Frédéric MALIGNE

Préparation d'un dispositif de culture spécifique pour la microscopie in vivo, les racines ont été recouvertes d'un peu d'eau et un film est placé dessus. Les jeunes plantes de luzerne tronquée, "Medicago truncatula", ont été transférées en conditions stériles et disposées sur un nouveau milieu dans une boîte carrée. Le transfert est nécessaire pour passer les plantes d'un milieu de croissance (après germination) vers un milieu et un dispositif adaptés pour l'inoculation par les bactéries…

Transformation racinaire de luzerne tronquée, "Medicago truncatula", cultivée in vitro. Cette plante légumineuse interagit avec les bactéries rhizobia du sol. Ces interactions mènent à la formation de nodules racinaires qui hébergent les bactéries, et permettent à la plante d’acquérir l'azote, un nutriment essentiel pour leur croissance. En agriculture, cela représente un intérêt particulier pour réduire les apports d'engrais azotés.

Réalisation d'une amplification d'ADN génomique par la technique de PCR (Polymerase chain reaction). Le but est de cloner des gènes de plante pour en étudier la fonction et le profil d'expression.

Prélèvement de disques foliaires de "Nicotiana benthamiana" après infiltration par des bactéries appelées "Agrobacterium tumefaciens". Ces bactéries, utilisées comme outils de transfert de matériel génétique, permettent l'étude de l'expression de gènes d'intérêt dans les cellules végétales.

Observation de l'ADN obtenu après lyse de la bactérie "Escherichia coli".

Préparation d'un dispositif de culture spécifique pour la microscopie in vivo. Des jeunes plantes de luzerne tronquée, "Medicago truncatula" ont été transférées dedans. Les racines ont été recouvertes d'un peu d'eau et d'un film. Ici, le geste correspond à l'élimination du surplus d'eau de la boîte. Ce milieu est adapté pour l'inoculation par les bactéries rhizobia du sol et les observations en microscopie suivant cette inoculation.

Transformation racinaire de luzerne tronquée, "Medicago truncatula", cultivée in vitro. Cette plante légumineuse interagit avec les bactéries rhizobia du sol. Ces interactions mènent à la formation de nodules racinaires qui hébergent les bactéries, et permettent à la plante d’acquérir l'azote, un nutriment essentiel pour leur croissance. En agriculture, cela représente un intérêt particulier pour réduire les apports d'engrais azotés.

Réalisation d'une amplification d'ADN génomique par la technique de PCR (Polymerase chain reaction). Le but est de cloner des gènes de plante pour en étudier la fonction et le profil d'expression.

Prélèvement de disques foliaires de "Nicotiana benthamiana" après infiltration par des bactéries appelées "Agrobacterium tumefaciens". Ces bactéries, utilisées comme outils de transfert de matériel génétique, permettent l'étude de l'expression de gènes d'intérêt dans les cellules végétales.

Réalisation d'un clonage par la méthode golden gate, ou assemblage de fragments d'ADN obtenus après lyse de la bactérie "Escherichia coli". Cette méthode permet d'assembler facilement plusieurs fragments d'ADN (gènes, régions régulatrices...) afin de tester leur rôle dans des plantes transgéniques.

Réalisation d'une amplification d'ADN génomique par la technique de PCR (Polymerase chain reaction). Le but est de cloner des gènes de plante pour en étudier la fonction et le profil d'expression.

Observation microscopique de coupes de racines de luzerne tronquée, "Medicago truncatula" colonisées par la bactérie symbiotique "Sinorhizobium meliloti". Il s'agit ici d'observer les étapes initiales de la colonisation racinaires des plantes, qui se fait à partir des poils absorbants des racines.

Transformation racinaire de luzerne tronquée, "Medicago truncatula", cultivée in vitro. Cette plante légumineuse interagit avec les bactéries rhizobia du sol. Ces interactions mènent à la formation de nodules racinaires qui hébergent les bactéries, et permettent à la plante d’acquérir l'azote, un nutriment essentiel pour leur croissance. En agriculture, cela représente un intérêt particulier pour réduire les apports d'engrais azotés.

Réalisation d'une amplification d'ADN génomique par la technique de PCR (Polymerase chain reaction). Le but est de cloner des gènes de plante pour en étudier la fonction et le profil d'expression.

