Laboratoire ECOBIO

Écosystèmes, biodiversité, évolution (ECOBIO)

RENNES CEDEX

The ECOBIO laboratory covers all areas of ecology: evolutionary ecology, behavioural ecology, community ecology, functional ecology and landscape ecology. It analyses the dynamics of biodiversity and the functioning of continental ecosystems in the face of global changes (climate, land use) with a view to sustainable development (sober management of natural resources, conservation).

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Culture en milieu gélosé de bactéries ferro-oxydantes lors d'une étude des dynamiques bactériennes à l'échelle microscopique. Ces bactéries issues du milieu souterrain se développent dans des conditions précises en termes de concentrations en fer et oxygène. Dans cette culture, le sulfure de fer noir en bas du tube diffuse vers le haut, et l'oxygène atmosphérique diffuse vers le bas. Dans ce double gradient, l'activité bactérienne entraîne la formation d'oxydes de fer orangés largement visible…

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Formation d'oxydes de fer dans une culture en milieu gélosé de bactéries ferro-oxydantes
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Puce microfluidique utilisée pour visualiser les dynamiques bactériennes à l'échelle microscopique. Le canal central est destiné à l'observation. Les canaux latéraux permettent la diffusion de gaz tels que de l'oxygène ou du dioxyde de carbone dans le canal d'observation. Les bactéries ferro-oxydantes étudiées, issues du milieu souterrain, se développent dans des fractures de roches où se rencontrent des eaux profondes riches en fer et des eaux de surface oxygénées. Les puces microfluidiques…

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Puce microfluidique utilisée pour observer les dynamiques bactériennes à l'échelle microscopique
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Vérification de l'écoulement dans un dispositif microfluidique placé sur un microscope, lors de l'étude de micro-colonies de bactéries fluorescentes. Les bactéries ferro-oxydantes étudiées, issues du milieu souterrain, se développent dans des fractures de roches où se rencontrent des eaux profondes riches en fer et des eaux de surface oxygénées. Les puces microfluidiques permettent de mimer les écoulements et les gradients de concentration en fer et en oxygène de ces environnements. Si l…

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Dispositif pour observer les dynamiques bactériennes à l'échelle microscopique dans une puce microfluidique
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Puce microfluidique au-dessus de l'objectif d'un microscope permettant d'observer les dynamiques bactériennes à l'échelle microscopique. Les bactéries ferro-oxydantes étudiées, issues du milieu souterrain, se développent dans des fractures de roches où se rencontrent des eaux profondes riches en fer et des eaux de surface oxygénées. Les puces microfluidiques permettent de mimer les écoulements et les gradients de concentration en fer et en oxygène de ces environnements. Si l'observation des…

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Puce microfluidique sur un microscope, pour observer les dynamiques bactériennes à l'échelle microscopique
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Observation en direct de la croissance de micro-colonies de bactéries fluorescentes déposées au fond d'un canal microfluidique, lui-même installé sur un microscope permettant de rendre les bactéries fluorescentes. Les bactéries ferro-oxydantes étudiées, issues du milieu souterrain, se développent dans des fractures de roches où se rencontrent des eaux profondes riches en fer et des eaux de surface oxygénées. Les puces microfluidiques permettent de mimer les écoulements et les gradients de…

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Observation en directe de la croissance bactérienne grâce à la microfluidique
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Etude des dynamiques bactériennes à l'échelle microscopique dans une puce microfluidique installée sur un microscope. Les bactéries ferro-oxydantes étudiées, issues du milieu souterrain, se développent dans des fractures de roches où se rencontrent des eaux profondes riches en fer et des eaux de surface oxygénées. Les puces microfluidiques permettent de mimer les écoulements et les gradients de concentration en fer et en oxygène de ces environnements. Si l'observation des bactéries à l'échelle…

