Écosystèmes, biodiversité, évolution (ECOBIO)

Consultation de la clé de détermination des carabides pour les paysages agricoles du nord-ouest de la France. Ce document de référence permet l'identification au genre et espèce des spécimens de carabes prélevés sur le terrain. Il a été réalisé par Jean-Luc Roger (Inrae) et Olivier Jambon (Ecobio – CNRS). Le carabe est beaucoup utilisé dans le monde de la recherche, c'est un modèle biologique. Les spécimens sont identifiés et conservés quelques années, le temps de la recherche, dans des…

Prélèvement de femelles de drosophile du cerisier, "Drosophila suzukii", avec un aspirateur à bouche. Elles sont ensuite mises dans de l'éthanol à 96° pour effectuer diverses analyses de biologie moléculaire (symbiotypage, génotypage, virologie, expression des gènes…). Cette petite mouche asiatique arrivée il y a 10/15 ans en France, est un très grand ravageur des cultures, notamment des petits fruits : cerises, framboises, fraises. Contrairement aux autres drosophiles elles ne s'attaquent pas…

Transfert de plantes (spartines et renouées) pour les amener au laboratoire afin de réaliser des analyses génétiques (extractions d'ADN), sur la plateforme d’écologie moléculaire (PEM) de l'unité de recherche Ecobio. Ces plantes sont des spécimens de spartines (genre "Spartina") et de renouées (genre "Reynoutria"), elles proviennent de différentes régions du monde et certaines sont envahissantes. Elles font partie des collections conservées dans la serre expérimentale d'Ecobio et sont notamment…

Nettoyage d'un faux philodendron, "Monstera deliciosa", dont certaines feuilles mesurent plus d'un mètre, au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio. Cette serre regroupe les différentes collections végétales qui sont utilisées pour les activités d’enseignement et accueille également des visites de publics variés. Elle est subdivisée en trois cellules de 70 m² représentant chacune un climat spécifique adapté aux plantes de la collection (zone tempérée, zone tropicale, cactées).

Cladocères, "Bosmina longirostris", observé au microscope inversé. Cette puce d'eau fait partie du zooplancton prélevé dans le lac de Grand-Lieu en Loire-Atlantique, et identifié dans le cadre d’un suivi de ce grand lac, qui est une réserve naturelle dont le fonctionnement écologique et la diversité planctonique sont peu connus. Le zooplancton est un des premiers maillons du réseau trophique. Il se nourrit du phytoplancton et est prédaté par les poissons. Il existe beaucoup d’espèces…

Observation d'une carotte de sédiment prélevée en zone humide, dans la vasière de la réserve naturelle nationale de l'estuaire de la Seine, sous le pont de Normandie. La pointe très fine d'une microsonde va être plongée progressivement dans le sédiment (100 micromètres par 100 micromètres) pour effectuer des mesures d'oxygène à différentes profondeurs. Un micromanipulateur piloté par ordinateur permet de faire cette opération très précisément et d'enregistrer les taux d'oxygène à chaque palier…

Screening de métabolites non ciblés par un système analytique composé d’une chaîne chromatographique ultra haute performance, d’une source d’ionisation par électrospray et d’un analyseur quadripôle-temps de vol en tandem. L’objectif de l’analyse est de mettre en évidence les métabolites d’intérêt impliqués dans l’adaptation aux changements climatiques (températures par exemple) ou aux activités humaines (pesticides) chez différents organismes (drosophiles, vers de terre, plantes, par exemple).

Plantes placées sur un chariot pour être amenées au laboratoire afin de réaliser des analyses génétiques (extractions d'ADN), sur la plateforme d’écologie moléculaire (PEM) de l'unité de recherche Ecobio. Ces plantes sont des spécimens de spartines (genre "Spartina") et de renouées (genre "Reynoutria"), elles proviennent de différentes régions du monde et certaines sont envahissantes. Elles font partie des collections conservées dans la serre expérimentale d'Ecobio et sont notamment utilisées…

Culture de plantes des îles Kerguelen et Crozet (Terres australes et antarctiques françaises) en phytotron froid (4 °C, ECOLEX), en vue d’étudier leur plasticité physiologique et morphologique face à un changement de conditions, ainsi que leur diversité cytogénétique et génétique. Le but du programme de recherches PlantEvol / PlantADAPT soutenu par l’Institut polaire français Paul-Emile Victor est de reconstituer l’évolution et d'évaluer la capacité d’adaptation des espèces de plantes…

