Visualisation des données de séquençage génomique

Visualisation de résultats d'assemblages de génomes. À partir de l'ADN prélevé de cellules d'organismes vivants, les séquenceurs sont capables de "lire" le contenu de l'ADN et de le retranscrire sous forme de fichiers textuels. Cependant les séquenceurs ne sont capables de lire que des fragments d'ADN de petite taille : quelques centaines ou milliers de caractères alors que les génomes contiennent jusqu'à plusieurs milliards de caractères. Heureusement ces "lectures" se chevauchent, et, à la manière d'un puzzle, il est possible de reconstruire le génome. C'est ce qui s'appelle l'assemblage. Un résultat d'assemblage peut être visualisé sous forme de graphe car il est généralement impossible de retrouver exactement la séquence de l'organisme séquencé, qui contient lui-même des variations.