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Dispositif pour observer les dynamiques bactériennes à l'échelle microscopique dans une puce microfluidique
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Prélèvement de bactéries pour les introduire dans une puce microfluidique, dans le cadre d'une étude des dynamiques bactériennes à l'échelle microscopique. La fiole contient un milieu de croissance et une atmosphère contrôlée en oxygène et dioxyde de carbone. Les bactéries ferro-oxydantes étudiées, issues du milieu souterrain, se développent dans des fractures de roches où se rencontrent des eaux profondes riches en fer et des eaux de surface oxygénées. Les puces microfluidiques permettent de…

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Culture de bactéries lors d'une étude des dynamiques bactériennes à l'échelle microscopique
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Dispositif microfluidique sous microscope, utilisé pour visualiser la croissance de bactéries dans des conditions mimant celles rencontrées sur le terrain. Les bactéries ferro-oxydantes étudiées, issues du milieu souterrain, se développent dans des fractures de roches où se rencontrent des eaux profondes riches en fer et des eaux de surface oxygénées. Le dispositif permet notamment d'imposer très précisément les variations d'oxygène que subissent ces bactéries au cours de leur développement…

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Dispositif microfluidique sous microscope, pour observer la croissance bactérienne
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Contrôle des conditions de culture lors d'une étude des dynamiques bactériennes à l'échelle microscopique dans une puce microfluidique. Des débitmètres massiques influent sur la composition en gaz dissous et le contrôleur de pression gère la vitesse d'écoulement. Les bactéries ferro-oxydantes étudiées, issues du milieu souterrain, se développent dans des fractures de roches où se rencontrent des eaux profondes riches en fer et des eaux de surface oxygénées. Les puces microfluidiques permettent…

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Dispositif permettant d'observer les dynamiques bactériennes à l'échelle microscopique
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Les bactéries ferro-oxydantes étudiées, issues du milieu souterrain, se développent dans des fractures de roches où se rencontrent des eaux profondes riches en fer et des eaux de surface oxygénées. Les puces microfluidiques permettent de mimer les écoulements et les gradients de concentration en fer et en oxygène de ces environnements. Si l'observation des bactéries à l'échelle microscopique n'est pas nouvelle, son utilisation en conditions contrôlées pour l’étude de leur dynamique de…

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Culture de bactéries lors d'une étude des dynamiques bactériennes à l'échelle microscopique
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Puce microfluidique utilisée dans une étude des dynamiques bactériennes à l'échelle microscopique. Elle est composée de micro-canaux moulés dans un polymère transparent collé sur une lame de microscope. Les bactéries ferro-oxydantes étudiées, issues du milieu souterrain, se développent dans des fractures de roches où se rencontrent des eaux profondes riches en fer et des eaux de surface oxygénées. Les puces microfluidiques permettent de mimer les écoulements et les gradients de concentration en…

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Puce microfluidique utilisée pour observer les dynamiques bactériennes à l'échelle microscopique
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Relevé d'un piège mis en place dans un champ de framboises pour capturer des drosophiles à ailes tachetées, "Drosophila suzukii", à "La cueillette de Thorigné", sur la commune de Thorigné-Fouillard, à l’est de Rennes (35). Ces pièges-bouteilles ont été conçus avec le FabLab de l'université de Rennes Beaulieu, puis fournis en 2022 par les scientifiques à des producteurs de framboises de la France entière, pour qu'ils les installent dans des parcelles cultivées et non cultivées. Attirées par l…

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Relevé d'un piège pour la capture de drosophiles à ailes tachetées dans un champ de framboises à côté de Rennes
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Bouteilles d'élevage de drosophiles à ailes tachetées, "Drosophila suzukii". A la base, il y a du milieu artificiel constitué de levure, d'agar, de sucre et de poudre de carotte dans lequel les larves peuvent se développer. Puis elles creusent des galeries, sortent de la nourriture et montent sur le petit carton blanc pour se transformer en pupes. Enfin, les adultes vont émerger. Cette espèce de mouche invasive et nuisible originaire d'Asie du Sud-Est peut dévaster jusqu’à 80 % de la production…

