Écosystèmes, biodiversité, évolution (ECOBIO)

Mesure des concentrations de dioxyde de carbone et de méthane au-dessus de la tourbière de Frasne, dans le Doubs, à l'aide d'un drone muni de capteurs, lors d’une campagne d'étude du devenir de ces gaz à effet de serre (GES). Les variations spatiales de concentration permettent de caractériser les conditions hydrologiques et de l’écosystème de la tourbière (écohydrologie) : végétation, niveau d'eau, etc. Cette campagne vise à mieux comprendre les mécanismes hydrologiques, biogéochimiques et…

Mesure de flux de dioxyde de carbone et de méthane entre l’écosystème et l'atmosphère, lors d’une campagne d'étude du devenir de ces gaz à effet de serre (GES) dans la tourbière Frasne, dans le Doubs. La serre (Open Top Chamber), qui simule un réchauffement passif de l'air au-dessus de la tourbière, est reliée à un analyseur de gaz par spectrométrie laser. Cette campagne vise à mieux comprendre les mécanismes hydrologiques, biogéochimiques et écologiques qui contrôlent les sources, la…

Nathalie Josselin Le Bris, lauréate de la médaille de cristal du CNRS 2022, est spécialisée dans l'analyse chimique de matrice environnementales, et exerce au CNRS depuis 2003. Elle a participé a la création de la plateforme d’analyse physico-chimique EcoChim de l'Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes / UMR ECOBIO, qui permet de quantifier et de caractériser divers échantillons biologiques et environnementaux pour répondre, en particulier, à des questions d'écologie fonctionnelle…

Nathalie Josselin Le Bris, lauréate de la médaille de cristal du CNRS 2022, est spécialisée dans l'analyse chimique de matrice environnementales, et exerce au CNRS depuis 2003. Elle a participé a la création de la plateforme d’analyse physico-chimique EcoChim de l'Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes / UMR ECOBIO, qui permet de quantifier et de caractériser divers échantillons biologiques et environnementaux pour répondre, en particulier, à des questions d'écologie fonctionnelle…

Nathalie Josselin Le Bris, lauréate de la médaille de cristal du CNRS 2022, est spécialisée dans l'analyse chimique de matrice environnementales, et exerce au CNRS depuis 2003. Elle a participé a la création de la plateforme d’analyse physico-chimique EcoChim de l'Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes / UMR ECOBIO, qui permet de quantifier et de caractériser divers échantillons biologiques et environnementaux pour répondre, en particulier, à des questions d'écologie fonctionnelle…

Nathalie Josselin Le Bris, lauréate de la médaille de cristal du CNRS 2022, met en place des échantillons en vue de quantifier des métabolites primaires par chromatographie en phase gazeuse et spectrométrie de masse (GC-MS). Spécialisée dans l’analyse chimique de matrices environnementales, elle exerce au CNRS depuis 2003. Elle a participé a la création de la plateforme d’analyse physico-chimique EcoChim de l'Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes / UMR ECOBIO, qui permet de…

Nathalie Josselin Le Bris, lauréate de la médaille de cristal du CNRS 2022, et une ingénieure-technicienne manipulant un appareil de chromatographie liquide couplée à un spectromètre de masse en tandem (LC-TQs) permettant la quantification de pesticides dans des matrices environnementales (sol, végétaux, insectes etc.). Spécialisée dans l’analyse chimique de matrices environnementales, Nathalie Josselin Le Bris, exerce au CNRS depuis 2003. Elle a participé a la création de la plateforme d…

Drosophile à ailes tachetées, "Drosophila suzukii". Cette espèce de mouche invasive et susceptible d'occasionner des dégâts (nuisible), peut dévaster jusqu’à 80 % de la production d’un champ de framboises ou de cerises. Alors que les drosophiles pondent habituellement dans les fruits en décomposition, la drosophile à ailes tachetées dépose ses œufs dans des fruits encore sur pied. Cela oblige les agriculteurs à changer leurs pratiques. Ils récoltent les fruits plus régulièrement et les…

Serre de collection du laboratoire Ecobio, regroupant les différentes collections végétales qui sont utilisées pour les activités d’enseignement et accueillant également des visites de publics variés. Elle est subdivisée en trois cellules de 70 m² représentant chacune un climat spécifique adapté aux plantes de la collection (zone tempérée, zone tropicale, cactées).

