Laboratoire ECOBIO

Écosystèmes, biodiversité, évolution (ECOBIO)

RENNES CEDEX

Le laboratoire ECOBIO couvre l’ensemble des domaines de l’écologie : écologie évolutive, écologie comportementale, écologie des communautés, écologie fonctionnelle et écologie du paysage. Il analyse les dynamiques de la biodiversité et le fonctionnement des écosystèmes continentaux face aux changements globaux (climat, usage des terres) dans une optique de Développement Durable (gestion sobre des ressources naturelles, conservation).

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Tube contenant des drosophiles du cerisier, "Drosophila suzukii". Cette petite mouche asiatique arrivée il y a 10/15 ans en France, est un très grand ravageur des cultures, notamment des petits fruits : cerises, framboises, fraises. Contrairement aux autres drosophiles elles ne s'attaquent pas aux fruits déjà un peu trop mûrs, mais pondent dans des fruits qui commencent à être matures. C'est donc quand le fruit peut être récolté que les larves commencent à sortir. Dans certaines cultures, près…

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Tube contenant des drosophiles du cerisier
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Apport de coccinelles "Cryptolaemus montrouzieri", sur des plantes au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio. Les différents insectes auxiliaires (coccinelles, chrysopes...) apportés dans la serre sont particulièrement intéressants dans le cadre de la lutte biologique puisqu'ils évitent les traitements chimiques pour réguler certains ravageurs (cochenilles, thrips, pucerons...). La serre de collection du laboratoire Ecobio regroupe les différentes collections végétales qui sont…

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Apport de coccinelles sur des plantes au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio
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Carotte de sédiment prélevée en zone humide, dans la vasière de la réserve naturelle nationale de l'estuaire de la Seine, sous le pont de Normandie. La pointe très fine d'une microsonde va être plongée progressivement dans le sédiment (100 micromètres par 100 micromètres) pour effectuer des mesures d'oxygène à différentes profondeurs. Un micromanipulateur piloté par ordinateur permet de faire cette opération très précisément et d'enregistrer les taux d'oxygène à chaque palier. Ce taux d'oxygène…

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Carotte de sédiment prélevée en zone humide
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Acides nucléiques extraits de la vase et stockés dans un congélateur à -80 °C. Chaque échantillon issu de prélèvements réalisés sur le terrain est rangé en boîte, référencée dans une base de données. L'objectif de ces études de microbiologie environnementale est de comprendre le fonctionnement de milieux comme les vases. Les microorganismes qui y pratiquent des réactions pouvant aider à dépolluer sont détectés grâce à leurs acides nucléiques. La transformation des nitrates en diazote …

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Acides nucléiques extraits de la vase et stockés dans un congélateur à -80 °C
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Introduction de drosophiles du cerisier, "Drosophila suzukii", dans une cage d'élevage. Elles vont se disperser pour pondre dans des tubes ouverts contenant un milieu nutritif, composé de sucre et de levure, qui servira de nourriture pour les larves. Cette petite mouche asiatique arrivée il y a 10/15 ans en France, est un très grand ravageur des cultures, notamment des petits fruits : cerises, framboises, fraises. Contrairement aux autres drosophiles elles ne s'attaquent pas aux fruits déjà un…

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Introduction de drosophiles du cerisier dans une cage d'élevage
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Sélection de plantes en vue de prélèvements de jeunes feuilles, ici chez "Spartina versicolor", pour en extraire de l’ADN. "Spartina versicolor" était considérée native des côtes méditerranéennes, mais s’avère être une espèce introduite d’Amérique du Nord (synonyme de "Spartina patens") envahissante. Les scientifiques étudient l’histoire évolutive et les mécanismes tels que la polyploïdie (duplication du génome) à l’origine de la formation de nouvelles espèces envahissantes.

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Sélection de plantes en vue de prélèvements de jeunes feuilles pour en extraire de l’ADN
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Culture de plantes des îles Kerguelen et Crozet (Terres australes et antarctiques françaises) en phytotron froid (4 °C, Centre ECOLEX), en vue d’étudier leur plasticité physiologique et morphologique face à un changement de conditions, ainsi que leur diversité cytogénétique et génétique. Le but du programme de recherches PlantEvol / PlantADAPT soutenu par l’Institut polaire français Paul-Emile Victor est de reconstituer l’évolution et d'évaluer la capacité d’adaptation des espèces de plantes…

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Culture de plantes des îles Kerguelen et Crozet en phytotron froid
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Empotage de plantes bouturées, pour la conservation et la perpétuation des différentes espèces, au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio. Cette serre regroupe les différentes collections végétales qui sont utilisées pour les activités d’enseignement et accueille également des visites de publics variés. Elle est subdivisée en trois cellules de 70 m² représentant chacune un climat spécifique adapté aux plantes de la collection (zone tempérée, zone tropicale, cactées).