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Bouteilles d'élevage de drosophiles à ailes tachetées
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Observation des pièges mis en place dans un champ de framboises pour capturer des drosophiles à ailes tachetées, "Drosophila suzukii", à "La cueillette de Thorigné", sur la commune de Thorigné-Fouillard, à l’est de Rennes (35). Ces pièges-bouteilles ont été conçus avec le FabLab de l'université de Rennes Beaulieu, puis fournis en 2022 par les scientifiques à des producteurs de framboises de la France entière, pour qu'ils les installent dans des parcelles cultivées et non cultivées. Attirées par…

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Observation de pièges pour la capture de drosophiles à ailes tachetées dans un champ de framboises à côté de Rennes
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Bain thermostaté permettant la mesure de la température d'entrée en coma de drosophiles à ailes tachetées, "Drosophila suzukii". Un thermoplongeur permet de modifier la température de l'eau dans le bain pour l'augmenter graduellement. A partir d'une certaine température, les drosophiles placées dans des tubes vont rentrer en coma et tomber. Cette température critique maximale (CT max) de la drosophile, ou température d'entrée en coma au chaud, donne une estimation de sa tolérance au chaud…

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Bain thermostaté permettant la mesure de la température d'entrée en coma de drosophiles à ailes tachetées
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Ethanol versé dans des pièges placés dans des composteurs installés sur le campus de Beaulieu à Rennes, afin de déterminer si le compost peut être une ressource pendant l'hiver, pour la drosophile à ailes tachetées, "Drosophila suzukii". Les cônes en dessous des pièges ont un effet entonnoir, ce qui permet de piéger ce qui sort du compost. Deux pièges sont placés dans chaque composteur, ce qui couvre 50 % de la surface du compost, pendant 15 jours par mois sur une année. L'éthanol permet de…

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Ethanol versé dans des pièges placés dans des composteurs afin de déterminer si le compost peut être une ressource pour…
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Relevé d'un piège mis en place dans une haie riche en ronces et en mûres, pour capturer des drosophiles à ailes tachetées, "Drosophila suzukii", à proximité de champs de framboises de "La cueillette de Thorigné", sur la commune de Thorigné-Fouillard, à l’est de Rennes (35). Ces pièges-bouteilles ont été conçus avec le FabLab de l'université de Rennes Beaulieu, puis fournis en 2022 par les scientifiques à des producteurs de framboises de la France entière, pour qu'ils les installent dans des…

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Relevé d'un piège pour des drosophiles à ailes tachetées dans une haie riche en ronces et en mûres à côté de Rennes
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Discussion sur le relevé d'un piège mis en place dans un champ de framboises pour capturer des drosophiles à ailes tachetées, "Drosophila suzukii", à "La cueillette de Thorigné", sur la commune de Thorigné-Fouillard, à l’est de Rennes (35). Ces pièges-bouteilles ont été conçus avec le FabLab de l'université de Rennes Beaulieu, puis fournis en 2022 par les scientifiques à des producteurs de framboises de la France entière, pour qu'ils les installent dans des parcelles cultivées et non cultivées…

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Discussion autour d'un piège pour capturer des drosophiles à ailes tachetées dans un champ de framboises à côté de…
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Mise en place d'une mesure de taux métabolique, c'est-à-dire la quantité de CO2 émise par la respiration, chez la drosophile à ailes tachetées, "Drosophila suzukii". Les mouches sont placées individuellement dans chacun des seize tubes à essai et le respiromètre va mesurer individuellement le taux métabolique de chaque drosophile en temps réel. Plus une drosophile va avoir un métabolisme élevé et plus elle va dégager de CO2. Cette mesure donne une idée de l'adaptation des mouches au cours des…