Transfert de jeunes plantes de luzerne tronquée, "Medicago truncatula", en conditions stériles. Le transfert est nécessaire pour passer les plantes d'un milieu de croissance (après germination) vers un milieu et un dispositif adaptés pour l'inoculation par les bactéries rhizobia du sol. Ce nouveau milieu est aussi adapté aux observations en microscopie suivant l'inoculation.

Réalisation d'un clonage par la méthode golden gate, ou assemblage de fragments d'ADN obtenus après lyse de la bactérie "Escherichia coli". Cette méthode permet d'assembler facilement plusieurs fragments d'ADN (gènes, régions régulatrices...) afin de tester leur rôle dans des plantes transgéniques.

Réalisation d'une amplification d'ADN génomique par la technique de PCR (Polymerase chain reaction). Le but est de cloner des gènes de plante pour en étudier la fonction et le profil d'expression.

Préparation de lames pour l'observation microscopique de racines de luzerne tronquée, "Medicago truncatula", colonisées par la bactérie symbiotique "Sinorhizobium meliloti". Les cercles marquent l'endroit précis où les coupes de racines ont été placées sur la lame.

Transformation racinaire de luzerne tronquée, "Medicago truncatula", cultivée in vitro. Cette plante légumineuse interagit avec les bactéries rhizobia du sol. Ces interactions mènent à la formation de nodules racinaires qui hébergent les bactéries, et permettent à la plante d’acquérir l'azote, un nutriment essentiel pour leur croissance. En agriculture, cela représente un intérêt particulier pour réduire les apports d'engrais azotés.

Réalisation d'un clonage par la méthode golden gate, ou assemblage de fragments d'ADN. Cette méthode permet d'assembler facilement plusieurs fragments d'ADN (gènes, régions régulatrices...) afin de tester leur rôle dans des plantes transgéniques.

Transfert de jeunes plantes de luzerne tronquée, "Medicago truncatula", en conditions stériles. Le transfert est nécessaire pour passer les plantes d'un milieu de croissance (après germination) vers un milieu et un dispositif adaptés pour l'inoculation par les bactéries rhizobia du sol. Ce nouveau milieu est aussi adapté aux observations en microscopie suivant l'inoculation.

Observation de la pousse de bactéries "Escherichia coli" portant un ADN introduit par électroporation. Chaque numéro sur la boîte de Petri correspond à un clone, c'est-à-dire une bactérie transformée avec un ADN introduit dans son génome.

Réalisation d'une amplification d'ADN génomique par la technique de PCR (Polymerase chain reaction). Le but est de cloner des gènes de plante pour en étudier la fonction et le profil d'expression. Pour cela, une enzyme Taq polymérase est utilisée. Elle est purifiée à partir de bactéries et est conservée à -20 °C. Le temps de la manipulation, elle doit donc être maintenue sur de la glace.

Réalisation d'une amplification d'ADN génomique par la technique de PCR (Polymerase chain reaction). Le but est de cloner des gènes de plante pour en étudier la fonction et le profil d'expression.

Racines de luzerne tronquée, "Medicago truncatula", colonisées par des bactéries du sol collectivement appelées rhizobia. Ici, les bactéries sont visualisées en bleu suite à une réaction histochimique, qui révèle l'activité d'une enzyme bactérienne (β galactosidase).

Infection d'un plant de chou-fleur par la bactérie "Xanthomonas campestris pv. campestris". Cette bactérie phytopathogène est responsable de la nervation noire chez des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Cette nervation noire est une maladie majeure des crucifères au niveau mondial. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries phytopathogènes à leurs hôtes. L'objectif à long terme est de…

Centrifugation d'échantillons de sol lors de l'extraction de l'ADN pour une analyse métagénomique. L'objectif de cette analyse est de déterminer la diversité et la composition des communautés bactériennes présentes dans des échantillons de sol. Ils proviennent de 160 populations naturelles d'arabette localisées dans l'ouest de la région Midi-Pyrénées. Le microbiote présent dans le sol est crucial pour la santé des plantes, à la fois pour la croissance et la survie des plantes. L'objectif de ce…

Plante d'arabette des dames, "Arabidopsis thaliana", ayant poussé en milieu naturel. Cette plante est considérée comme un modèle pour la recherche en biologie et en génétique végétale car son génome a été entièrement séquencé.

