Frédéric MALIGNE

Observation sous une loupe binoculaire de thalles de l'hépatique "Marchantia polymorpha", deux mois après leur mise en culture in vitro. "Marchantia polymorpha" est utilisée comme plante modèle pour étudier les parois cellulaires végétales. En effet, elle se prête bien à la transformation génétique, sa morphologie est simple, et ses familles de gènes peu complexes. Etudier "Marchantia polymorpha" permet aussi de savoir si certaines fonctions ont été conservées au cours de l'évolution de la…

Observation des symptômes d’arabettes des dames "Arabidopsis thaliana" après leur transformation par la bactérie "Agrobacterium tumefaciens". La plante est transformée par transgénèse : un gène provenant d'un microorganisme pathogène est introduit dans l'arabette via la bactérie, afin d'étudier ses effets sur le développement de la plante. L'arabette des dames constitue un organisme modèle très utilisé car elle présente de nombreux avantages (petite taille, multiplication rapide, culture simple…

Observation macroscopique de plants d'arabette des dames, "Arabidopsis thaliana", transformés génétiquement. Cette transformation leur permet de sur-exprimer le récepteur aux hormones stéroïdes végétales, c'est-à-dire d'augmenter son effet. Augmenter le niveau du récepteur aux hormones stéroïdes par transgénèse permet de créer des plantes produisant une biomasse plus importante.

Repiquage d’un échantillon d'un peuplier "Populus tremula x alba" transgénique en culture in vitro. Cet échantillon, appelée explant, a été prélevé depuis un peuplier âgé de deux mois et est introduit stérilement à l’aide de pinces dans un tube contenant le milieu de culture nécessaire au développement de la nouvelle plante (milieu de Murashige et Skoog). Ce peuplier transgénique est utilisé pour étudier le rôle de gènes dont la fonction est encore inconnue mais qui s’expriment fortement dans…

Dépôt de sections (100 µm) de racine de luzerne, "Medicago truncatula", sur une lame de verre, en vue de les observer ensuite au microscope. Les coupes ont été préalablement marquées avec des colorants fluorescents dans le but de visualiser les tissus qui composent la racine et la propagation d’un champignon pathogène dans celle-ci. Les échantillons proviennent d'une culture in vitro de plantules de luzerne en milieu gélosé, infectées par un champignon, "Aphanomyces euteiches", avec dépôts de…

Explications et vérifications d’un protocole de préparation d’échantillons par extraction sur phase solide (SPE), au sein du plateau technique "MetaToul - Métabolites végétaux". Cette méthode permet d’extraire, de purifier et de concentrer des molécules d’intérêt biologique contenues dans un échantillon complexe avant analyse chimique.

Collecte de racines et de feuilles de la fougère "Pteris vittata" en association avec un champignon symbiotique du sol. Les ARN de ces tissus seront extraits pour tester l’activation de certains gènes de la fougère en présence du champignon. Ces données seront comparées à celles obtenues chez les plantes à fleurs, afin de comprendre la conservation de cette symbiose depuis plus de 450 millions d’années.

Effet antifongique d’un surnageant de culture bactérienne (au centre) sur "Botrytis cinerea" au laboratoire commun BioPlantProducts LRSV/De Sangosse. "Botrytis cinerea" est un champignon phytopathogène, c'est-à-dire un parasite qui provoque des maladies sur les plantes. Le surnageant de culture bactérienne est parvenu à le tuer. L’objectif de BioPlantProducts est de développer des produits d’origine naturelle, comme cette souche bactérienne, capables de protéger les cultures végétales des…

Infiltration d'une feuille de tabac "Nicotiana benthamiana" par la bactérie "Agrobacterium tumefaciens". Après avoir inséré dans la bactérie un ou plusieurs gènes d’intérêt, les chercheurs utilisent la capacité naturelle d’Agrobacterium à transférer une partie de son matériel génétique dans les cellules de tabac, afin d’exprimer de façon transitoire le ou les gènes introduits. Ce transfert de gènes, appelé transgénèse, n’est pas héritable et se limite aux tissus infectés. Cette technique est…

Maintenance et vérifications techniques de la GC-MS (GC-MS TSQ Quantum, Thermo Scientific), au sein du plateau technique "MetaToul - Métabolites végétaux". La chromatographie en phase gazeuse (GC) couplée à la spectrométrie de masse (MS) permet de séparer les molécules volatiles de l’échantillon à analyser, de les identifier et de les quantifier d’après leur spectre de masse.