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Mise en place d'une mesure de taux métabolique chez la drosophile à ailes tachetées
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Piège placé dans un des composteurs installés sur le campus de Beaulieu à Rennes, afin de déterminer si le compost peut être une ressource pendant l'hiver, pour la drosophile à ailes tachetées, "Drosophila suzukii". Les cônes en dessous des pièges ont un effet entonnoir, ce qui permet de piéger ce qui sort du compost. Deux pièges sont placés dans chaque composteur, ce qui couvre 50 % de la surface du compost, pendant 15 jours par mois sur une année. Cette espèce de mouche invasive et nuisible…

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Pièges placés dans des composteurs afin de déterminer si le compost peut être une ressource pour "Drosophila suzukii"
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Framboises dans un champ de "La cueillette de Thorigné", sur la commune de Thorigné-Fouillard, à l’est de Rennes (35). Dans cette exploitation, des pièges ont été installés pour capturer des drosophiles à ailes tachetées, "Drosophila suzukii". Ces pièges ont été conçus avec le FabLab de l'université de Rennes Beaulieu, puis fournis en 2022 par les scientifiques à des producteurs de framboises de la France entière, pour qu'ils les installent dans des parcelles cultivées et non cultivées. Chaque…

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Framboises dans un champ de "La cueillette de Thorigné", sur la commune de Thorigné-Fouillard à l’est de Rennes
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Relevé d'un piège mis en place dans un champ de framboises pour capturer des drosophiles à ailes tachetées, "Drosophila suzukii", à "La cueillette de Thorigné", sur la commune de Thorigné-Fouillard, à l’est de Rennes (35). Ce tube est vissé sur un des pièges-bouteilles conçus avec le FabLab de l'université de Rennes Beaulieu, puis fournis en 2022 par les scientifiques à des producteurs de framboises de la France entière, pour qu'ils les installent dans des parcelles cultivées et non cultivées…

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Relevé d'un piège pour la capture de drosophiles à ailes tachetées dans un champ de framboises à côté de Rennes
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Drosophiles à ailes tachetées, "Drosophila suzukii". Cette espèce de mouche invasive et nuisible originaire d'Asie du Sud-Est peut dévaster jusqu’à 80 % de la production d’un champ de framboises ou de cerises. Alors que les drosophiles pondent habituellement dans les fruits en décomposition, celle-ci dépose ses œufs dans des fruits encore sur pied. Les scientifiques cherchent à mieux comprendre son fonctionnement, notamment son cycle hivernal. Ces travaux visent à fournir de meilleurs outils et…

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Drosophiles à ailes tachetées
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Observation des pièges mis en place dans un champ de framboises pour capturer des drosophiles à ailes tachetées, "Drosophila suzukii", à "La cueillette de Thorigné", sur la commune de Thorigné-Fouillard, à l’est de Rennes (35). Ces pièges-bouteilles ont été conçus avec le FabLab de l'université de Rennes Beaulieu, puis fournis en 2022 par les scientifiques à des producteurs de framboises de la France entière, pour qu'ils les installent dans des parcelles cultivées et non cultivées. Attirées par…

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Observation de pièges pour la capture de drosophiles à ailes tachetées dans un champ de framboises à côté de Rennes
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Bain thermostaté permettant la mesure de la température d'entrée en coma de drosophiles à ailes tachetées, "Drosophila suzukii". Un thermoplongeur permet de modifier la température de l'eau dans le bain pour l'augmenter graduellement. A partir d'une certaine température, les drosophiles placées dans des tubes vont rentrer en coma et tomber. Cette température critique maximale (CT max) de la drosophile, ou température d'entrée en coma au chaud, donne une estimation de sa tolérance au chaud…

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Bain thermostaté permettant la mesure de la température d'entrée en coma de drosophiles à ailes tachetées
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Contrôle de l'état de fonctionnement de la sonde qui mesure la température du compost (dedans, à sa surface et 15 cm au-dessus) dans des composteurs installés sur le campus de Beaulieu à Rennes. Ces composteurs sont utilisés afin de déterminer si le compost peut être une ressource pendant l'hiver, pour la drosophile à ailes tachetées, "Drosophila suzukii". Cette espèce de mouche invasive et nuisible originaire d'Asie du Sud-Est, est connue pour déposer ses œufs dans des fruits encore sur pied,…

