Écosystèmes, biodiversité, évolution (ECOBIO)

Filtration d'eau interstitielle, contenue dans la tourbe, prélevée sur la tourbière de Frasne, dans le Doubs, lors d’une campagne interdisciplinaire d’étude du devenir des gaz à effet de serre (GES). Les scientifiques analyseront les concentrations en gaz, en carbone et en éléments majeurs dissous dans l’eau, ainsi que les isotopes du carbone et de la molécule d'eau. La campagne vise à mieux comprendre les mécanismes hydrologiques, biogéochimiques et écologiques qui contrôlent les sources, la…

Scientifiques au travail sur la plateforme scientifique de la tourbière de Frasne, dans le Doubs, lors d’une campagne interdisciplinaire d’étude du devenir des gaz à effet de serre (GES). Ils cherchent à mieux comprendre les mécanismes hydrologiques, biogéochimiques et écologiques qui contrôlent les sources, la production et les transferts de GES dans les tourbières. Dans ces zones humides, la matière organique se décompose mal et s'accumule sous forme de tourbe. Le carbone est alors stocké…

Nathalie Josselin Le Bris, lauréate de la médaille de cristal du CNRS 2022, met en place des échantillons en vue de quantifier des métabolites primaires par chromatographie en phase gazeuse et spectrométrie de masse (GC-MS). Spécialisée dans l’analyse chimique de matrices environnementales, elle exerce au CNRS depuis 2003. Elle a participé a la création de la plateforme d’analyse physico-chimique EcoChim de l'Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes / UMR ECOBIO, qui permet de…

Nathalie Josselin Le Bris, lauréate de la médaille de cristal du CNRS 2022, et une ingénieure manipulent un appareil de chromatographie liquide couplée à un spectromètre de masse en tandem (LC-TQs) permettant la quantification de pesticides dans des matrices environnementales (sol, végétaux, insectes etc.). Spécialisée dans l’analyse chimique de matrices environnementales, Nathalie Josselin Le Bris, exerce au CNRS depuis 2003. Elle a participé a la création de la plateforme d’analyse physico…

Nathalie Josselin Le Bris, lauréate de la médaille de cristal du CNRS 2022, est spécialisée dans l'analyse chimique de matrice environnementales, et exerce au CNRS depuis 2003. Elle a participé a la création de la plateforme d’analyse physico-chimique EcoChim de l'Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes / UMR ECOBIO, qui permet de quantifier et de caractériser divers échantillons biologiques et environnementaux pour répondre, en particulier, à des questions d'écologie fonctionnelle…

Nathalie Josselin Le Bris, lauréate de la médaille de cristal du CNRS 2022, est spécialisée dans l'analyse chimique de matrice environnementales, et exerce au CNRS depuis 2003. Elle a participé a la création de la plateforme d’analyse physico-chimique EcoChim de l'Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes / UMR ECOBIO, qui permet de quantifier et de caractériser divers échantillons biologiques et environnementaux pour répondre, en particulier, à des questions d'écologie fonctionnelle…

Nathalie Josselin Le Bris, lauréate de la médaille de cristal du CNRS 2022, est spécialisée dans l'analyse chimique de matrice environnementales, et exerce au CNRS depuis 2003. Elle a participé a la création de la plateforme d’analyse physico-chimique EcoChim de l'Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes / UMR ECOBIO, qui permet de quantifier et de caractériser divers échantillons biologiques et environnementaux pour répondre, en particulier, à des questions d'écologie fonctionnelle…

Drosophile à ailes tachetées, "Drosophila suzukii". Cette espèce de mouche invasive et susceptible d'occasionner des dégâts (nuisible), peut dévaster jusqu’à 80 % de la production d’un champ de framboises ou de cerises. Alors que les drosophiles pondent habituellement dans les fruits en décomposition, la drosophile à ailes tachetées dépose ses œufs dans des fruits encore sur pied. Cela oblige les agriculteurs à changer leurs pratiques. Ils récoltent les fruits plus régulièrement et les…

Serre expérimentale où sont notamment conservés des spécimens de spartines (genre "Spartina") et de renouées (genre "Reynoutria"), récoltées dans différentes régions du monde et dont certaines sont envahissantes. Ces collections sont notamment utilisées pour l’étude de l’histoire évolutive des espèces (par des approches génétiques et génomiques) et des analyses de l’expression des gènes en différentes conditions. Ces recherches se font à travers plusieurs partenariats internationaux.

