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Préparation d’un milieu de culture de cellules sous hotte stérile. Les scientifiques travaillent sur des cellules souches mésenchymateuses humaines (cellules capables d’agir sur la réparation et la régénération des tissus) et des fibroblastes humains (cellules principales du tissu conjonctif), cultivés in vitro. Des boîtes de Petri contenant un gel aux propriétés élastiques définies sont préparées sous une hotte stérile. Les cellules étudiées sont placées sur ce gel avec du milieu de culture…

Préparation d’un milieu de culture de cellules sous hotte stérile. Les scientifiques travaillent sur des cellules souches mésenchymateuses humaines (cellules capables d’agir sur la réparation et la régénération des tissus) et des fibroblastes humains (cellules principales du tissu conjonctif), cultivés in vitro. Des boîtes de Petri contenant un gel aux propriétés élastiques définies sont préparées sous une hotte stérile. Les cellules étudiées sont placées sur ce gel avec du milieu de culture…

Mise en culture de cellules de mammifères sous conditions contrôlées. Les boîtes de Petri contenant des cellules souches mésenchymateuses humaines (cellules capables d’agir sur la réparation et la régénération des tissus) et des fibroblastes humains (cellules principales du tissu conjonctif), ainsi que leur milieu de culture, sont placées dans un incubateur pendant 48h à 37 °C. Cette étape permet aux cellules de croître. Les scientifiques cherchent à mieux comprendre les adaptations et les…

Vérification visuelle de la mortalité de cellules de mammifères cultivées in vitro. Après s’être développés dans des conditions contrôlées, les cellules souches mésenchymateuses humaines (cellules capables d’agir sur la réparation et la régénération des tissus) et les fibroblastes humains (cellules principales du tissu conjonctif) sont examinés au microscope. Ce dernier permet de vérifier l’aspect des cellules, notamment leur croissance ou leur mortalité, dans chacune des boîtes de Petri. Les…

Observation de cellules de mammifères cultivées in vitro. Après s’être développés dans des conditions contrôlées, les cellules souches mésenchymateuses humaines (cellules capables d’agir sur la réparation et la régénération des tissus) et les fibroblastes humains (cellules principales du tissu conjonctif) sont examinés au microscope. Ce dernier permet de vérifier l’aspect des cellules, notamment leur croissance ou leur mortalité, dans chacune des boîtes de Petri. Un écran relié au microscope…

Observation de cellules de mammifères cultivées in vitro. Après s’être développés dans des conditions contrôlées, les cellules souches mésenchymateuses humaines (cellules capables d’agir sur la réparation et la régénération des tissus) et les fibroblastes humains (cellules principales du tissu conjonctif) sont examinés au microscope. Ce dernier permet de vérifier l’aspect des cellules, notamment leur croissance ou leur mortalité, dans chacune des boîtes de Petri. Un écran relié au microscope…

Observation de cellules de mammifères cultivées in vitro. Après s’être développés dans des conditions contrôlées, les cellules souches mésenchymateuses humaines (cellules capables d’agir sur la réparation et la régénération des tissus) et les fibroblastes humains (cellules principales du tissu conjonctif) sont examinés au microscope. Ce dernier permet de vérifier l’aspect des cellules, notamment leur croissance ou leur mortalité, dans chacune des boîtes de Petri. Un écran relié au microscope…

Préparation d’échantillons de cellules de mammifères cultivées in vitro pour les observer en microscopie à fluorescence. Des lamelles contenant des cellules souches mésenchymateuses humaines (cellules capables d’agir sur la réparation et la régénération des tissus) et des fibroblastes humains (cellules principales du tissu conjonctif), sont préparées pour être observées en microscopie à fluorescence. Au cours de cette expérience des protéines et des molécules d’intérêts (ici la lamine, l’actine…

Utilisation de la microscopie à fluorescence pour l’observation de cellules de mammifères cultivées in vitro. La microscopie à fluorescence permet de caractériser les modifications morphologiques des cellules, notamment de leur cytosquelette, qui est la composante structurale principale des cellules. Les protéines d’actine sont marquées en rouge permettant la visualisation des fibres d’actine, clé de voute du cytosquelette. La lamine qui délimite les noyaux des cellules est marquée en vert et…

