Frédéric MALIGNE

Transfert de jeunes plantes de luzerne tronquée, "Medicago truncatula", en conditions stériles. Le transfert est nécessaire pour passer les plantes d'un milieu de croissance (après germination) vers un milieu et un dispositif adaptés pour l'inoculation par les bactéries rhizobia du sol. Ce nouveau milieu est aussi adapté aux observations en microscopie suivant l'inoculation.

Réalisation d'un clonage par la méthode golden gate, ou assemblage de fragments d'ADN obtenus après lyse de la bactérie "Escherichia coli". Cette méthode permet d'assembler facilement plusieurs fragments d'ADN (gènes, régions régulatrices...) afin de tester leur rôle dans des plantes transgéniques.

Réalisation d'une amplification d'ADN génomique par la technique de PCR (Polymerase chain reaction). Le but est de cloner des gènes de plante pour en étudier la fonction et le profil d'expression.

Préparation de lames pour l'observation microscopique de racines de luzerne tronquée, "Medicago truncatula", colonisées par la bactérie symbiotique "Sinorhizobium meliloti". Les cercles marquent l'endroit précis où les coupes de racines ont été placées sur la lame.

Transformation racinaire de luzerne tronquée, "Medicago truncatula", cultivée in vitro. Cette plante légumineuse interagit avec les bactéries rhizobia du sol. Ces interactions mènent à la formation de nodules racinaires qui hébergent les bactéries, et permettent à la plante d’acquérir l'azote, un nutriment essentiel pour leur croissance. En agriculture, cela représente un intérêt particulier pour réduire les apports d'engrais azotés.

Réalisation d'un clonage par la méthode golden gate, ou assemblage de fragments d'ADN. Cette méthode permet d'assembler facilement plusieurs fragments d'ADN (gènes, régions régulatrices...) afin de tester leur rôle dans des plantes transgéniques.

Transfert de jeunes plantes de luzerne tronquée, "Medicago truncatula", en conditions stériles. Le transfert est nécessaire pour passer les plantes d'un milieu de croissance (après germination) vers un milieu et un dispositif adaptés pour l'inoculation par les bactéries rhizobia du sol. Ce nouveau milieu est aussi adapté aux observations en microscopie suivant l'inoculation.

Observation de la pousse de bactéries "Escherichia coli" portant un ADN introduit par électroporation. Chaque numéro sur la boîte de Petri correspond à un clone, c'est-à-dire une bactérie transformée avec un ADN introduit dans son génome.

Réalisation d'une amplification d'ADN génomique par la technique de PCR (réaction en chaîne par polymérisation). Le but est de cloner des gènes de plante pour en étudier la fonction et le profil d'expression. Dans ce but, une enzyme Taq polymérase est utilisée. Elle est purifiée à partir de bactéries et est conservée à -20 °C. Le temps de la manipulation, elle doit donc être maintenue sur glace.

Réalisation d'une amplification d'ADN génomique par la technique de PCR (Polymerase chain reaction). Le but est de cloner des gènes de plante pour en étudier la fonction et le profil d'expression.

Racines de luzerne tronquée, "Medicago truncatula", colonisées par des bactéries du sol collectivement appelées rhizobia. Ici, les bactéries sont visualisées en bleu suite à une réaction histochimique, qui révèle l'activité d'une enzyme bactérienne (β galactosidase).

Réalisation d'un clonage par la méthode golden gate, ou assemblage de fragments d'ADN. Cette méthode permet d'assembler facilement plusieurs fragments d'ADN (gènes, régions régulatrices...) afin de tester leur rôle dans des plantes transgéniques.

Préparation d'un dispositif de culture spécifique pour la microscopie in vivo, les racines ont été recouvertes d'un peu d'eau et un film est placé dessus. Les jeunes plantes de luzerne tronquée, "Medicago truncatula", ont été transférées en conditions stériles et disposées sur un nouveau milieu dans une boîte carrée. Le transfert est nécessaire pour passer les plantes d'un milieu de croissance (après germination) vers un milieu et un dispositif adaptés pour l'inoculation par les bactéries…

Transformation racinaire de luzerne tronquée, "Medicago truncatula", cultivée in vitro. Cette plante légumineuse interagit avec les bactéries rhizobia du sol. Ces interactions mènent à la formation de nodules racinaires qui hébergent les bactéries, et permettent à la plante d’acquérir l'azote, un nutriment essentiel pour leur croissance. En agriculture, cela représente un intérêt particulier pour réduire les apports d'engrais azotés.