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Empotage de plantes bouturées au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio
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Un carabe, la féronie noire, "Carabus intricatus" mis dans un pilulier avec de l'éthanol à 70%. Le carabe est beaucoup utilisé dans le monde de la recherche, c'est un modèle biologique. Les spécimens sont identifiés et conservés quelques années, le temps de la recherche. Ce coléoptère est réparti un peu partout en France pour 60 à 70% des espèces, mais il existe tout de même des espèces endémiques à la région Bretagne et au type de paysage. Certains carabes sont inféodés à des haies, des bois,…

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Un carabe, la féronie noire, mis dans un pilulier avec de l'éthanol à 70%
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Tube contenant des drosophiles du cerisier, "Drosophila suzukii". Les mâles sont visibles ici, ils ont deux petits points noirs au bout des ailes. Cette petite mouche asiatique arrivée il y a 10/15 ans en France, est un très grand ravageur des cultures, notamment des petits fruits : cerises, framboises, fraises. Contrairement aux autres drosophiles elles ne s'attaquent pas aux fruits déjà un peu trop mûrs, mais pondent dans des fruits qui commencent à être matures. C'est donc quand le fruit…

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Tube contenant des drosophiles du cerisier
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Stockage dans un congélateur à -80 °C d'échantillons environnementaux. Chaque échantillon issu de prélèvements réalisés sur le terrain est rangé en boîte, référencée dans une base de données. L'objectif de ces études de microbiologie environnementale est de comprendre le fonctionnement de milieux comme les vases. Les microorganismes qui y pratiquent des réactions pouvant aider à dépolluer sont détectés grâce à leurs acides nucléiques. La transformation des nitrates en diazote (dénitrification)…

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Stockage dans un congélateur à -80 °C d'échantillons environnementaux
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Pointe très fine d'une microsonde plongée dans une carotte de sédiment prélevée en zone humide, dans la vasière de la réserve naturelle nationale de l'estuaire de la Seine, sous le pont de Normandie. La pointe plonge progressivement dans le sédiment (100 micromètres par 100 micromètres) pour effectuer des mesures d'oxygène à différentes profondeurs. Un micromanipulateur piloté par ordinateur permet de faire cette opération très précisément et d'enregistrer les taux d'oxygène à chaque palier. Ce…

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Pointe très fine d'une microsonde plongée dans une carotte de sédiment prélevée en zone humide
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Apport de coccinelles "Cryptolaemus montrouzieri", sur des plantes au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio. Les différents insectes auxiliaires (coccinelles, chrysopes...) apportés dans la serre sont particulièrement intéressants dans le cadre de la lutte biologique puisqu' ils évitent les traitements chimiques pour réguler certains ravageurs (cochenilles, thrips, pucerons...). La serre de collection du laboratoire Ecobio regroupe les différentes collections végétales qui sont…

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Apport de coccinelles sur des plantes au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio
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Carotte de sédiment prélevée en zone humide, dans la vasière de la réserve naturelle nationale de l'estuaire de la Seine, sous le pont de Normandie. La pointe très fine d'une microsonde va être plongée progressivement dans le sédiment (100 micromètres par 100 micromètres) pour effectuer des mesures d'oxygène à différentes profondeurs. Un micromanipulateur piloté par ordinateur permet de faire cette opération très précisément et d'enregistrer les taux d'oxygène à chaque palier. Ce taux d'oxygène…

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Carotte de sédiment prélevée en zone humide
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Echantillons de vase stockés dans un congélateur à -80 °C. Chaque échantillon issu de prélèvements réalisés sur le terrain est rangé en boîte, référencée dans une base de données. L'objectif de ces études de microbiologie environnementale est de comprendre le fonctionnement de milieux comme les vases. Les microorganismes qui y pratiquent des réactions pouvant aider à dépolluer sont détectés grâce à leurs acides nucléiques. La transformation des nitrates en diazote (dénitrification) peut ainsi…