Prélèvement d'un échantillon de feuille de tabac "Nicotiana benthamiana" pour son observation au microscope confocal en vue d'une expérience de FRET-FLIM. Le FRET-FLIM est la combinaison du transfert d’énergie par résonance Förster (FRET) à de la microscopie d'imagerie à durée de vie par fluorescence (FLIM). La durée de vie de fluorescence d'un fluorophore (FLT) est un paramètre qui peut mettre en évidence des différences dans l'environnement entourant la protéine qui y est accrochée. Parmi ces…

Prélèvement d'hydathodes de chou-fleur infectés par la bactérie "Xanthomonas". La bactérie "Xanthomonas campestris pv. campestris" est l'agent responsable de la nervation noire chez des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Il s'agit de la bactériose des crucifères la plus importante au niveau mondial. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries phytopathogènes à leurs hôtes. L'objectif à long…

Observation de la bactérie "Agrobacterium tumefaciens" après culture sur milieu gélosé et en milieu liquide. Pour assurer la conservation des souches bactériennes étudiées, les bactéries sont stockées à l’état latent dans un congélateur à -80 °C, en présence de glycérol. Il est possible de réactiver leur croissance en les transférant sur une boîte de Petri contenant le milieu de culture gélosé adapté. Chaque bactérie se multiplie pour former une colonie bactérienne qui est ensuite transférée…

Observation des symptômes de maladie causés par la bactérie "Xanthomonas" chez le chou-fleur. La bactérie "Xanthomonas campestris pv. campestris" est l'agent responsable de la nervation noire chez des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Cette nervation noire est une maladie majeure des crucifères au niveau mondial. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries phytopathogènes à leurs hôtes. L…

Gel d'acrylamide placé dans un tampon de transfert. Il s'agit de la première étape du transfert de protéines d'un plant de tabac, "Nicotiana benthamiana", du gel d'acrylamide vers la membrane de nitrocellulose. Le plant de tabac sert "d'usine" à fabriquer les protéines d'intérêt. Les scientifiques étudient ainsi les interactions plantes-microorganismes, au niveau protéique.

Observation de symptômes de nervation noire sur des plants de chou-fleur. L'agent responsable de la nervation noire est la bactérie phytopathogène "Xanthomonas campestris pv. campestris". Elle infecte des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Il s'agit de la bactériose des crucifères la plus importante au niveau mondial. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries phytopathogènes à leurs hôtes…

Arrosages de plants d'arabette des dames, "Arabidopsis thaliana", mis en compétition avec du pâturin annuel, "Poa annua" en conditions contrôlées de chambre de culture. Au cours de leur cycle de vie, les plantes interagissent avec plusieurs plantes voisines. Afin d'identifier les mécanismes moléculaires impliqués dans les interactions entre plantes, un projet visant à identifier les gènes associés à la réponse d'"Arabidopsis thaliana" à la présence d'une espèce compétitrice a été mis en place…

Récolte de gouttes de guttation à la marge de feuilles d'arabette des dames, "Arabidopsis thaliana". La guttation est l'exsudation de sève sous forme de gouttes au niveau des feuilles de végétaux. Ce processus biologique se produit au niveau d'organes présents à la marge des feuilles appelés "hydathodes" quand trop d'eau s'accumule dans la feuille. Les hydathodes sont aussi les points d’entrée majeurs pour la bactérie phytopatogène "Xanthomonas". En d'autres termes, c'est à ce niveau que l…

Observation de phénotypes d’auto-immunité (mort cellulaire) chez des plantules d’arabette des dames, "Arabidopsis thaliana". La mort cellulaire est une réponse immunitaire mise en place chez les plantes pour contrer le développement des pathogènes dans les tissus. Elle est mise en place suite à l’activation de récepteurs immunitaires intracellulaires. Pour étudier la fonction de ces récepteurs, il est possible de contrôler leur activation et l’induction de la mort cellulaire grâce à des…

Feuille de plants de chou-fleur après inoculation par trempage de la bactérie "Xanthomonas". La bactérie "Xanthomonas campestris pv. campestris" est l'agent responsable de la nervation noire chez des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Il s'agit de la bactériose des crucifères la plus importante au niveau mondial. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries phytopathogènes à leurs hôtes. L…

Membrane de nitrocellulose révélant les protéines totales extraites d'un plant de tabac "Nicotiana benthamiana" et colorées au rouge Ponceau. Cette coloration permet de contrôler la quantité de protéines présentes sur la membrane. Le plant de tabac "Nicotiana benthamiana" sert "d'usine" à fabriquer des protéines d'intérêt. Une fois produites, les protéines sont extraites, purifiées, puis visualisées sur un western par immunodétection (migration des protéines sur un gel d'acrylamide, transfert…