieur de recherche en microscopie et traitement d'images, spécialiste en microscopie et traitement d'images au sein de l'équipe Signalisation cellulaire et endocytose du laboratoire Reproduction et développement des plantes

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Médaille de Cristal 2020 : Vincent Baylé, ingénieur de recherche en microscopie et traitement d'images
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Portrait de Margaret Buckingham, biologiste du développement, lauréate de la Médaille d'or du CNRS 2013. Directrice de recherche de classe exceptionnelle émérite au CNRS et professeur émérite de l'Institut Pasteur, ses travaux de recherche ont permis des avancées majeures dans le domaine de la myogenèse (formation des muscles), de la cardiogenèse (formation du coeur) et sur les cellules souches chez l'embryon et l'adulte. Ses découvertes ont également un impact majeur…

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Une biologiste passionnée par le développement, Margaret Buckingham
20180017_0002
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Cytosquelette de cellules cancéreuses. Cette image a été réalisée à l'aide d'un dispositif couplant microscopie de super résolution et criblage haut débit, sans intervention manuelle sur une plaque 96 puits. Ce dispositif permet de détecter et d'analyser la position et le mouvement de molécules uniques dans une plaque de 96 puits, de manière automatisée. Le microscope observe tour à tour chaque puits et l'analyse des données a lieu en temps réel, pendant l'acquisition, permettant ainsi un…

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20180017_0002
Cytosquelette de cellules cancéreuses
20210101_0001
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Traduction d'un ARN messager (ARNm, les points verts sur l'image), observée de l'intérieur d'un embryon de drosophile en développement. Les noyaux de l'embryon sont colorés en violet. L'image a été acquise avec un microscope à feuille de lumière de type MuViSPIM. Des scientifiques ont pu visualiser pour la première fois en temps réel l’étape de traduction de molécules d'ARNm individuelles dans l’embryon de drosophile grâce au système SunTag. En quantifiant, où, quand et avec quelle dynamique la…

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Traduction d'un ARN messager, vue de l'intérieur d'un embryon de drosophile en développement
20180020_0006
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Ovocyte d'Amphioxus, "Branchiostoma lanceolatum", mesurant 140 micromètres, fixé au méthanol, observé en microscopie confocale à fluorescence. La tubuline est marquée par l'anticorps DM1A (Sigma) suivi d'un marquage secondaire couplé à la Fluorescéine. La majorité de la tubuline est maintenue sous sa forme monomérique dans des ovocytes bloqués en cycle de méiose. La perturbation de la voie de signalisation MAPK dans un ovocyte d'Amphioxus non fertilisé induit la formation d'asters…

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Ovocyte d'Amphioxus observé en microscopie confocale à fluorescence
20170099_0006
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Cellule HeLa en interphase observée en microscopie à fluorescence. L'ADN marqué en bleu est dans le noyau. Les mitochondries, centrales énergétiques de la cellule, sont à l’extérieur du noyau dans le cytoplasme, et sont marquées spécifiquement en rouge (mitotracker). L’interphase correspond à un accroissement du volume de la cellule et intervient juste avant la division cellulaire.

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Cellule HeLa en interphase
20170099_0009
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Cellules en cours de division lors de l’anaphase (quatrième phase de la division cellulaire par mitose), observées en microscopie optique à fluorescence. L'ADN est marqué en bleu, la protéine histone H3 est marquée en vert (H3 est une des protéines du nucléosome sur lequel s’enroule l’ADN pour former le chromosome). Les chromosomes se sont divisés et la cellule va elle aussi se diviser afin de donner deux cellules au patrimoine génétique identique.

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Cellules en cours de division lors de l’anaphase
20170098_0002
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Cellules de l'épiderme d'un pétale d'Arabette des dames, "Arabidopsis thaliana", en microscopie électronique à balayage sous pression partielle de vapeur d'eau (mode ESEM). Les chercheurs étudient ici comment certains facteurs de transcription, notamment ceux appartenant à la famille des MADS (La boîte MADS est un motif commun à certains facteurs de transcription. Son nom vient des quatre premiers facteurs dans lesquels on l'a identifiée: MCM1, Agamous, Deficiens et SRF), influent sur la…

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Cellules de l’épiderme d'un pétale d'Arabette des dames
20170087_0004
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Cellules de fleur réagissant au contact de l’oryzaline, une molécule affectant le dépôt de cellulose dans la paroi des cellules végétales, observées en microscopie confocale. Les plantes ont une croissance très directionnelle, dans les tiges ou les racines, mais aussi à plus petite échelle puisque les cellules végétales sont souvent très allongées. Cela est dû aux propriétés de la cellulose qui canalise la croissance des cellules dans une direction donnée. En utilisant l’oryzaline les cellules…

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20170087_0004
Cellules de fleur réagissant au contact de l’oryzaline
20200066_0001
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Immunodétection des protéines SYCP3 (en vert) et DAZL (en rouge) dans l’ovaire embryonnaire d’une souris contrôle. Dans cet ovaire, les cellules germinales (en rouge) sont en méiose, comme l’atteste la localisation de SYCP3 sur les chromosomes méiotiques (en vert). Cette image a été réalisée dans le cadre d’une étude démontrant que, contrairement à ce qu’il était admis depuis presque 15 ans, l’acide rétinoïque ne déclenche pas la méiose, le processus de division cellulaire qui permet la…

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Cellules germinales en méiose dans un ovaire embryonnaire de souris
20190015_0003
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Image par immunofluorescence d’un embryon d’oursin "Paracentrotus lividus" au stade unicellulaire. L’embryon est en métaphase de mitose, une étape de la division cellulaire. Les microtubules (en cyan) forment le fuseau mitotique et permettent l’alignement des chromosomes (en magenta). Le cortex d’actine (en jaune) délimite le contour de la cellule.