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Echantillons de vase stockés dans un congélateur à -80 °C
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Introduction de drosophiles du cerisier, "Drosophila suzukii", dans une cage d'élevage. Elles vont se disperser pour pondre dans des tubes ouverts contenant un milieu nutritif, composé de sucre et de levure, qui servira de nourriture pour les larves. Cette petite mouche asiatique arrivée il y a 10/15 ans en France, est un très grand ravageur des cultures, notamment des petits fruits : cerises, framboises, fraises. Contrairement aux autres drosophiles elles ne s'attaquent pas aux fruits déjà un…

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Introduction de drosophiles du cerisier dans une cage d'élevage
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Prélèvement de jeunes feuilles de "Spartina versicolor" en vue d’extractions d’ADN. Cette plante était considérée native des côtes méditerranéennes, mais s’avère être une espèce introduite d’Amérique du Nord (synonyme de "Spartina patens") envahissante. Les scientifiques étudient l’histoire évolutive et les mécanismes tels que la polyploïdie (duplication du génome) à l’origine de la formation de nouvelles espèces envahissantes.

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Prélèvement de jeunes feuilles de "Spartina versicolor" en vue d’extractions d’ADN
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Chou de Kerguelen, "Pringlea antiscorbutica R. Br." ("Brassicaceae"), plante endémique de la province phytogéographique des îles subantarctiques de Kerguelen, en culture dans un phytotron froid (4 °C, Centre ECOLEX). Les îles Kerguelen (Terres australes et antarctiques françaises), dans l’océan Indien austral, sont soumises à un changement climatique rapide et intense. Le programme de recherches PlantEvol / PlantADAPT soutenu par l’Institut polaire français Paul-Emile Victor cherche à…

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Chou de Kerguelen plante endémique des îles subantarctiques de Kerguelen, en culture dans un phytotron froid
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Saisie d'un ver de terre qui va être observé à la loupe binoculaire, sous hotte aspirante, à la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1). Ce lombricien a été prélevé par méthode chimique ou physique sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Tous les vers de terre prélevés sont comptés et pesés pour déterminer leur abondance et leur biomasse au m². L'espèce, la sous-espèce ou la variété à laquelle ils appartiennent sont…

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Saisie d'un ver de terre qui va être observé à la loupe binoculaire à la station biologique de Paimpont
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Extraction d'un bloc de sol avec une bêche dans le cadre d'une formation aux protocoles de prélèvements de vers de terre, sur des terrains expérimentaux de la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1), en Ille-et-Vilaine. Les scientifiques de la plateforme EcoBioSoil y forment aux prélèvements de vers de terre, des stagiaires et contractuels qui iront ensuite sur le terrain à travers toute la France pour récolter des échantillons. Les prélèvements s'effectuent selon des protocoles…

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Extraction d'un bloc de sol dans le cadre d'une formation aux protocoles de prélèvements de vers de terre
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Observation d'un ver de terre à la loupe binoculaire, sous hotte aspirante, à la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1). Ce lombricien a été prélevé par méthode chimique ou physique sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Tous les vers de terre prélevés sont comptés et pesés pour déterminer leur abondance et leur biomasse au m². L'espèce, la sous-espèce ou la variété à laquelle ils appartiennent sont aussi identifiées…

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Observation d'un ver de terre à la loupe binoculaire à la station biologique de Paimpont
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Tunnel dans lequel une volontaire passe sous une route pour aller d'une prairie à une autre, sur des terrains expérimentaux de la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1), en Ille-et-Vilaine. Elle emporte un kit de prélèvement de vers de terre. Les scientifiques de la plateforme EcoBioSoil forment aux prélèvements de vers de terre, des stagiaires et contractuels qui iront ensuite sur le terrain à travers toute la France pour récolter des échantillons. Les prélèvements s…

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Tunnel permettant de passer d'une prairie à une autre, station biologique de Paimpont
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Tri manuel de blocs de sol dans le cadre d'une formation aux protocoles de prélèvements de vers de terre, sur des terrains expérimentaux de la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1), en Ille-et-Vilaine. Les scientifiques de la plateforme EcoBioSoil y forment des stagiaires et contractuels qui iront ensuite sur le terrain à travers toute la France pour récolter des échantillons. Les prélèvements s'effectuent selon des protocoles standardisés pour obtenir de nouvelles données de…