Récolte de graines du Chou de Kerguelen, "Pringlea antiscorbutica R. Br.", ("Brassicaceae") formées en culture en phytotron froid (4 °C, Centre ECOLEX). Le programme de recherches PlantEvol / PlantADAPT soutenu par l’Institut polaire français Paul-Emile Victor porte sur les plantes des îles Kerguelen et Crozet (Terres australes et antarctiques françaises) et vise à évaluer leur plasticité physiologique et morphologique face au changement climatique, ainsi que leur diversité cytogénétique et…

Electrolyte à l'intérieur d'une microsonde qui mesure l'oxygène à différentes profondeurs dans une carotte de sédiment. La pointe très fine de la microsonde est plongée progressivement (100 micromètres par 100 micromètres) dans le sédiment prélevé en zone humide, dans la vasière de la réserve naturelle nationale de l'estuaire de la Seine, sous le pont de Normandie. Un micromanipulateur piloté par ordinateur permet de faire cette opération très précisément et d'enregistrer les taux d'oxygène à…

Acides nucléiques extraits de la vase et stockés dans un congélateur à -80 °C. Chaque échantillon issu de prélèvements réalisés sur le terrain est rangé en boîte, référencée dans une base de données. L'objectif de ces études de microbiologie environnementale est de comprendre le fonctionnement de milieux comme les vases. Les microorganismes qui y pratiquent des réactions pouvant aider à dépolluer sont détectés grâce à leurs acides nucléiques. La transformation des nitrates en diazote …

Consultation de la clé de détermination des carabides pour les paysages agricoles du nord-ouest de la France. Ce document de référence permet l'identification au genre et espèce des spécimens de carabes prélevés sur le terrain. Il a été réalisé par Jean-Luc Roger (Inrae) et Olivier Jambon (Ecobio – CNRS). Le carabe est beaucoup utilisé dans le monde de la recherche, c'est un modèle biologique. Les spécimens sont identifiés et conservés quelques années, le temps de la recherche, dans des…

Prélèvement de femelles de drosophile du cerisier, "Drosophila suzukii", avec un aspirateur à bouche. Elles sont ensuite mises dans de l'éthanol à 96° pour effectuer diverses analyses de biologie moléculaire (symbiotypage, génotypage, virologie, expression des gènes…). Cette petite mouche asiatique arrivée il y a 10/15 ans en France, est un très grand ravageur des cultures, notamment des petits fruits : cerises, framboises, fraises. Contrairement aux autres drosophiles elles ne s'attaquent pas…

Transfert de plantes (spartines et renouées) pour les amener au laboratoire afin de réaliser des analyses génétiques (extractions d'ADN), sur la plateforme d’écologie moléculaire (PEM) de l'unité de recherche Ecobio. Ces plantes sont des spécimens de spartines (genre "Spartina") et de renouées (genre "Reynoutria"), elles proviennent de différentes régions du monde et certaines sont envahissantes. Elles font partie des collections conservées dans la serre expérimentale d'Ecobio et sont notamment…

Nettoyage d'un faux philodendron, "Monstera deliciosa", dont certaines feuilles mesurent plus d'un mètre, au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio. Cette serre regroupe les différentes collections végétales qui sont utilisées pour les activités d’enseignement et accueille également des visites de publics variés. Elle est subdivisée en trois cellules de 70 m² représentant chacune un climat spécifique adapté aux plantes de la collection (zone tempérée, zone tropicale, cactées).

Cladocères, "Bosmina longirostris", observé au microscope inversé. Cette puce d'eau fait partie du zooplancton prélevé dans le lac de Grand-Lieu en Loire-Atlantique, et identifié dans le cadre d’un suivi de ce grand lac, qui est une réserve naturelle dont le fonctionnement écologique et la diversité planctonique sont peu connus. Le zooplancton est un des premiers maillons du réseau trophique. Il se nourrit du phytoplancton et est prédaté par les poissons. Il existe beaucoup d’espèces…

Observation d'une carotte de sédiment prélevée en zone humide, dans la vasière de la réserve naturelle nationale de l'estuaire de la Seine, sous le pont de Normandie. La pointe très fine d'une microsonde va être plongée progressivement dans le sédiment (100 micromètres par 100 micromètres) pour effectuer des mesures d'oxygène à différentes profondeurs. Un micromanipulateur piloté par ordinateur permet de faire cette opération très précisément et d'enregistrer les taux d'oxygène à chaque palier…

Screening de métabolites non ciblés par un système analytique composé d’une chaîne chromatographique ultra haute performance, d’une source d’ionisation par électrospray et d’un analyseur quadripôle-temps de vol en tandem. L’objectif de l’analyse est de mettre en évidence les métabolites d’intérêt impliqués dans l’adaptation aux changements climatiques (températures par exemple) ou aux activités humaines (pesticides) chez différents organismes (drosophiles, vers de terre, plantes, par exemple).

