Dispositif pour observer les dynamiques bactériennes à l'échelle microscopique dans une puce microfluidique

Vérification de l'écoulement dans un dispositif microfluidique placé sur un microscope, lors de l'étude de micro-colonies de bactéries fluorescentes. Les bactéries ferro-oxydantes étudiées, issues du milieu souterrain, se développent dans des fractures de roches où se rencontrent des eaux profondes riches en fer et des eaux de surface oxygénées. Les puces microfluidiques permettent de mimer les écoulements et les gradients de concentration en fer et en oxygène de ces environnements. Si l'observation des bactéries à l'échelle microscopique n'est pas nouvelle, son utilisation en conditions contrôlées pour l’étude de leur dynamique de croissance est encore peu pratiquée. Ces travaux sont réalisés au sein de la Halle de l’Observatoire des sciences de l'environnement de Rennes (OSERen), qui offre des espaces pour reproduire le fonctionnement des environnements naturels en conditions contrôlées. Son ambition est de favoriser l'interdisciplinarité dans les recherches environnementales, comme ces travaux au croisement de la microbiologie, la géochimie et la physique.