Electrolyte à l'intérieur d'une microsonde qui mesure l'oxygène à différentes profondeurs dans une carotte de sédiment. La pointe très fine de la microsonde est plongée progressivement (100 micromètres par 100 micromètres) dans le sédiment prélevé en zone humide, dans la vasière de la réserve naturelle nationale de l'estuaire de la Seine, sous le pont de Normandie. Un micromanipulateur piloté par ordinateur permet de faire cette opération très précisément et d'enregistrer les taux d'oxygène à…

"Ranunculus pseudotrullifolius Skottsb.", plante d’origine magellanique, récoltée aux îles Kerguelen (Terres australes et antarctiques françaises) et en culture en phytotron froid (4 °C, Centre ECOLEX). Le programme de recherches PlantEvol / PlantADAPT soutenu par l’Institut polaire français Paul-Emile Victor porte sur les plantes des îles Kerguelen et Crozet (Terres australes et antarctiques françaises) et vise à évaluer leur plasticité physiologique et morphologique face au changement…

Consultation de la clé de détermination des carabides pour les paysages agricoles du nord-ouest de la France. Ce document de référence permet l'identification au genre et espèce des spécimens de carabes prélevés sur le terrain. Il a été réalisé par Jean-Luc Roger (Inrae) et Olivier Jambon (Ecobio – CNRS). Le carabe est beaucoup utilisé dans le monde de la recherche, c'est un modèle biologique. Les spécimens sont identifiés et conservés quelques années, le temps de la recherche, dans des…

Cage d'élevage contenant des drosophiles du cerisier, "Drosophila suzukii", placée dans un incubateur. Il permet de faire varier la température d'élevage, de -20 °C à +40 °C, et aussi la lumière en intensité et durée. Cette petite mouche asiatique arrivée il y a 10/15 ans en France, est un très grand ravageur des cultures, notamment des petits fruits : cerises, framboises, fraises. Contrairement aux autres drosophiles elles ne s'attaquent pas aux fruits déjà un peu trop mûrs, mais pondent dans…

Nettoyage d'un faux philodendron, "Monstera deliciosa", dont certaines feuilles mesurent plus d'un mètre, au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio. Cette serre regroupe les différentes collections végétales qui sont utilisées pour les activités d’enseignement et accueille également des visites de publics variés. Elle est subdivisée en trois cellules de 70 m² représentant chacune un climat spécifique adapté aux plantes de la collection (zone tempérée, zone tropicale, cactées).

Ver de terre, de type anécique, qui va être observé à la loupe binoculaire, sous hotte aspirante, à la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1). Ce lombricien a été prélevé par méthode chimique ou physique sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Tous les vers de terre prélevés sont comptés et pesés pour déterminer leur abondance et leur biomasse au m². L'espèce, la sous-espèce ou la variété à laquelle ils appartiennent…

Extraction et tri de blocs de sol dans le cadre d'une formation aux protocoles de prélèvements de vers de terre, sur des terrains expérimentaux de la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1), en Ille-et-Vilaine. Les scientifiques de la plateforme EcoBioSoil y forment des stagiaires et contractuels qui iront ensuite sur le terrain à travers toute la France pour récolter des échantillons. Les prélèvements s'effectuent selon des protocoles standardisés pour obtenir de nouvelles…

Tri manuel de blocs de sol dans le cadre d'une formation aux protocoles de prélèvements de vers de terre, sur des terrains expérimentaux de la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1), en Ille-et-Vilaine. Les scientifiques de la plateforme EcoBioSoil y forment des stagiaires et contractuels qui iront ensuite sur le terrain à travers toute la France pour récolter des échantillons. Les prélèvements s'effectuent selon des protocoles standardisés pour obtenir de nouvelles données de…

Ver de terre, de type anécique, avec une tête foncée et une queue claire, qui va être observé à la loupe binoculaire à la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1). Ce lombricien a été prélevé par méthode chimique ou physique sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Tous les vers de terre prélevés sont comptés et pesés pour déterminer leur abondance et leur biomasse au m². L'espèce, la sous-espèce ou la variété à laquelle…

Prise en photo de vers de terre vivants extraits du sol dans le cadre d'une formation aux protocoles de prélèvements, sur des terrains expérimentaux de la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1), en Ille-et-Vilaine. Les photos prises sur le terrain par la suite par les différents observateurs lors des prélèvements réels, seront envoyées à l'Observatoire participatif des vers de terre (OPVT) pour améliorer l'identification des spécimens conservés dans l'alcool envoyés par la…