Préparation d’une électrophorèse sur gel d’agarose permettant la migration de l’ADN. Des échantillons d’ADN, extraits de cellules cultivées sur des gels de différentes rigidités, sont prélevés et placés dans chacun des puits de la machine. Un courant électrique traversera le gel et permettra, au bout de 25 minutes, la migration des fragments d’ADN dans le gel afin de les séparer selon leur taille. L’ajout d’un ligand à la solution permet de bien visualiser la migration des échantillons d’ADN…

Visualisation de la migration de fragments d’ADN sous lumière ultraviolette (UV), après réalisation d’une électrophorèse d’ADN. La lumière UV permet de révéler chaque molécule d’ADN présente dans le gel d'agarose. Ici, la chromatine a été fragmentée par des ultrasons. Dans les cellules, l’ADN est empaqueté grâce à des protéines (notamment les histones), ce qui constitue la chromatine. Les fragments vont ensuite permettre de capturer des protéines spécifiques interagissant avec leurs régions d…

Visualisation de la migration de fragments d’ADN sous lumière ultraviolette (UV), après réalisation d’une électrophorèse d’ADN. La lumière UV permet de révéler chaque molécule d’ADN présente dans le gel d'agarose. Ici, la chromatine a été fragmentée par des ultrasons. Dans les cellules, l’ADN est empaqueté grâce à des protéines (notamment les histones), ce qui constitue la chromatine. Les fragments vont ensuite permettre de capturer des protéines spécifiques interagissant avec leurs régions d…

Visualisation de la migration de fragments d’ADN sous lumière ultraviolette (UV), après réalisation d’une électrophorèse d’ADN. La lumière UV permet de révéler chaque molécule d’ADN présente dans le gel d'agarose. Ici, la chromatine a été fragmentée par des ultrasons. Dans les cellules, l’ADN est empaqueté grâce à des protéines (notamment les histones), ce qui constitue la chromatine. Les fragments vont ensuite permettre de capturer des protéines spécifiques interagissant avec leurs régions d…

Préparation de billes magnétiques sur aimants pour la technique d’immunoprécipitation de la chromatine (ChIP). Cette méthode permet l'étude des protéines interagissant avec un fragment précis d'ADN. Au cours de cette manipulation, les protéines d’intérêt, qui sont liées à leurs régions d’ADN cibles, sont capturées grâce à des anticorps couplés à des billes magnétiques. Après séquençage, cela permet de déterminer les régions du génome humain qui sont ciblées par les protéines régulant l…

Préparation de billes magnétiques sur aimants pour la technique d’immunoprécipitation de la chromatine (ChIP). Cette méthode permet l'étude des protéines interagissant avec un fragment précis d'ADN. Au cours de cette manipulation, les protéines d’intérêt, qui sont liées à leurs régions d’ADN cibles, sont capturées grâce à des anticorps couplés à des billes magnétiques. Après séquençage, cela permet de déterminer les régions du génome humain qui sont ciblées par les protéines régulant l…

Préparation de billes magnétiques sur aimants pour la technique d’immunoprécipitation de la chromatine (ChIP). Cette méthode permet l'étude des protéines interagissant avec un fragment précis d'ADN. Au cours de cette manipulation, les protéines d’intérêt, qui sont liées à leurs régions d’ADN cibles, sont capturées grâce à des anticorps couplés à des billes magnétiques. Après séquençage, cela permet de déterminer les régions du génome humain qui sont ciblées par les protéines régulant l…

Discussion concernant la partie bio-informatique du projet MecEpi. L’objectif de ce projet est de mieux comprendre les adaptations et les réponses des cellules souches mésenchymateuses et fibroblastes humains aux stress mécaniques. Après une phase de séquençage, les données sont analysées. Les régions du génome humain qui sont ciblées par les protéines régulant l’expression des gènes sont déterminées. Les scientifiques comparent les échantillons résultant de différentes conditions de culture …

Discussion sur les résultats et avancées du projet MecEpi. L’objectif de ce projet est de mieux comprendre les adaptations et les réponses des cellules souches mésenchymateuses et fibroblastes humains aux stress mécaniques. Ainsi, les scientifiques sont parvenus à définir les gènes dont l’expression varie en fonction des conditions mécaniques (conditions de culture sur gel souple ou rigide). Grâce à des outils de génomique, ils ont pu caractériser les modifications de l’organisation 3D du…