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Contrôle de l'état de fonctionnement de la sonde de mesure de la température dans des composteurs sur le campus de…
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Contrôle de l'état d'avancement de la fructification du gui, sur la commune de Thorigné-Fouillard, à l’est de Rennes (35). Ces fruits sont principalement présents à la fin d'automne et en hiver et peuvent servir d'hôtes à la drosophile à ailes tachetées, "Drosophila suzukii" à la fin de la saison des fruits rouges. Les baies du gui lui permettraient de se maintenir d'une année à l'autre, grâce à la capacité de la drosophile à se développer et à se nourrir dans différents fruits, cultivés ou non…

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Contrôle de l'état d'avancement de la fructification du gui, sur la commune de Thorigné-Fouillard, à l’est de Rennes
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Discussion sur le relevé d'un piège mis en place dans un champ de framboises pour capturer des drosophiles à ailes tachetées, "Drosophila suzukii", à "La cueillette de Thorigné", sur la commune de Thorigné-Fouillard, à l’est de Rennes (35). Ces pièges-bouteilles ont été conçus avec le FabLab de l'université de Rennes Beaulieu, puis fournis en 2022 par les scientifiques à des producteurs de framboises de la France entière, pour qu'ils les installent dans des parcelles cultivées et non cultivées…

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Discussion autour d'un piège pour capturer des drosophiles à ailes tachetées dans un champ de framboises à côté de…
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Tube avec de nombreuses drosophiles à ailes tachetées, "Drosophila suzukii" qui sont ensuite disposées individuellement dans les tubes à essai en arrière-plan, pour une mesure de taux métabolique. Le respiromètre va mesurer le taux métabolique, c'est-à-dire la quantité de CO2 émise par la respiration, de chaque drosophile placée dans les petits tubes en temps réel. Plus une drosophile va avoir un métabolisme élevé et plus elle va dégager de CO2. Cette mesure donne une idée de l'adaptation des…

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Tubes avec des drosophiles à ailes tachetées pour une mesure de taux métabolique
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Observation à la loupe binoculaire d'un mâle de drosophile à ailes tachetées, "Drosophila suzukii". Il est issu d'un des échantillons collectés chez un producteur de framboises dans le cadre d'un protocole mis en place en 2022 sur la France entière. Des pièges, conçus avec le FabLab de l'université de Rennes Beaulieu, ont été fournis par les scientifiques à des producteurs pour qu'ils les installent. Chaque mois, le contenu du piège était renvoyé aux scientifiques, puis remplacé par un autre…

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Observation à la loupe binoculaire d'un mâle de drosophile à ailes tachetées
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Framboises dans un champ de "La cueillette de Thorigné", sur la commune de Thorigné-Fouillard, à l’est de Rennes (35). Dans cette exploitation, des pièges ont été installés pour capturer des drosophiles à ailes tachetées, "Drosophila suzukii". Ces pièges ont été conçus avec le FabLab de l'université de Rennes Beaulieu, puis fournis en 2022 par les scientifiques à des producteurs de framboises de la France entière, pour qu'ils les installent dans des parcelles cultivées et non cultivées. Chaque…

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Framboises dans un champ de "La cueillette de Thorigné", sur la commune de Thorigné-Fouillard à l’est de Rennes
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Relevé d'un piège mis en place dans une haie riche en ronces et en mûres, pour capturer des drosophiles à ailes tachetées, "Drosophila suzukii", à proximité de champs de framboises de "La cueillette de Thorigné", sur la commune de Thorigné-Fouillard, à l’est de Rennes (35). Ces pièges-bouteilles ont été conçus avec le FabLab de l'université de Rennes Beaulieu, puis fournis en 2022 par les scientifiques à des producteurs de framboises de la France entière, pour qu'ils les installent dans des…