Réception et vérification des échantillons de vers de terre envoyés par des partenaires volontaires à l’Observatoire Participatif des Vers de Terre (OPVT). Les prélèvements s'effectuent selon des protocoles standardisés pour obtenir de nouvelles données de biodiversité lombricienne dans différentes occupations et modes de gestion des sols. EcoBioSoil est une plateforme collaborative du laboratoire Ecobio qui propose à la fois des protocoles participatifs d'observation de la biodiversité…

Saisie d'un ver de terre qui va être observé à la loupe binoculaire, sous hotte aspirante, à la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1). Ce lombricien a été prélevé par méthode chimique ou physique sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Tous les vers de terre prélevés sont comptés et pesés pour déterminer leur abondance et leur biomasse au m². L'espèce, la sous-espèce ou la variété à laquelle ils appartiennent sont…

Extraction d'un bloc de sol avec une bêche dans le cadre d'une formation aux protocoles de prélèvements de vers de terre, sur des terrains expérimentaux de la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1), en Ille-et-Vilaine. Les scientifiques de la plateforme EcoBioSoil y forment aux prélèvements de vers de terre, des stagiaires et contractuels qui iront ensuite sur le terrain à travers toute la France pour récolter des échantillons. Les prélèvements s'effectuent selon des protocoles…

Observation d'un ver de terre à la loupe binoculaire, sous hotte aspirante, à la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1). Ce lombricien a été prélevé par méthode chimique ou physique sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Tous les vers de terre prélevés sont comptés et pesés pour déterminer leur abondance et leur biomasse au m². L'espèce, la sous-espèce ou la variété à laquelle ils appartiennent sont aussi identifiées…

Tunnel dans lequel une volontaire passe sous une route pour aller d'une prairie à une autre, sur des terrains expérimentaux de la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1), en Ille-et-Vilaine. Elle emporte un kit de prélèvement de vers de terre. Les scientifiques de la plateforme EcoBioSoil forment aux prélèvements de vers de terre, des stagiaires et contractuels qui iront ensuite sur le terrain à travers toute la France pour récolter des échantillons. Les prélèvements s…

Tri manuel de blocs de sol dans le cadre d'une formation aux protocoles de prélèvements de vers de terre, sur des terrains expérimentaux de la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1), en Ille-et-Vilaine. Les scientifiques de la plateforme EcoBioSoil y forment des stagiaires et contractuels qui iront ensuite sur le terrain à travers toute la France pour récolter des échantillons. Les prélèvements s'effectuent selon des protocoles standardisés pour obtenir de nouvelles données de…

Arrosage d'1 m² de terrain, délimité par une grille, avec une solution formolée pour faire remonter les vers de terre à la surface, dans le cadre d'un échantillonnage sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Cette extraction chimique est couplée ensuite à une phase d'extraction physique ou tri manuel. Tous les vers de terre prélevés dans ce mètre carré sont mis dans un pilulier pour les identifier ensuite à la station biologique de…

Station biologique de Paimpont, en Ille-et-Vilaine en région Bretagne, vue de l'étang de Châtenay. Cette station de terrain de l’université de Rennes 1 est située à 40 km à l’ouest de Rennes sur un site d’une vingtaine d’hectares. Construite en 1967 pour accueillir les étudiants lors des sorties de terrain en écologie, elle abrite maintenant également deux laboratoires de recherche, l'UMR6552 EthoS et l'UMR6553 ECOBIO. Tout au long de l’année des étudiants viennent se former aux inventaires…

Observation de la faune dans la litière présente sous une plaque à la station biologique de Paimpont, en Ille-et-Vilaine, en région Bretagne. Cette plaque est posée sur le sol d'une lande dans un exclos de 6 m de côté permettant d'exclure le pâturage des chevaux. Des exclos de ce type sont utilisés dans le cadre d'un programme d'étude de l'évolution de la lande, en fonction des différents modes de gestion. En dehors des exclos, l'impact du pâturage est étudié. A l'intérieur, en l'absence de…

Caméra piège photographique qui se déclenche au moindre mouvement, fixée sur un arbre d'un terrain boisé de la station biologique de Paimpont, en Ille-et-Vilaine, en région Bretagne. Ces clichés sont effectués pour déterminer les espèces présentes dans le périmètre dans le cadre du projet ERC Synergy Lifeplan. L'objectif de ce projet est d'échantillonner la biodiversité dans 120 stations de terrain dans le monde entier par différents moyens : tentes Malaise, caméras, enregistreurs audio,…