Deux espèces de carabes, la féronie noire, "Carabus intricatus", au centre et autour plus petits, des carabes embrouillés, "Abax parallelepipedus". Ils sont plutôt inféodés aux zones de bois et de haies à végétation dense. Le carabe est beaucoup utilisé dans le monde de la recherche, c'est un modèle biologique. Les spécimens sont identifiés et conservés quelques années, le temps de la recherche, dans des piluliers avec de l'éthanol à 70%. Ce coléoptère est réparti un peu partout en France pour…

Tube contenant des drosophiles du cerisier, "Drosophila suzukii". Cette petite mouche asiatique arrivée il y a 10/15 ans en France, est un très grand ravageur des cultures, notamment des petits fruits : cerises, framboises, fraises. Contrairement aux autres drosophiles elles ne s'attaquent pas aux fruits déjà un peu trop mûrs, mais pondent dans des fruits qui commencent à être matures. C'est donc quand le fruit peut être récolté que les larves commencent à sortir. Dans certaines cultures, près…

Apport de coccinelles "Cryptolaemus montrouzieri", sur des plantes au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio. Les différents insectes auxiliaires (coccinelles, chrysopes...) apportés dans la serre sont particulièrement intéressants dans le cadre de la lutte biologique puisqu'ils évitent les traitements chimiques pour réguler certains ravageurs (cochenilles, thrips, pucerons...). La serre de collection du laboratoire Ecobio regroupe les différentes collections végétales qui sont…

Acides nucléiques extraits de la vase et stockés dans un congélateur à -80 °C. Chaque échantillon issu de prélèvements réalisés sur le terrain est rangé en boîte, référencée dans une base de données. L'objectif de ces études de microbiologie environnementale est de comprendre le fonctionnement de milieux comme les vases. Les microorganismes qui y pratiquent des réactions pouvant aider à dépolluer sont détectés grâce à leurs acides nucléiques. La transformation des nitrates en diazote …

Carotte de sédiment prélevée en zone humide, dans la vasière de la réserve naturelle nationale de l'estuaire de la Seine, sous le pont de Normandie. La pointe très fine d'une microsonde va être plongée progressivement dans le sédiment (100 micromètres par 100 micromètres) pour effectuer des mesures d'oxygène à différentes profondeurs. Un micromanipulateur piloté par ordinateur permet de faire cette opération très précisément et d'enregistrer les taux d'oxygène à chaque palier. Ce taux d'oxygène…

Introduction de drosophiles du cerisier, "Drosophila suzukii", dans une cage d'élevage. Elles vont se disperser pour pondre dans des tubes ouverts contenant un milieu nutritif, composé de sucre et de levure, qui servira de nourriture pour les larves. Cette petite mouche asiatique arrivée il y a 10/15 ans en France, est un très grand ravageur des cultures, notamment des petits fruits : cerises, framboises, fraises. Contrairement aux autres drosophiles elles ne s'attaquent pas aux fruits déjà un…

Sélection de plantes en vue de prélèvements de jeunes feuilles, ici chez "Spartina versicolor", pour en extraire de l’ADN. "Spartina versicolor" était considérée native des côtes méditerranéennes, mais s’avère être une espèce introduite d’Amérique du Nord (synonyme de "Spartina patens") envahissante. Les scientifiques étudient l’histoire évolutive et les mécanismes tels que la polyploïdie (duplication du génome) à l’origine de la formation de nouvelles espèces envahissantes.

Culture de plantes des îles Kerguelen et Crozet (Terres australes et antarctiques françaises) en phytotron froid (4 °C, Centre ECOLEX), en vue d’étudier leur plasticité physiologique et morphologique face à un changement de conditions, ainsi que leur diversité cytogénétique et génétique. Le but du programme de recherches PlantEvol / PlantADAPT soutenu par l’Institut polaire français Paul-Emile Victor est de reconstituer l’évolution et d'évaluer la capacité d’adaptation des espèces de plantes…

Empotage de plantes bouturées, pour la conservation et la perpétuation des différentes espèces, au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio. Cette serre regroupe les différentes collections végétales qui sont utilisées pour les activités d’enseignement et accueille également des visites de publics variés. Elle est subdivisée en trois cellules de 70 m² représentant chacune un climat spécifique adapté aux plantes de la collection (zone tempérée, zone tropicale, cactées).