Boîte de Petri contenant un milieu de culture pour le développement des racines de carotte qui viennent d’être repiquées. Le repiquage consiste à transférer une partie des racines d'une boîte dans une autre pour en assurer la propagation. La nouvelle boîte est ensuite fermée à l’aide d’un film qui empêchera l’introduction de contaminations tout en laissant les gaz diffuser entre l’intérieur et l’extérieur de la boîte. Ces racines de carotte ont été colonisées par le champignon "Rhizophagus…

Observation d’une section de racine d’une plantule de luzerne, "Medicago truncatula", en microscopie à champ large. Cette plante modèle de type légumineuse est observée au moyen d’un microscope à champ large équipé d’un système d’acquisition, couplé à une caméra CCD. La section de racine est exposée à une lumière bleue (bande passante 450-490 nm) dans le but de visualiser la paroi d’un oomycète, le champignon "Aphanomyces euteiches", couplée à une lectine WGA-FITC émettant dans les longueurs d…

Prélèvement de la zone méristématique d’un thalle d'hépatique "Marchantia polymorpha" qui sera transféré dans un nouveau substrat pour donner au bout de quelques jours une plante mature de la même forme que celle d'origine.

Infiltration d'une feuille de tabac "Nicotiana benthamiana" par la bactérie "Agrobacterium tumefaciens". Après avoir inséré dans la bactérie un ou plusieurs gènes d’intérêt, les chercheurs utilisent la capacité naturelle d’Agrobacterium à transférer une partie de son matériel génétique dans les cellules de tabac, afin d’exprimer de façon transitoire le ou les gènes introduits. Ce transfert de gènes, appelé transgénèse, n’est pas héritable et se limite aux tissus infectés. Cette technique est…

Suivi de la croissance de thalles d'hépatiques "Marchantia polymorpha". Les scientifiques comparent les stades propagules et thalles dans deux boîtes de Petri, un mois après la mise en culture in vitro des propagules (organes de dissémination et de reproduction de la plante). "Marchantia polymorpha" est utilisée comme plante modèle pour étudier les parois cellulaires végétales. En effet, elle se prête bien à la transformation génétique, sa morphologie est simple, et ses familles de gènes peu…

Observation d’une plantule d’arabette des dames "Arabidopsis thaliana" après traitement avec un miPEP, peptide naturel pouvant moduler le développement des plantes.

Préparation du repiquage de thalles d'une lignée d'hépatiques "Marchantia polymorpha" deux mois après leur mise en culture in vitro. Le repiquage consiste transférer une portion de la plante (boîte de gauche) dans un nouveau milieu de culture (boîte de droite) pour en assurer la propagation. La scientifique identifie la nouvelle boîte en notant le numéro de la lignée et la date. "Marchantia polymorpha" est utilisée comme plante modèle pour étudier les parois cellulaires végétales. En effet,…

Prélèvement de feuilles d'arabette des dames, "Arabidopsis thaliana", génétiquement modifiées pour un gène de transport du fer, afin d’extraire leur ADN génomique et de caractériser leur génotype (patrimoine héréditaire). Comprendre les mécanismes de régulation contrôlant l’absorption du fer du sol est le premier pas vers la création de plantes ayant une teneur en fer biodisponible plus importante.