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Tri manuel de blocs de sol dans le cadre d'une formation aux protocoles de prélèvements de vers de terre
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Ver de terre, de type anécique, qui va être observé à la loupe binoculaire, sous hotte aspirante, à la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1). Ce lombricien a été prélevé par méthode chimique ou physique sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Tous les vers de terre prélevés sont comptés et pesés pour déterminer leur abondance et leur biomasse au m². L'espèce, la sous-espèce ou la variété à laquelle ils appartiennent…

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Ver de terre de type anécique qui va être observé à la loupe binoculaire à la station biologique de Paimpont
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Extraction et tri de blocs de sol dans le cadre d'une formation aux protocoles de prélèvements de vers de terre, sur des terrains expérimentaux de la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1), en Ille-et-Vilaine. Les scientifiques de la plateforme EcoBioSoil y forment des stagiaires et contractuels qui iront ensuite sur le terrain à travers toute la France pour récolter des échantillons. Les prélèvements s'effectuent selon des protocoles standardisés pour obtenir de nouvelles…

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Extraction et tri de blocs de sol dans le cadre d'une formation aux protocoles de prélèvements de vers de terre
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Tri manuel de blocs de sol dans le cadre d'une formation aux protocoles de prélèvements de vers de terre, sur des terrains expérimentaux de la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1), en Ille-et-Vilaine. Les scientifiques de la plateforme EcoBioSoil y forment des stagiaires et contractuels qui iront ensuite sur le terrain à travers toute la France pour récolter des échantillons. Les prélèvements s'effectuent selon des protocoles standardisés pour obtenir de nouvelles données de…

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Tri manuel de blocs de sol dans le cadre d'une formation aux protocoles de prélèvements de vers de terre
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Ver de terre, de type anécique, avec une tête foncée et une queue claire, qui va être observé à la loupe binoculaire à la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1). Ce lombricien a été prélevé par méthode chimique ou physique sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Tous les vers de terre prélevés sont comptés et pesés pour déterminer leur abondance et leur biomasse au m². L'espèce, la sous-espèce ou la variété à laquelle…

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Ver de terre, de type anécique, avec une tête foncée et une queue claire, qui va être observé à la loupe binoculaire
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Prise en photo de vers de terre vivants extraits du sol dans le cadre d'une formation aux protocoles de prélèvements, sur des terrains expérimentaux de la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1), en Ille-et-Vilaine. Les photos prises sur le terrain par la suite par les différents observateurs lors des prélèvements réels, seront envoyées à l'Observatoire participatif des vers de terre (OPVT) pour améliorer l'identification des spécimens conservés dans l'alcool envoyés par la…

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Prise en photo de vers de terre vivants dans le cadre d'une formation aux protocoles de prélèvements
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Réception et vérification des échantillons de vers de terre envoyés par des partenaires volontaires à l’Observatoire Participatif des Vers de Terre (OPVT). Les prélèvements s'effectuent selon des protocoles standardisés pour obtenir de nouvelles données de biodiversité lombricienne dans différentes occupations et modes de gestion des sols. EcoBioSoil est une plateforme collaborative du laboratoire Ecobio qui propose à la fois des protocoles participatifs d'observation de la biodiversité…

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Réception et vérification des échantillons de vers de terre envoyés par des partenaires à l’OPVT
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Bouteille contenant de l'éthanol dans laquelle sont piégés les insectes volants rentrés dans une tente Malaise, sur un terrain boisé de la station biologique de Paimpont, en Ille-et-Vilaine, en région Bretagne. Cette tente est assez ouverte, avec une paroi en toile au milieu que les insectes ne peuvent traverser. Ils montent donc au travers d'un trou pour être piégés et recueillis dans cette bouteille. Des prélèvements de ces insectes vont être effectués une fois par semaine pendant 6 ans, dans…

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Bouteille contenant de l'éthanol dans laquelle sont piégés les insectes volants à la station biologique de Paimpont
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Arrosage d'1 m² de terrain, délimité par une grille, avec une solution formolée pour faire remonter les vers de terre à la surface, dans le cadre d'un échantillonnage sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Cette extraction chimique est couplée ensuite à une phase d'extraction physique ou tri manuel. Tous les vers de terre prélevés dans ce mètre carré sont mis dans un pilulier pour les identifier ensuite à la station biologique de…

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Arrosage d'1 m² de terrain avec une solution formolée pour faire remonter les vers de terre à la surface
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Prélèvement d'un lombricien dans le cadre d'un échantillonnage de vers de terre, sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Une solution formolée a été épandue sur 1 m² de terrain délimité par une grille, pour faire remonter les vers de terre à la surface. Cette extraction chimique est couplée ensuite à une phase d'extraction physique ou tri manuel. Tous les vers de terre prélevés dans ce mètre carré sont mis dans un pilulier pour les…