Réalisation d'une amplification d'ADN génomique par la technique de PCR (Polymerase chain reaction). Le but est de cloner des gènes de plante pour en étudier la fonction et le profil d'expression.

Prélèvement de disques foliaires de "Nicotiana benthamiana" après infiltration par des bactéries appelées "Agrobacterium tumefaciens". Ces bactéries, utilisées comme outils de transfert de matériel génétique, permettent l'étude de l'expression de gènes d'intérêt dans les cellules végétales.

Observation de l'ADN obtenu après lyse de la bactérie "Escherichia coli".

Préparation d'un dispositif de culture spécifique pour la microscopie in vivo. Des jeunes plantes de luzerne tronquée, "Medicago truncatula" ont été transférées dedans. Les racines ont été recouvertes d'un peu d'eau et d'un film. Ici, le geste correspond à l'élimination du surplus d'eau de la boîte. Ce milieu est adapté pour l'inoculation par les bactéries rhizobia du sol et les observations en microscopie suivant cette inoculation.

Transformation racinaire de luzerne tronquée, "Medicago truncatula", cultivée in vitro. Cette plante légumineuse interagit avec les bactéries rhizobia du sol. Ces interactions mènent à la formation de nodules racinaires qui hébergent les bactéries, et permettent à la plante d’acquérir l'azote, un nutriment essentiel pour leur croissance. En agriculture, cela représente un intérêt particulier pour réduire les apports d'engrais azotés.

Réalisation d'une amplification d'ADN génomique par la technique de PCR (réaction en chaîne par polymérisation). Le but est de cloner des gènes de plante pour en étudier la fonction et le profil d'expression.

Prélèvement de disques foliaires de "Nicotiana benthamiana" après infiltration par des bactéries appelées "Agrobacterium tumefaciens". Ces bactéries, utilisées comme outils de transfert de matériel génétique, permettent l'étude de l'expression de gènes d'intérêt dans les cellules végétales.

Réalisation d'un clonage par la méthode golden gate, ou assemblage de fragments d'ADN obtenus après lyse de la bactérie "Escherichia coli". Cette méthode permet d'assembler facilement plusieurs fragments d'ADN (gènes, régions régulatrices...) afin de tester leur rôle dans des plantes transgéniques.

Réalisation d'une amplification d'ADN génomique par la technique de PCR (réaction en chaîne par polymérisation). Le but est de cloner des gènes de plante pour en étudier la fonction et le profil d'expression.

Observation microscopique de coupes de racines de luzerne tronquée, "Medicago truncatula" colonisées par la bactérie symbiotique "Sinorhizobium meliloti". Il s'agit ici d'observer les étapes initiales de la colonisation racinaires des plantes, qui se fait à partir des poils absorbants des racines.

Transformation racinaire de luzerne tronquée, "Medicago truncatula", cultivée in vitro. Cette plante légumineuse interagit avec les bactéries rhizobia du sol. Ces interactions mènent à la formation de nodules racinaires qui hébergent les bactéries, et permettent à la plante d’acquérir l'azote, un nutriment essentiel pour leur croissance. En agriculture, cela représente un intérêt particulier pour réduire les apports d'engrais azotés.

Symptômes de nervation noire sur des plants de chou-fleur. L'agent responsable de la nervation noire est la bactérie phytopathogène "Xanthomonas campestris pv. campestris". Il s'agit de la bactériose des crucifères la plus importante au niveau mondial. Elle infecte des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries phytopathogènes à leurs hôtes. L'objectif à…

Prélèvement d'une colonie bactérienne issue du microbiote d'arabette des dames, "Arabidopsis thaliana", sur un milieu gélosé en conditions stériles. Cette colonie bactérienne sera incorporée à la collection de souches bactériennes représentatives du microbiote foliaire des populations naturelles d'"Arabidopsis thaliana" dans l'ouest de la région Occitanie. Après identification de son affiliation taxonomique, cette souche pourrait être caractérisée au niveau de son génome et de son effet sur la…

Caractérisation des communautés végétales associées à l'espèce modèle arabette des dames, "Arabidopsis thaliana". Au cours de leur cycle de vie, les plantes interagissent avec plusieurs plantes voisines. Afin d'identifier les mécanismes moléculaires impliqués dans les interactions entre plantes, un projet visant à identifier chez "Arabidopsis thaliana" les gènes associés à la diversité des communautés végétales et/ou à la présence d'autres espèces végétales a été mis en place dans la région…