Arrosage d'1 m² de terrain, délimité par une grille, avec une solution formolée pour faire remonter les vers de terre à la surface, dans le cadre d'un échantillonnage sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Cette extraction chimique est couplée ensuite à une phase d'extraction physique ou tri manuel. Tous les vers de terre prélevés dans ce mètre carré sont mis dans un pilulier pour les identifier ensuite à la station biologique de…

Vérification de la bonne installation d'une tente Malaise sur un terrain boisé de la station biologique de Paimpont, en Ille-et-Vilaine, en région Bretagne. Ce piège est assez ouvert, avec une paroi en toile au milieu que les insectes ne peuvent traverser. Ils montent donc au travers d'un trou pour être piégés et recueillis dans une bouteille contenant de l'éthanol. Des prélèvements d'insectes vont être effectués une fois par semaine pendant 6 ans, dans le cadre du projet ERC Synergy Lifeplan…

Prélèvement d'un lombricien dans le cadre d'un échantillonnage de vers de terre, sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Une solution formolée a été épandue sur 1 m² de terrain délimité par une grille, pour faire remonter les vers de terre à la surface. Cette extraction chimique est couplée ensuite à une phase d'extraction physique ou tri manuel. Tous les vers de terre prélevés dans ce mètre carré sont mis dans un pilulier pour les…

Extraction d’ADN de gorille des plaines de l’Ouest, "Gorilla gorilla gorilla", dans un échantillon de crotte collectée au Congo. Le gorille étant génétiquement très proche de l’Homme, il est indispensable de prendre des précautions pour ne pas contaminer les échantillons avec l’ADN des expérimentateurs ou celui d’un autre organisme. Le plateau d’analyse d’ADN dégradé du laboratoire EcoBio est adapté pour ces manipulations. Cet échantillon fait partie d’une collection de plus de 1700 crottes de…

Mise en sachet de 3 cuillères de prélèvement de sol effectué sur un terrain boisé de la station biologique de Paimpont, en Ille-et-Vilaine, en région Bretagne. Des extractions d'ADN seront effectuées sur cet échantillon pour déterminer par analyse génétique les espèces présentes dans le sol. Ces prélèvements sont effectués à chaque coin du périmètre, un carré de 100 x 100 m, dans le cadre du projet ERC Synergy Lifeplan. L'objectif de ce projet est d'échantillonner la biodiversité dans 120…

Escargot de Quimper adulte, "Elona quimperiana", à la station biologique de Paimpont, en Ille-et-Vilaine, en région Bretagne. Ce gastéropode est présent un peu partout en centre Bretagne et sur la côte, et notamment à la station de Paimpont, qui se situe à la limite de son aire de distribution. Cette population est suivie par marquage et recapture, ce qui permet d'estimer l'effectif de la population. Il est possible aussi de suivre des individus à plus long terme, quand ils sont jeunes, pour…

Bacs de prélèvements de sol correspondant chacun à 1/16e de m², dans le cadre d'un échantillonnage de vers de terre, sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Ces extraits ont été réalisés sur un m² de terrain où une solution formolée a d'abord été épandue pour faire remonter les vers de terre à la surface. L'extraction physique ou tri manuel ce 1/16e de m² vient en complément pour trier les vers de terre qui ne sont pas remontés à la…

Changement de la carte mémoire d'une caméra piège photographique qui se déclenche au moindre mouvement, sur un terrain boisé de la station biologique de Paimpont, en Ille-et-Vilaine, en région Bretagne. Ces clichés sont effectués pour déterminer les espèces présentes dans le périmètre dans le cadre du projet ERC Synergy Lifeplan. L'objectif de ce projet est d'échantillonner la biodiversité dans 120 stations de terrain dans le monde entier par différents moyens : tentes Malaise, caméras,…

Prélèvement de lombriciens dans le cadre d'un échantillonnage de vers de terre, sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Une solution formolée a été épandue sur 1 m² de terrain délimité par une grille, pour faire remonter les vers de terre à la surface. Cette extraction chimique est couplée ensuite à une phase d'extraction physique ou tri manuel. Tous les vers de terre prélevés dans ce mètre carré sont mis dans un pilulier pour les…

Vérification de la bonne installation d'une tente Malaise sur un terrain boisé de la station biologique de Paimpont, en Ille-et-Vilaine, en région Bretagne. Ce piège est assez ouvert, avec une paroi en toile au milieu que les insectes ne peuvent traverser. Ils montent donc au travers d'un trou pour être piégés et recueillis dans une bouteille contenant de l'éthanol. Des prélèvements d'insectes vont être effectués une fois par semaine pendant 6 ans, dans le cadre du projet ERC Synergy Lifeplan…