Un carabe, la féronie noire, "Carabus intricatus" mis dans un pilulier avec de l'éthanol à 70%. Le carabe est beaucoup utilisé dans le monde de la recherche, c'est un modèle biologique. Les spécimens sont identifiés et conservés quelques années, le temps de la recherche. Ce coléoptère est réparti un peu partout en France pour 60 à 70% des espèces, mais il existe tout de même des espèces endémiques à la région Bretagne et au type de paysage. Certains carabes sont inféodés à des haies, des bois,…

Tube contenant des drosophiles du cerisier, "Drosophila suzukii". Les mâles sont visibles ici, ils ont deux petits points noirs au bout des ailes. Cette petite mouche asiatique arrivée il y a 10/15 ans en France, est un très grand ravageur des cultures, notamment des petits fruits : cerises, framboises, fraises. Contrairement aux autres drosophiles elles ne s'attaquent pas aux fruits déjà un peu trop mûrs, mais pondent dans des fruits qui commencent à être matures. C'est donc quand le fruit…

Stockage dans un congélateur à -80 °C d'échantillons environnementaux. Chaque échantillon issu de prélèvements réalisés sur le terrain est rangé en boîte, référencée dans une base de données. L'objectif de ces études de microbiologie environnementale est de comprendre le fonctionnement de milieux comme les vases. Les microorganismes qui y pratiquent des réactions pouvant aider à dépolluer sont détectés grâce à leurs acides nucléiques. La transformation des nitrates en diazote (dénitrification)…

Pointe très fine d'une microsonde plongée dans une carotte de sédiment prélevée en zone humide, dans la vasière de la réserve naturelle nationale de l'estuaire de la Seine, sous le pont de Normandie. La pointe plonge progressivement dans le sédiment (100 micromètres par 100 micromètres) pour effectuer des mesures d'oxygène à différentes profondeurs. Un micromanipulateur piloté par ordinateur permet de faire cette opération très précisément et d'enregistrer les taux d'oxygène à chaque palier. Ce…

Apport de coccinelles "Cryptolaemus montrouzieri", sur des plantes au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio. Les différents insectes auxiliaires (coccinelles, chrysopes...) apportés dans la serre sont particulièrement intéressants dans le cadre de la lutte biologique puisqu' ils évitent les traitements chimiques pour réguler certains ravageurs (cochenilles, thrips, pucerons...). La serre de collection du laboratoire Ecobio regroupe les différentes collections végétales qui sont…

Echantillons de vase stockés dans un congélateur à -80 °C. Chaque échantillon issu de prélèvements réalisés sur le terrain est rangé en boîte, référencée dans une base de données. L'objectif de ces études de microbiologie environnementale est de comprendre le fonctionnement de milieux comme les vases. Les microorganismes qui y pratiquent des réactions pouvant aider à dépolluer sont détectés grâce à leurs acides nucléiques. La transformation des nitrates en diazote (dénitrification) peut ainsi…

Carotte de sédiment prélevée en zone humide, dans la vasière de la réserve naturelle nationale de l'estuaire de la Seine, sous le pont de Normandie. La pointe très fine d'une microsonde va être plongée progressivement dans le sédiment (100 micromètres par 100 micromètres) pour effectuer des mesures d'oxygène à différentes profondeurs. Un micromanipulateur piloté par ordinateur permet de faire cette opération très précisément et d'enregistrer les taux d'oxygène à chaque palier. Ce taux d'oxygène…

Introduction de drosophiles du cerisier, "Drosophila suzukii", dans une cage d'élevage. Elles vont se disperser pour pondre dans des tubes ouverts contenant un milieu nutritif, composé de sucre et de levure, qui servira de nourriture pour les larves. Cette petite mouche asiatique arrivée il y a 10/15 ans en France, est un très grand ravageur des cultures, notamment des petits fruits : cerises, framboises, fraises. Contrairement aux autres drosophiles elles ne s'attaquent pas aux fruits déjà un…

Prélèvement de jeunes feuilles de "Spartina versicolor" en vue d’extractions d’ADN. Cette plante était considérée native des côtes méditerranéennes, mais s’avère être une espèce introduite d’Amérique du Nord (synonyme de "Spartina patens") envahissante. Les scientifiques étudient l’histoire évolutive et les mécanismes tels que la polyploïdie (duplication du génome) à l’origine de la formation de nouvelles espèces envahissantes.