Prélèvement d'un échantillon de feuille de "Nicotiana benthamiana" pour son observation au microscope confocal en vue d'une expérience de FRET-FLIM. Le FRET-FLIM est la combinaison du transfert d’énergie par résonance Förster (FRET) à de la microscopie d'imagerie à durée de vie par fluorescence (FLIM). La durée de vie de fluorescence d'un fluorophore (FLT) est un paramètre qui peut mettre en évidence des différences dans l'environnement entourant la protéine qui y est accrochée. Parmi ces…

Prélèvement d'hydathodes de chou-fleur infectés par la bactérie "Xanthomonas". La bactérie "Xanthomonas campestris pv. campestris" est l'agent responsable de la nervation noire chez des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Il s'agit de la bactériose des crucifères la plus importante au niveau mondial. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries phytopathogènes à leurs hôtes. L'objectif à long…

Infiltration à l’aide d’une seringue, d'une culture liquide d'"Agrobacterium tumefaciens" dans les cellules de feuilles de tabac "Nicotiana benthamiana". "A. tumefaciens" est une bactérie du sol parcouru par les racines de plantes. Elle est utilisée comme un outil de transfert du matériel génétique, c'est-à-dire qu'elle peut transférer dans la cellule végétale un fragment d’ADN défini. Pour ce faire, les scientifiques introduisent au préalable l'ADN qui code la protéine qu'ils souhaitent…

Infection de plants de chou-fleur par la bactérie "Xanthomonas campestris pv. campestris". Une suspension bactérienne est poussée à l'intérieur de la feuille. Cette bactérie phytopathogène est responsable de la nervation noire chez des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Cette nervation noire est une maladie majeure des crucifères au niveau mondial. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries…

Prélèvement de surnageants lors de l'extraction d'ADN pour une analyse métagénomique. L'objectif de cette analyse est de déterminer la diversité et la composition des communautés bactériennes présentes dans des échantillons de sol. Ils proviennent de 160 populations naturelles d'arabette localisées dans l'ouest de la région Midi-Pyrénées. Le microbiote présent dans le sol est crucial pour la santé des plantes, à la fois pour la croissance et la survie des plantes. L'objectif de ce projet est d…

Pot dans lequel une plante d'arabette des dames, "Arabidopsis thaliana", est mise en compétition avec du pâturin annuel, "Poa. annua". Les scientifiques cherchent à mieux comprendre la réponse d'"Arabidopsis thaliana" à la compétition. Il s'agit plus exactement d’identifier les bases génétiques de l'adaptation d'"Arabidopsis thaliana", afin de déterminer sa capacité à répondre aux conditions de compétition.

Gouttes de guttation à la marge de feuilles d'arabette des dames, "Arabidopsis thaliana". La guttation est l'exsudation de sève sous forme de gouttes au niveau des feuilles de végétaux. Ce processus biologique se produit au niveau d'organes présents à la marge des feuilles appelés "hydathodes" quand trop d'eau s'accumule dans la feuille. Les hydathodes sont aussi les points d’entrée majeurs pour la bactérie phytopatogène "Xanthomonas". En d'autres termes, c'est à ce niveau que l'infection s…

Préparation de cultures bactériennes pour étalement à l'aide d'un spiraleur. Ces bactéries "Ralstonia solanacearum" proviennent d'une plante d'"Arabidopsis thaliana" où elles ont été préalablement inoculées. Cette bactérie phytopathogène colonise la plante hôte et cause son flétrissement irréversible. Ici, les bactéries récupérées par écrasement de la plante infectée sont étalées sur une boîte de culture à l'aide d'un appareil, le spiraleur, afin de pouvoir quantifier le nombre de bactéries…

Infection par trempage des hydathodes de plants de chou-fleur par la bactérie "Xanthomonas". La bactérie "Xanthomonas campestris pv. campestris" est l'agent responsable de la nervation noire chez des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Il s'agit de la bactériose des crucifères la plus importante au niveau mondial. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries phytopathogènes à leurs hôtes. L…

Coloration au Rouge Ponceau des protéines totales extraites d'un plant de tabac. Cette manipulation a lieu après le transfert des protéines d'un gel d'acrylamide vers une membrane de nitrocellulose. Elle permet de contrôler la quantité de protéines déposées sur le gel et présentes sur la membrane. Ici, la membrane est incubé avec le colorant.

Infection d'un plant de chou-fleur par la bactérie "Xanthomonas campestris pv. campestris". Cette bactérie phytopathogène est responsable de la nervation noire chez des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Cette nervation noire est une maladie majeure des crucifères au niveau mondial. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries phytopathogènes à leurs hôtes. L'objectif à long terme est de…