Carte de microscopie électronique de la fibre génomique de mimivirus, pour la forme compacte contenant l’ADN. La structure est organisée en hélice à 5 brins, l'ADN est en beige sur l'image, protégé par l'enveloppe protéique hélicoïdale composée de deux oxydoréductases (des enzymes). Chaque brin du ruban formant cette hélice est coloré différemment sur l'image. Mimivirus appartient à la famille des "Mimiviridae", des virus géants infectant les amibes. Avec un génome ADN de 1,2 million de paires…

Carte de microscopie électronique de la fibre génomique de mimivirus, pour la forme relaxée. La structure est organisée en hélice à 5 brins où l'ADN, qui n'est plus visible dans la forme relaxée, est protégé par l'enveloppe protéique hélicoïdale composée de deux oxydoréductases (des enzymes). Chaque brin du ruban formant cette hélice est coloré différemment sur l'image. Mimivirus appartient à la famille des "Mimiviridae", des virus géants infectant les amibes. Avec un génome ADN de 1,2 million…

Coupe d’organoïde cérébral humain. Les organoïdes sont des structures multicellulaires reproduisant des organes en trois dimensions en culture in vitro. Par rapport à une culture classique, réalisée à plat et comprenant un seul type de cellule, les organoïdes miment plus efficacement le fonctionnement de l’organe répliqué et reproduisent certaines de ses fonctions. Ils sont notamment utilisés pour étudier le développement des organes et les maladies qui les touchent. Ainsi, ce "mini-cerveau" en…

Visualisation de résultats d'assemblages de génomes. À partir de l'ADN prélevé de cellules d'organismes vivants, les séquenceurs sont capables de "lire" le contenu de l'ADN et de le retranscrire sous forme de fichiers textuels. Cependant les séquenceurs ne sont capables de lire que des fragments d'ADN de petite taille : quelques centaines ou milliers de caractères alors que les génomes contiennent jusqu'à plusieurs milliards de caractères. Heureusement ces "lectures" se chevauchent, et, à la…

Visualisation de résultats d'assemblages de génomes. À partir de l'ADN prélevé de cellules d'organismes vivants, les séquenceurs sont capables de "lire" le contenu de l'ADN et de le retranscrire sous forme de fichiers textuels. Cependant les séquenceurs ne sont capables de lire que des fragments d'ADN de petite taille : quelques centaines ou milliers de caractères alors que les génomes contiennent jusqu'à plusieurs milliards de caractères. Heureusement ces "lectures" se chevauchent, et, à la…

Visualisation de résultats d'assemblages de génomes. À partir de l'ADN prélevé de cellules d'organismes vivants, les séquenceurs sont capables de "lire" le contenu de l'ADN et de le retranscrire sous forme de fichiers textuels. Cependant les séquenceurs ne sont capables de lire que des fragments d'ADN de petite taille : quelques centaines ou milliers de caractères alors que les génomes contiennent jusqu'à plusieurs milliards de caractères. Heureusement ces "lectures" se chevauchent, et, à la…

Visualisation de résultats d'assemblages de génomes. À partir de l'ADN prélevé de cellules d'organismes vivants, les séquenceurs sont capables de "lire" le contenu de l'ADN et de le retranscrire sous forme de fichiers textuels. Cependant les séquenceurs ne sont capables de lire que des fragments d'ADN de petite taille : quelques centaines ou milliers de caractères alors que les génomes contiennent jusqu'à plusieurs milliards de caractères. Heureusement ces "lectures" se chevauchent, et, à la…

Visualisation de résultats d'assemblages de génomes. À partir de l'ADN prélevé de cellules d'organismes vivants, les séquenceurs sont capables de "lire" le contenu de l'ADN et de le retranscrire sous forme de fichiers textuels. Cependant les séquenceurs ne sont capables de lire que des fragments d'ADN de petite taille : quelques centaines ou milliers de caractères alors que les génomes contiennent jusqu'à plusieurs milliards de caractères. Heureusement ces "lectures" se chevauchent, et, à la…

Visualisation de résultats d'assemblages de génomes. À partir de l'ADN prélevé de cellules d'organismes vivants, les séquenceurs sont capables de "lire" le contenu de l'ADN et de le retranscrire sous forme de fichiers textuels. Cependant les séquenceurs ne sont capables de lire que des fragments d'ADN de petite taille : quelques centaines ou milliers de caractères alors que les génomes contiennent jusqu'à plusieurs milliards de caractères. Heureusement ces "lectures" se chevauchent, et, à la…

