Thalle de l'algue brune filamenteuse "Ectocarpus siliculosus"

Thalle de l'algue brune filamenteuse "Ectocarpus siliculosus" flottant à la surface d’une goutte d’eau de mer, observée en microscopie à champ clair, elle mesure 2 mm de côté. L’algue "Ectocarpus" est utilisée comme modèle végétal car celle-ci se cultive facilement en laboratoire dans des milieux confinés tels que les boîtes de Pétri. Elle présente également des cycles de reproduction courts d'environ 6 semaines. Son génome a été le premier génome d'algue brune séquencé. Sa morphologie est simple : les cellules qui composent ses filaments sont toutes accessibles à l'observation et à l'expérimentation. Les chercheurs tentent ainsi d’identifier les facteurs qui contrôlent sa morphogenèse, soit le processus biologique qui donne sa forme à un organisme. Pour ce faire, ils tentent d’acquérir des données biologiques de plusieurs types : les paramètres biomécaniques de sa surface (paroi cellulaire) par microscopie à force atomique AFM, le profil d'expression cellule-dépendant par capture des cellules par microdissection laser LCM suivi de séquençage "RNA-seq", sa dynamique de croissance par microscopie suivie dans le temps ("time-lapse") et marquage des constituants cellulaires comme le cytosquelette, la paroi et le trafic vésiculaire. Les résultats montrent qu'il est possible de simuler ces processus en prenant en compte uniquement des critères biophysiques, tels que la pression interne des cellules, leur forme, la rigidité et l'épaisseur de leur paroi. De plus, une stratégie de croissance apicale du filament d'"Ectocarpus" originale et différente de celle mise en oeuvre par les autres organismes eucaryotes étudiés a été découverte.