Coupe de nodule de luzerne tronquée, "Medicago truncatula", observée en microscopie confocale à balayage laser. Une nodosité est l'organe issu d'une symbiose bactérie-plante. Les différents lasers disponibles à l’excitation permettent d’imager des organites marqués avec plusieurs fluorochromes à une résolution latérale de 200 nm.

Préparation d'un système d’analyse par chromatographie en phase liquide ultra haute performance, couplée à la spectrométrie de masse (U-HPLC-MS Q Exactive Plus, Thermo Scientific), au sein du plateau technique "MetaToul - Métabolites végétaux". Cette technique permet de caractériser, d’identifier et de quantifier les molécules présentes dans des échantillons de végétaux et de micro-organismes, par séparation sur une colonne de chromatographie et par analyse par spectrométrie de masse en haute…

Vérification des connexions avant de débuter une analyse d’un extrait végétal par chromatographie en phase liquide ultra haute performance, couplée à la spectrométrie de masse (U-HPLC-MS Q Exactive Plus, Thermo Scientific), au sein du plateau technique "MetaToul - Métabolites végétaux". Cette technique permet de caractériser, d’identifier et de quantifier les molécules présentes dans un échantillon biologique de végétaux ou de micro-organismes, par séparation sur une colonne de chromatographie…

Marquage d'une feuille de tabac "Nicotiana benthamiana" après infiltration par la bactérie "Agrobacterium tumefaciens". Après avoir inséré dans la bactérie un ou plusieurs gènes d’intérêt, les scientifiques utilisent la capacité naturelle d’Agrobacterium à transférer une partie de son matériel génétique dans les cellules de tabac, afin d’exprimer de façon transitoire le ou les gènes introduits. Ce transfert de gènes, appelé transgénèse, n’est pas héritable et se limite aux tissus infectés. La…

Croisement d’une arabette des dames, "Arabidopsis thaliana ", avec une autre espèce, dans la serre S2 OGM. Une des premières étapes consiste à retirer les siliques (fruits contenant des graines) afin de ne laisser qu’une fleur isolée non fécondée. Croiser ainsi deux espèces permet d'intégrer le caractère d'intérêt de l'une dans l'autre.

Dépôt électrolytique d'un matériau d'électrode utilisé dans les micro-supercondensateurs. Un micro-supercondensateur est un dispositif miniaturisé qui stocke l’énergie électrique (comme une micro-batterie). Il est composé de 2 électrodes (composées d’un collecteur de courant et du matériau d’électrode) et d’un électrolyte.

Dépôt électrolytique d'un matériau d'électrode utilisé dans les micro-supercondensateurs. Un micro-supercondensateur est un dispositif miniaturisé qui stocke l’énergie électrique (comme une micro-batterie). Il est composé de 2 électrodes (composées d’un collecteur de courant et du matériau d’électrode) et d’un électrolyte.

Structure atomique en résine déformable mesurant 3 cm et imprimée par stéréolithographie à l'aide d'une imprimante 3D laser DWS 29J.

Expérience de caractérisation hydrodynamique sur une puce microfluidique en résine imprimée en 3D par stéréolithopgraphie à l'aide d'une imprimante 3D laser DWS 29J. La caractérisation hydrodynamique consiste à étudier la vitesse et les pressions d'injection des fluides dans des canaux de petites dimensions (400 µm). Pour cela, les scientifiques utilisent des solutions aqueuses dans lesquelles est injecté un colorant alimentaire, ici en rouge. Cette expérience est menée dans le but de montrer…

Tour Eiffel miniature en résine, imprimée par stéréolithographie, placée en chambre UV pour finir de la durcir. Réalisée à l'aide d'une imprimante 3D laser DWS 29J, cette tour Eiffel, mesurant 8 cm de hauteur, est faite dans un matériau photosensible (DS3000), et est imprimée dans le but de montrer le processus d'impression 3D et la résolution du procédé, de l'ordre de 30µm.