Analyse de l'expression de gènes de l'immunité dans des macrophages par la technique de RNA-FISH à l'aide d'un microscope confocal. Le principe est de marquer des ARN par des sondes fluorescentes et les images sont ensuite analysées à l'aide d'un microscope. Les scientifiques étudient depuis de nombreuses années les mécanismes biologiques responsables des différences liées au sexe dans l'immunité. Leur hypothèse est que les hormones sexuelles (œstrogènes et androgènes), via leurs récepteurs…

Analyse de l'expression de gènes de l'immunité dans des macrophages par la technique de RNA-FISH à l'aide d'un microscope confocal. Le principe est de marquer des ARN par des sondes fluorescentes et les images sont ensuite analysées à l'aide d'un microscope. Les scientifiques étudient depuis de nombreuses années les mécanismes biologiques responsables des différences liées au sexe dans l'immunité. Leur hypothèse est que les hormones sexuelles (œstrogènes et androgènes), via leurs récepteurs…

Poste d'analyse d'un cytomètre en flux qui permet l'analyse à grande vitesse de l'expression de plusieurs molécules dans ou à la surface de cellules en suspension. Le principe est que les molécules d'intérêt sont reconnues par des anticorps couplés à des fluorochromes. Après excitation par un faisceau laser, la fluorescence émise est recueillie et quantifiée par le cytomètre. Les scientifiques étudient depuis de nombreuses années les mécanismes biologiques responsables des différences liées au…

Prélèvement de réactif avec un automate de pipetage. L'automate de pipetage permet de réduire le temps de préparation de plaques de PCR par exemple en vue de l'analyse de l'expression de gènes. Les scientifiques étudient depuis de nombreuses années les mécanismes biologiques responsables des différences liées au sexe dans l'immunité. Leur hypothèse est que les hormones sexuelles (œstrogènes et androgènes), via leurs récepteurs nucléaires, ainsi que les facteurs génétiques liés au chromosome X,…

Culture de cellules lymphoïdes innées de type 2 (ILC2) humaines avec différentes hormones stéroïdiennes. Les hormones sexuelles, naturellement présentes chez les hommes (androgènes) et chez les femmes (œstrogènes) peuvent influencer les cellules immunitaires comme les ILC2. Afin de mimer l'environnement dans lequel évolueraient ces cellules chez un homme ou une femme, les cellules sont cultivées dans des milieux contenant des hormones stéroïdiennes mâles ou femelles. Les scientifiques étudient…

Observation au microscope de cellules lymphoïdes innées de type 2 (ILC2) humaines qui ont été cultivées avec différentes hormones stéroïdiennes. Les hormones sexuelles, naturellement présentes chez les hommes (androgènes) et chez les femmes (œstrogènes) peuvent influencer les cellules immunitaires comme les ILC2. Afin de mimer l'environnement dans lequel évolueraient ces cellules chez un homme ou une femme, les cellules sont cultivées dans des milieux contenant des hormones stéroïdiennes mâles…

Observation au microscope de cellules lymphoïdes innées de type 2 (ILC2) humaines qui ont été cultivées avec différentes hormones stéroïdiennes. Les hormones sexuelles, naturellement présentes chez les hommes (androgènes) et chez les femmes (œstrogènes) peuvent influencer les cellules immunitaires comme les ILC2. Afin de mimer l'environnement dans lequel évolueraient ces cellules chez un homme ou une femme, les cellules sont cultivées dans des milieux contenant des hormones stéroïdiennes mâles…

Détail d'un compteur de particules qui permet de compter très précisément le nombre de cellules contenu dans les échantillons humains et murins. Les scientifiques étudient depuis de nombreuses années les mécanismes biologiques responsables des différences liées au sexe dans l'immunité. Leur hypothèse est que les hormones sexuelles (œstrogènes et androgènes), via leurs récepteurs nucléaires, ainsi que les facteurs génétiques liés au chromosome X, agissent de manière intrinsèque dans certaines…