Plantes placées sur un chariot pour être amenées au laboratoire afin de réaliser des analyses génétiques (extractions d'ADN), sur la plateforme d’écologie moléculaire (PEM) de l'unité de recherche Ecobio. Ces plantes sont des spécimens de spartines (genre "Spartina") et de renouées (genre "Reynoutria"), elles proviennent de différentes régions du monde et certaines sont envahissantes. Elles font partie des collections conservées dans la serre expérimentale d'Ecobio et sont notamment utilisées…

Culture de plantes des îles Kerguelen et Crozet (Terres australes et antarctiques françaises) en phytotron froid (4 °C, ECOLEX), en vue d’étudier leur plasticité physiologique et morphologique face à un changement de conditions, ainsi que leur diversité cytogénétique et génétique. Le but du programme de recherches PlantEvol / PlantADAPT soutenu par l’Institut polaire français Paul-Emile Victor est de reconstituer l’évolution et d'évaluer la capacité d’adaptation des espèces de plantes…

Electrolyte à l'intérieur d'une microsonde qui mesure l'oxygène à différentes profondeurs dans une carotte de sédiment. La pointe très fine de la microsonde est plongée progressivement (100 micromètres par 100 micromètres) dans le sédiment prélevé en zone humide, dans la vasière de la réserve naturelle nationale de l'estuaire de la Seine, sous le pont de Normandie. Un micromanipulateur piloté par ordinateur permet de faire cette opération très précisément et d'enregistrer les taux d'oxygène à…

"Ranunculus pseudotrullifolius Skottsb.", plante d’origine magellanique, récoltée aux îles Kerguelen (Terres australes et antarctiques françaises) et en culture en phytotron froid (4 °C, Centre ECOLEX). Le programme de recherches PlantEvol / PlantADAPT soutenu par l’Institut polaire français Paul-Emile Victor porte sur les plantes des îles Kerguelen et Crozet (Terres australes et antarctiques françaises) et vise à évaluer leur plasticité physiologique et morphologique face au changement…

Consultation de la clé de détermination des carabides pour les paysages agricoles du nord-ouest de la France. Ce document de référence permet l'identification au genre et espèce des spécimens de carabes prélevés sur le terrain. Il a été réalisé par Jean-Luc Roger (Inrae) et Olivier Jambon (Ecobio – CNRS). Le carabe est beaucoup utilisé dans le monde de la recherche, c'est un modèle biologique. Les spécimens sont identifiés et conservés quelques années, le temps de la recherche, dans des…

Cage d'élevage contenant des drosophiles du cerisier, "Drosophila suzukii", placée dans un incubateur. Il permet de faire varier la température d'élevage, de -20 °C à +40 °C, et aussi la lumière en intensité et durée. Cette petite mouche asiatique arrivée il y a 10/15 ans en France, est un très grand ravageur des cultures, notamment des petits fruits : cerises, framboises, fraises. Contrairement aux autres drosophiles elles ne s'attaquent pas aux fruits déjà un peu trop mûrs, mais pondent dans…

Nettoyage d'un faux philodendron, "Monstera deliciosa", dont certaines feuilles mesurent plus d'un mètre, au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio. Cette serre regroupe les différentes collections végétales qui sont utilisées pour les activités d’enseignement et accueille également des visites de publics variés. Elle est subdivisée en trois cellules de 70 m² représentant chacune un climat spécifique adapté aux plantes de la collection (zone tempérée, zone tropicale, cactées).

Cladocères, "Bosmina longirostris", observé au microscope inversé. Cette puce d'eau fait partie du zooplancton prélevé dans le lac de Grand-Lieu en Loire-Atlantique, et identifié dans le cadre d’un suivi de ce grand lac, qui est une réserve naturelle dont le fonctionnement écologique et la diversité planctonique sont peu connus. Le zooplancton est un des premiers maillons du réseau trophique. Il se nourrit du phytoplancton et est prédaté par les poissons. Il existe beaucoup d’espèces…