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Prélèvement d'un lombricien dans le cadre d'un échantillonnage, sur le dispositif expérimental EFELE
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Crotte de gorille des plaines de l’Ouest, "Gorilla gorilla gorilla", collectée au Congo et conservée au sec, sur laquelle un minuscule prélèvement est effectué pour analyses. Cet échantillon fait partie d'une collection de plus de 1700 crottes de gorilles collectées depuis 2000 et conservées au laboratoire EcoBio. Les gorilles sont des animaux frugivores et herbivores. Leurs crottes contiennent donc de nombreux fragments de végétaux et quelques cellules épithéliales du gorille. L’ADN des…

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Prélèvement sur une crotte de gorille collectée au Congo conservée au sec
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Mise en sachet de 3 cuillères de prélèvement de sol effectué sur un terrain boisé de la station biologique de Paimpont, en Ille-et-Vilaine, en région Bretagne. Des extractions d'ADN seront effectuées sur cet échantillon pour déterminer par analyse génétique les espèces présentes dans le sol. Ces prélèvements sont effectués à chaque coin du périmètre, un carré de 100 x 100 m, dans le cadre du projet ERC Synergy Lifeplan. L'objectif de ce projet est d'échantillonner la biodiversité dans 120…

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Mise en sachet de 3 cuillères de prélèvement de sol effectué à la station biologique de Paimpont
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Image d'un sanglier réalisée par une caméra piège photographique qui se déclenche au moindre mouvement, sur un terrain boisé de la station biologique de Paimpont, en Ille-et-Vilaine, en région Bretagne. Ces clichés sont effectués pour déterminer les espèces présentes dans le périmètre dans le cadre du projet ERC Synergy Lifeplan. L'objectif de ce projet est d'échantillonner la biodiversité dans 120 stations de terrain dans le monde entier par différents moyens : tentes Malaise, caméras,…

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Image d'un sanglier réalisée par une caméra piège photographique à la station biologique de Paimpont
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Lombricien de type anécique, avec une tête foncée et une queue claire, placé dans un pilulier dans le cadre d'un échantillonnage de vers de terre sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Une solution formolée a été épandue sur 1 m² de terrain délimité par une grille, pour faire remonter les vers de terre à la surface. Cette extraction chimique est couplée ensuite à une phase d'extraction physique ou tri manuel. Tous les vers de terre…

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Lombricien placé dans un pilulier dans le cadre d'un échantillonnage de vers de terre
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Vérification de la bonne installation d'une tente Malaise sur un terrain boisé de la station biologique de Paimpont, en Ille-et-Vilaine, en région Bretagne. Ce piège est assez ouvert, avec une paroi en toile au milieu que les insectes ne peuvent traverser. Ils montent donc au travers d'un trou pour être piégés et recueillis dans une bouteille contenant de l'éthanol. Des prélèvements d'insectes vont être effectués une fois par semaine pendant 6 ans, dans le cadre du projet ERC Synergy Lifeplan…

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Vérification de la bonne installation d'une tente Malaise à la station biologique de Paimpont
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Relevé sur une fiche de notes des propriétés de la parcelle (état de surface, végétation, météo…) et des vers de terre qui commencent à remonter à la surface après un arrosage avec une solution formolée, sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Cette feuille sert de "backup" en complément et en cas de perte du pilulier ou de son code. Une solution formolée a été épandue sur 1 m² de terrain délimité par une grille, pour faire remonter…

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Relevé sur une fiche de notes des propriétés de la parcelle et des vers de terre qui commencent à remonter à la surface
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Échantillons de crottes de gorille des plaines de l’Ouest, "Gorilla gorilla gorilla", collectées au Congo, conservées au sec et congelées par -80 °C. Ils font partie d'une collection de plus de 1700 crottes de gorilles collectées depuis 2000 et conservées au laboratoire EcoBio. L’ADN des cellules intestinales des gorilles présent dans les crottes est extrait puis amplifié. Les fragments d’ADN amplifiés permettent de déterminer un code barre génétique unique pour chaque individu suivi. Parmi ces…

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Échantillons de crottes de gorille collectées au Congo et conservés au sec

CNRS Images,

Nous mettons en images les recherches scientifiques pour contribuer à une meilleure compréhension du monde, éveiller la curiosité et susciter l'émerveillement de tous.