Compteur de particules qui permet de compter très précisément le nombre de cellules contenu dans les échantillons humains et murins. Les scientifiques étudient depuis de nombreuses années les mécanismes biologiques responsables des différences liées au sexe dans l'immunité. Leur hypothèse est que les hormones sexuelles (œstrogènes et androgènes), via leurs récepteurs nucléaires, ainsi que les facteurs génétiques liés au chromosome X, agissent de manière intrinsèque dans certaines cellules du…

Têtard de crapaud commun, "Bufo bufo". La lumière artificielle nocturne est actuellement reconnue comme une menace pour la biodiversité. Ce phénomène global impacte tous les écosystèmes. Le crapaud commun, qui vit à proximité des zones urbaines, y est confronté en particulier, notamment lors des stades larvaires où les organismes aquatiques ont moins d'opportunités de fuir la lumière que les adultes. Des scientifiques se sont intéressés aux effets de la lumière artificielle nocturne sur l…

Virus géant "Mollivirus sibericum" vu en microscopie électronique à balayage. Ce type de virus dont la taille et la complexité génétique rivalisent avec les organismes cellulaires pourraient jouer un rôle métabolique majeur dans de nombreux écosystèmes. Les scientifiques ont étudié leur épigénome, c'est-à-dire l’ensemble des modifications épigénétiques de leurs génomes. Ils ont montré que leur ADN porte des marques épigénétiques. Les enzymes responsables, aux histoires évolutives complexes,…

Virus géants "Mollivirus sibericum" vus en microscopie électronique à balayage. Ce type de virus dont la taille et la complexité génétique rivalisent avec les organismes cellulaires pourraient jouer un rôle métabolique majeur dans de nombreux écosystèmes. Les scientifiques ont étudié leur épigénome, c'est-à-dire l’ensemble des modifications épigénétiques de leurs génomes. Ils ont montré que leur ADN porte des marques épigénétiques. Les enzymes responsables, aux histoires évolutives complexes,…

Virus géant "Mimivirus" vu en microscopie électronique à balayage. Ce type de virus dont la taille et la complexité génétique rivalisent avec les organismes cellulaires pourraient jouer un rôle métabolique majeur dans de nombreux écosystèmes. Les scientifiques ont étudié leur épigénome, c'est-à-dire l’ensemble des modifications épigénétiques de leurs génomes. Ils ont montré que leur ADN porte des marques épigénétiques. Les enzymes responsables, aux histoires évolutives complexes, sont parfois…

Virus géants "Mimivirus" vus en microscopie électronique à balayage. Ce type de virus dont la taille et la complexité génétique rivalisent avec les organismes cellulaires pourraient jouer un rôle métabolique majeur dans de nombreux écosystèmes. Les scientifiques ont étudié leur épigénome, c'est-à-dire l’ensemble des modifications épigénétiques de leurs génomes. Ils ont montré que leur ADN porte des marques épigénétiques. Les enzymes responsables, aux histoires évolutives complexes, sont parfois…

Virus géant "Pithovirus sibericum" vu en microscopie électronique à balayage. Ce type de virus dont la taille et la complexité génétique rivalisent avec les organismes cellulaires pourraient jouer un rôle métabolique majeur dans de nombreux écosystèmes. Les scientifiques ont étudié leur épigénome, c'est-à-dire l’ensemble des modifications épigénétiques de leurs génomes. Ils ont montré que leur ADN porte des marques épigénétiques. Les enzymes responsables, aux histoires évolutives complexes,…

Virus géants "Pithovirus sibericum" vus en microscopie électronique à balayage. Ce type de virus dont la taille et la complexité génétique rivalisent avec les organismes cellulaires pourraient jouer un rôle métabolique majeur dans de nombreux écosystèmes. Les scientifiques ont étudié leur épigénome, c'est-à-dire l’ensemble des modifications épigénétiques de leurs génomes. Ils ont montré que leur ADN porte des marques épigénétiques. Les enzymes responsables, aux histoires évolutives complexes,…

Virus géants "Pandoravirus salinus" vus en microscopie électronique à balayage. Ce type de virus dont la taille et la complexité génétique rivalisent avec les organismes cellulaires pourraient jouer un rôle métabolique majeur dans de nombreux écosystèmes. Les scientifiques ont étudié leur épigénome, c'est-à-dire l’ensemble des modifications épigénétiques de leurs génomes. Ils ont montré que leur ADN porte des marques épigénétiques. Les enzymes responsables, aux histoires évolutives complexes,…