Observation d'un biofilm au microscope optique à épifluorescence

Imagerie au microscope optique à épifluorescence d'un biofilm dans un réacteur microfluidique. Les images tridimensionnelles obtenues sont analysées par Benjamin Erable. Chercheur en génie des bioprocédés, il étudie les biofilms au Laboratoire de génie chimique (LGC) à Toulouse. Un biofilm, ou film microbien, est une communauté constituée de microorganismes englobés dans une matrice protectrice de polymères qui se forme sur des surfaces naturelles ou artificielles. Ici, le biofilm est observé à partir d'un dispositif microfluidique et transparent pour pouvoir l'imager sans perturber son organisation structurale. La transparence du dispositif offre la possibilité d'utiliser des techniques de métrologie (mesures) ou de microscopie optique, pour réaliser des mesures non destructives en temps réel. L'utilisation de microélectrodes positionnées dans des microcanaux du dispositif permet d'obtenir des données quantitatives sur la composition du microenvironnement entourant le biofilm et sur son activité catalytique. Ce dispositif original est développé et mis au point par Benjamin Erable et son équipe. L'objectif concret est de faire progresser les connaissances fondamentales sur l’autoorganisation des biofilms sur différents supports, sur leurs propriétés catalytiques ou électrocatalytiques, et enfin sur l’évolution de leur organisation structurale en réponse à différents stress ou sollicitations. Les biofilms investigués sont majoritairement des biofilms multiespèces intégrés (ou envisagées) dans des bioprocédés qui serviront dans des domaines tels que l'énergie, la chimie verte ou encore le traitement des eaux. Pour ces travaux, Benjamin Erable reçoit la médaille de bronze du CNRS 2020.