Tour Eiffel miniature en résine venant d'être imprimée par stéréolithographie à l'aide d'une imprimante 3D laser DWS 29J. Celle-ci, mesurant 8 cm de hauteur, est faite dans un matériau photosensible (DS3000), et est imprimée dans le but de montrer le processus d'impression 3D et la résolution du procédé, de l'ordre de 30µm.

Structure gyroide en résine déformable mesurant 3 cm et imprimée par stéréolithographie à l'aide d'une imprimante 3D laser DWS 29J. A une échelle beaucoup plus petite, cette structure peut être retrouvée sur les ailes de papillon. Elle peut être utilisée comme bioréacteur de culture cellulaire.

Expérience de caractérisation hydrodynamique sur une puce microfluidique en résine imprimée en 3D par stéréolithopgraphie à l'aide d'une imprimante 3D laser DWS 29J. La caractérisation hydrodynamique consiste à étudier la vitesse et les pressions d'injection des fluides dans des canaux de petites dimensions (400 µm). Pour cela, les scientifiques utilisent des solutions aqueuses dans lesquelles sont injectés des colorants alimentaires, ici rouge et vert. Cette expérience est menée dans le but de…

Tour Eiffel miniature en résine imprimée en 3D adhérant sur un support métallique rainuré maintenu vertical pour éliminer l'excédent de résine photosensible. Ce support est celui d'une imprimante 3D laser DWS 29J fonctionnant par stéréolithographie. Cette tour Eiffel mesurant 8 cm de hauteur est faite dans un matériau photosensible (DS3000), et est imprimée dans le but de montrer le processus d'impression 3D et la résolution du procédé, de l'ordre de 30µm.

Structure ADN en résine déformable mesurant 3 cm de hauteur et imprimée par stéréolithographie à l'aide d'une imprimante 3D laser DWS 29J. Elle a été imprimée pour démontrer la résolution d'impression qu'il est possible d'obtenir. En effet, les liaisons au sein de la double hélice font environ 200 µm de diamètre, ce qui est proche du diamètre d'un cheveu.

Séchage d'une tour Eiffel miniature en résine à l'aide d'un pistolet d'azote. Réalisée par stéréolithographie à l'aide d'une imprimante 3D laser DWS 29J, cette tour Eiffel, mesurant 8 cm de hauteur, est faite dans un matériau photosensible (DS3000), et est imprimée dans le but de montrer le processus d'impression 3D et la résolution du procédé, de l'ordre de 30µm.

Impression d'une tour Eiffel miniature en résine par stéréolithographie à l'aide d'une imprimante 3D laser DWS 29J. Cette tour Eiffel de 8 cm de hauteur est faite dans un matériau photosensible (DS3000), et est imprimée dans le but de montrer le processus d'impression 3D et la résolution du procédé, de l'ordre de 30µm.

Dépôt électrolytique d'un matériau d'électrode utilisé dans les micro-supercondensateurs. Un micro-supercondensateur est un dispositif miniaturisé qui stocke l’énergie électrique (comme une micro-batterie). Il est composé de 2 électrodes (composées d’un collecteur de courant et du matériau d’électrode) et d’un électrolyte.

Puce microfluidique et son support imprimés par stéréolithographie à l'aide d'une imprimante 3D laser DWS 29J. Ils ont été imprimés dans une résine photosensible transparente et biocompatible. Le support permet de connecter rapidement la puce microfluidique fabriquée en salle blanche avec l'extérieur.

Tour Eiffel miniature en résine imprimée par lithographie à deux photons à l'aide d'une imprimante 3D laser Nanoscribe. La hauteur de la structure est de 3 mm pour une résolution de 200 nm.

Impression d'une tour Eiffel miniature en résine par stéréolithographie à l'aide d'une imprimante 3D laser DWS 29J. Cette tour Eiffel de 8 cm de hauteur est faite dans un matériau photosensible (DS3000), et est imprimée dans le but de montrer le processus d'impression 3D et la résolution du procédé, de l'ordre de 30µm.