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20190015_0003
Image par immunofluorescence d’un embryon d’oursin "Paracentrotus lividus" au stade unicellulaire
20040001_0375
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Cellule humaine (HeLa) en mitose : des régulateurs importants de la division cellulaire sont localisés aux deux pôles (en rouge) du fuseau mitotique (en vert), une structure dynamique et précisément régulée qui assure la répartition équitable des chromosomes (en bleu) dans les cellules issues de la mitose. La mitose est une étape cruciale du processus de cancérisation.

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20040001_0375
Cellule humaine (HeLa) en mitose : des régulateurs importants de la division cellulaire sont localis
20220014_0021
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Observation de cellules préalablement irradiées issues d’un gliome (une tumeur cérébrale) prélevé sur un rongeur. Une scientifique réalise un suivi de l’irradiation de l’échantillon et observe le comportement des cellules irradiées et leurs interactions avec les autres cellules. Elle étudie l’effet bystander selon lequel les cellules irradiées pourraient avoir une action sur les cellules non irradiées. Cette étude permet de mieux comprendre les effets de l’irradiation sur les tissus et d…

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20220014_0021
Observation de l'effet bystander sur des cellules irradiées à IJCLab
20210137_0016
Open media modal

Pour envahir d’autres organes, les cellules tumorales entament un dialogue très habile avec le tissu environnant et la matrice extracellulaire. Elles vont notamment déclencher la création de nouveaux vaisseaux sanguins (angiogenèse) pour se nourrir et proliférer. Ce sont justement ces mécanismes de reprogrammation que l’on cherche à identifier, ici, à partir de cellules endothéliales - tapissant l’intérieur des vaisseaux. Dans ce microenvironnement complexe, leur architecture se distingue, en…

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20210137_0016
Will you be my valentine ?
20180032_0001
Open media modal

Marquage du réseau d’actine dans des cellules endothéliales sinusoïdales de foie de souris, révélé par immunomarquage et microscopie super-résolution STED (STimulated Emission Depletion), soit de la microscopie de fluorescence à balayage. Ces cellules ont la capacité à former des ouvertures au sein de leur membrane, appelées fenestrae, jouant un rôle important dans les échanges entre le foie et le réseau sanguin. L’actine est suspectée d’être très impliquée dans la dynamique et le maintien de…

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20180032_0001
Réseau d’actine dans des cellules endothéliales sinusoïdales de foie
20080001_0193
Open media modal

Macrophage humain observé par microscopie de fluorescence. Cette cellule sanguine de la défense immunitaire est en charge de reconnaître, de phagocyter et de détruire les agents infectieux. Sont étudiés les mécanismes moléculaires qui permettent à ces cellules de quitter le sang et de migrer à travers les tissus pour rejoindre les sites infectieux. L'ADN du noyau de la cellule est marqué en bleu et le cytosquelette d'actine en rouge. Les petits points sont des zones où la cellule s'accroche à…

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20080001_0193
Macrophage humain observé par microscopie de fluorescence. Cette cellule sanguine de la défense immu
20210044_0003
Open media modal

Reconstruction 3D d’un cyste d’une centaine de micromètres de diamètre formé à partir de cellules souches cultivées dans une capsule d’alginate avec la technologie d’encapsulation développée par la start-up TreeFrog Therapeutics. Cette image a été acquise grâce à la technologie de microscopie de fluorescence à feuillet de lumière « soSPIM », développée au sein de l’équipe Imagerie Quantitative de la Cellule à l’IINS, en collaboration avec le Mechanobiology Institute à Singapour. Cette…

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Reconstruction 3D d’un cyste d’une centaine de micromètres de diamètre
20210121_0001
Open media modal

Fibroblaste, cellule du derme, en culture au sein duquel les mitochondries (en magenta) forment un vaste réseau tubulaire, distribué autour du noyau (en bleu). Les mitochondries sont dynamiques, changent de forme continuellement par des évènements de fusion et de fission et migrent au travers du cytoplasme et le long des extensions membranaires (marquage vert grâce à une sonde lipidique fluorescente). Elles sont au coeur du système énergétique cellulaire et sont également impliquées dans de…

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Fibroblaste en culture au sein duquel les mitochondries forment un vaste réseau tubulaire
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Il y a en permanence des échanges entre le cytoplasme et le noyau des cellules. Le noyau est limité par une double membrane ponctuée de pores nucléaires qui permettent le passage par diffusion de protéines ou d'ARN sous certaines conditions très strictes. On parle d'import pour les échanges du cytoplasme vers le noyau et d'export dans l'autre sens. L'équipe de Catherine Dargemont à l'Institut Jacques Monod a été la première à mettre au point un système pour faire sortir les protéines du…

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Trafic dans la cellule

CNRS Images,

Nous mettons en images les recherches scientifiques pour contribuer à une meilleure compréhension du monde, éveiller la curiosité et susciter l'émerveillement de tous.