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Relevé d'un piège pour la drosophile à ailes tachetées dans une haie riche en ronces et en mûres à côté de Rennes
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Observation des pièges mis en place dans un champ de framboises pour capturer des drosophiles à ailes tachetées, "Drosophila suzukii", à "La cueillette de Thorigné", sur la commune de Thorigné-Fouillard, à l’est de Rennes (35). Ces pièges-bouteilles ont été conçus avec le FabLab de l'université de Rennes Beaulieu, puis fournis en 2022 par les scientifiques à des producteurs de framboises de la France entière, pour qu'ils les installent dans des parcelles cultivées et non cultivées. Attirées par…

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Observation de pièges pour la capture de drosophiles à ailes tachetées dans un champ de framboises à côté de Rennes
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Bain thermostaté permettant la mesure de la température d'entrée en coma de drosophiles à ailes tachetées, "Drosophila suzukii". Un thermoplongeur permet de modifier la température de l'eau dans le bain pour l'augmenter graduellement. A partir d'une certaine température, les drosophiles placées dans des tubes vont rentrer en coma et tomber. Cette température critique maximale (CT max) de la drosophile, ou température d'entrée en coma au chaud, donne une estimation de sa tolérance au chaud…

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Bain thermostaté permettant la mesure de la température d'entrée en coma de drosophiles à ailes tachetées
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Relevé d'un piège placé dans un des composteurs installés sur le campus de Beaulieu à Rennes, afin de déterminer si le compost peut être une ressource pendant l'hiver, pour la drosophile à ailes tachetées, "Drosophila suzukii". Les cônes en dessous des pièges ont un effet entonnoir, ce qui permet de piéger ce qui sort du compost. Deux pièges sont placés dans chaque composteur, ce qui couvre 50 % de la surface du compost, pendant 15 jours par mois sur une année. Cette espèce de mouche invasive…

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Relevé d'un piège placé dans un composteur afin de déterminer si le compost peut être une ressource pour "Drosophila…
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Contrôle de l'état d'avancement de la fructification du gui, sur la commune de Thorigné-Fouillard, à l’est de Rennes (35). Ces fruits sont principalement présents à la fin d'automne et en hiver et peuvent servir d'hôtes à la drosophile à ailes tachetées, "Drosophila suzukii" à la fin de la saison des fruits rouges. Les baies du gui lui permettraient de se maintenir d'une année à l'autre, grâce à la capacité de la drosophile à se développer et à se nourrir dans différents fruits, cultivés ou non…

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Contrôle de l'état d'avancement de la fructification du gui, sur la commune de Thorigné-Fouillard, à l’est de Rennes
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Discussion sur le relevé d'un piège mis en place dans un champ de framboises pour capturer des drosophiles à ailes tachetées, "Drosophila suzukii", à "La cueillette de Thorigné", sur la commune de Thorigné-Fouillard, à l’est de Rennes (35). Ces pièges-bouteilles ont été conçus avec le FabLab de l'université de Rennes Beaulieu, puis fournis en 2022 par les scientifiques à des producteurs de framboises de la France entière, pour qu'ils les installent dans des parcelles cultivées et non cultivées…

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Discussion autour d'un piège pour capturer des drosophiles à ailes tachetées dans un champ de framboises à côté de…
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Différents tubes avec des drosophiles à ailes tachetées, "Drosophila suzukii". Cette espèce de mouche invasive et nuisible originaire d'Asie du Sud-Est peut dévaster jusqu’à 80 % de la production d’un champ de framboises ou de cerises. Alors que les drosophiles pondent habituellement dans les fruits en décomposition, celle-ci dépose ses œufs dans des fruits encore sur pied. Les scientifiques cherchent à mieux comprendre son fonctionnement, notamment son cycle hivernal. Ces travaux visent à…

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Différents tubes avec des drosophiles à ailes tachetées, "Drosophila suzukii"

CNRS Images,

Our work is guided by the way scientists question the world around them and we translate their research into images to help people to understand the world better and to awaken their curiosity and wonderment.