Observation d'une carotte de sédiment prélevée en zone humide, dans la vasière de la réserve naturelle nationale de l'estuaire de la Seine, sous le pont de Normandie. La pointe très fine d'une microsonde va être plongée progressivement dans le sédiment (100 micromètres par 100 micromètres) pour effectuer des mesures d'oxygène à différentes profondeurs. Un micromanipulateur piloté par ordinateur permet de faire cette opération très précisément et d'enregistrer les taux d'oxygène à chaque palier…

Stockage dans un congélateur à -80 °C d'échantillons environnementaux. Chaque échantillon issu de prélèvements réalisés sur le terrain est rangé en boîte, référencée dans une base de données. L'objectif de ces études de microbiologie environnementale est de comprendre le fonctionnement de milieux comme les vases. Les microorganismes qui y pratiquent des réactions pouvant aider à dépolluer sont détectés grâce à leurs acides nucléiques. La transformation des nitrates en diazote (dénitrification)…

Collection d’échantillons de spartines (genre "Spartina") originaires d’Europe et d’Amérique du Nord, au premier plan. Au second plan, des plantes sont transférées de la serre expérimentale vers le laboratoire par une doctorante, pour l'analyse de l’évolution du génome des spartines. Ces plantes font partie des collections conservées dans la serre expérimentale d'Ecobio et sont notamment utilisées pour l’étude de l’histoire évolutive des espèces (par des approches génétiques et génomiques) et…

Culture de jeunes individus de "Lyallia kerguelensis Hook. f." ("Montiaceae"), plante en coussin strictement endémique des îles subantarctiques de Kerguelen, en phytotron froid (4°C, ECOLEX). Les îles Kerguelen (Terres australes et antarctiques françaises), dans l’océan Indien austral, sont soumises à un changement climatique rapide et intense. Le programme de recherches PlantEvol / PlantADAPT soutenu par l’Institut polaire français Paul-Emile Victor cherche à reconstituer l’évolution d'espèces…

Serre de collection du laboratoire Ecobio, regroupant les différentes collections végétales qui sont utilisées pour les activités d’enseignement et accueillant également des visites de publics variés. Elle est subdivisée en trois cellules de 70 m² représentant chacune un climat spécifique adapté aux plantes de la collection (zone tempérée, zone tropicale, cactées).

Deux espèces de carabes, la féronie noire, "Carabus intricatus", au centre et autour plus petits, des carabes embrouillés, "Abax parallelepipedus". Ils sont plutôt inféodés aux zones de bois et de haies à végétation dense. Le carabe est beaucoup utilisé dans le monde de la recherche, c'est un modèle biologique. Les spécimens sont identifiés et conservés quelques années, le temps de la recherche, dans des piluliers avec de l'éthanol à 70%. Ce coléoptère est réparti un peu partout en France pour…

Tube contenant des drosophiles du cerisier, "Drosophila suzukii". Cette petite mouche asiatique arrivée il y a 10/15 ans en France, est un très grand ravageur des cultures, notamment des petits fruits : cerises, framboises, fraises. Contrairement aux autres drosophiles elles ne s'attaquent pas aux fruits déjà un peu trop mûrs, mais pondent dans des fruits qui commencent à être matures. C'est donc quand le fruit peut être récolté que les larves commencent à sortir. Dans certaines cultures, près…

Apport de coccinelles "Cryptolaemus montrouzieri", sur des plantes au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio. Les différents insectes auxiliaires (coccinelles, chrysopes...) apportés dans la serre sont particulièrement intéressants dans le cadre de la lutte biologique puisqu'ils évitent les traitements chimiques pour réguler certains ravageurs (cochenilles, thrips, pucerons...). La serre de collection du laboratoire Ecobio regroupe les différentes collections végétales qui sont…

Carotte de sédiment prélevée en zone humide, dans la vasière de la réserve naturelle nationale de l'estuaire de la Seine, sous le pont de Normandie. La pointe très fine d'une microsonde va être plongée progressivement dans le sédiment (100 micromètres par 100 micromètres) pour effectuer des mesures d'oxygène à différentes profondeurs. Un micromanipulateur piloté par ordinateur permet de faire cette opération très précisément et d'enregistrer les taux d'oxygène à chaque palier. Ce taux d'oxygène…

Acides nucléiques extraits de la vase et stockés dans un congélateur à -80 °C. Chaque échantillon issu de prélèvements réalisés sur le terrain est rangé en boîte, référencée dans une base de données. L'objectif de ces études de microbiologie environnementale est de comprendre le fonctionnement de milieux comme les vases. Les microorganismes qui y pratiquent des réactions pouvant aider à dépolluer sont détectés grâce à leurs acides nucléiques. La transformation des nitrates en diazote …