Chou de Kerguelen, "Pringlea antiscorbutica R. Br." ("Brassicaceae"), plante endémique de la province phytogéographique des îles subantarctiques de Kerguelen, en culture dans un phytotron froid (4 °C, Centre ECOLEX). Les îles Kerguelen (Terres australes et antarctiques françaises), dans l’océan Indien austral, sont soumises à un changement climatique rapide et intense. Le programme de recherches PlantEvol / PlantADAPT soutenu par l’Institut polaire français Paul-Emile Victor cherche à…

Empotage de plantes bouturées, pour la conservation et la perpétuation des différentes espèces, au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio. Cette serre regroupe les différentes collections végétales qui sont utilisées pour les activités d’enseignement et accueille également des visites de publics variés. Elle est subdivisée en trois cellules de 70 m² représentant chacune un climat spécifique adapté aux plantes de la collection (zone tempérée, zone tropicale, cactées).

Screening de métabolites non ciblés par un système analytique composé d’une chaîne chromatographique ultra haute performance, d’une source d’ionisation par électrospray et d’un analyseur quadripôle-temps de vol en tandem. L’objectif de l’analyse est de mettre en évidence les métabolites d’intérêt impliqués dans l’adaptation aux changements climatiques (températures par exemple) ou aux activités humaines (pesticides) chez différents organismes (drosophiles, vers de terre, plantes par exemple).

Deux espèces de carabes, la féronie noire, "Carabus intricatus", au centre et autour plus petits, des carabes embrouillés, "Abax parallelepipedus". Ils sont plutôt inféodés aux zones de bois et de haies à végétation dense. Le carabe est beaucoup utilisé dans le monde de la recherche, c'est un modèle biologique. Les spécimens sont identifiés et conservés quelques années, le temps de la recherche, dans des piluliers avec de l'éthanol à 70%. Ce coléoptère est réparti un peu partout en France pour…

Mouches sans ailes, "Anatalanta Aptera", originaires des îles Kerguelen, élevées ici en laboratoire. Elles mesurent environ 7 mm et ressemblent à des fourmis. Elles sont étudiées dans le cadre des problématiques sur le changement climatique. L'objectif est de voir comment, dans des conditions de laboratoire, elles supportent les variations de température. Leur capacité à jeûner est aussi étudiée, car leur résistance au jeûne est très forte. Elles peuvent supporter de rester 6 mois sans…

Serre expérimentale où sont notamment conservés des spécimens de spartines (genre "Spartina") et de renouées (genre "Reynoutria"), récoltées dans différentes régions du monde et dont certaines sont envahissantes. Ces collections sont notamment utilisées pour l’étude de l’histoire évolutive des espèces (par des approches génétiques et génomiques) et des analyses de l’expression des gènes en différentes conditions. Ces recherches se font à travers plusieurs partenariats internationaux.

Récolte de graines du Chou de Kerguelen, "Pringlea antiscorbutica R. Br.", ("Brassicaceae") formées en culture en phytotron froid (4 °C, Centre ECOLEX). Le programme de recherches PlantEvol / PlantADAPT soutenu par l’Institut polaire français Paul-Emile Victor porte sur les plantes des îles Kerguelen et Crozet (Terres australes et antarctiques françaises) et vise à évaluer leur plasticité physiologique et morphologique face au changement climatique, ainsi que leur diversité cytogénétique et…

Acides nucléiques extraits de la vase et stockés dans un congélateur à -80 °C. Chaque échantillon issu de prélèvements réalisés sur le terrain est rangé en boîte, référencée dans une base de données. L'objectif de ces études de microbiologie environnementale est de comprendre le fonctionnement de milieux comme les vases. Les microorganismes qui y pratiquent des réactions pouvant aider à dépolluer sont détectés grâce à leurs acides nucléiques. La transformation des nitrates en diazote …

Electrolyte à l'intérieur d'une microsonde qui mesure l'oxygène à différentes profondeurs dans une carotte de sédiment. La pointe très fine de la microsonde est plongée progressivement (100 micromètres par 100 micromètres) dans le sédiment prélevé en zone humide, dans la vasière de la réserve naturelle nationale de l'estuaire de la Seine, sous le pont de Normandie. Un micromanipulateur piloté par ordinateur permet de faire cette opération très précisément et d'enregistrer les taux d'oxygène à…

Consultation de la clé de détermination des carabides pour les paysages agricoles du nord-ouest de la France. Ce document de référence permet l'identification au genre et espèce des spécimens de carabes prélevés sur le terrain. Il a été réalisé par Jean-Luc Roger (Inrae) et Olivier Jambon (Ecobio – CNRS). Le carabe est beaucoup utilisé dans le monde de la recherche, c'est un modèle biologique. Les spécimens sont identifiés et conservés quelques années, le temps de la recherche, dans des…