20170074_0013

© Violette DA CUNHA / Philippe GLASER / Pierre LECHAT / Erika SOUCHE / Ivan MOSZER / IPL / C3BI / CNRS Images

Référence

20170074_0013

Représentation circulaire de la distribution et de la recombinaison de SNPs

Représentation circulaire de la distribution et de la recombinaison de SNPs (qui sont des variations mineures du génome au sein d’une population ou d’une espèce, à l’origine de différences morphologiques mais aussi de certaines prédispositions à des maladies). Ici, les chercheurs ont comparé des lignées de clonotype cc1 du groupe B de "Streptococcus agalactiae" (GBS) avec celle de la bactérie "Streptococcus agalactiae", principale cause d'infections néonatales bactériennes. Les récents développements des nouvelles technologies de séquençage permettent d’étudier ces organismes à l’échelle du génome. Dans le cas de "Streptococcus" cette étude a permis de reconstruire l’histoire évolutive récente des clones majeurs responsable des infections. Les mutations intergéniques sont présentées en noir, les mutations synonymes sont en rose et les non synonymes sont en bleu. Les régions de recombinaison sont les zones les plus denses en SNPs. Cette visualisation a été générée avec le logiciel SynTView (Lechat P, Souche E, Moszer I).

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