Écosystèmes, biodiversité, évolution (ECOBIO)

Acides nucléiques extraits de la vase et stockés dans un congélateur à -80 °C. Chaque échantillon issu de prélèvements réalisés sur le terrain est rangé en boîte, référencée dans une base de données. L'objectif de ces études de microbiologie environnementale est de comprendre le fonctionnement de milieux comme les vases. Les microorganismes qui y pratiquent des réactions pouvant aider à dépolluer sont détectés grâce à leurs acides nucléiques. La transformation des nitrates en diazote …

Introduction de drosophiles du cerisier, "Drosophila suzukii", dans une cage d'élevage. Elles vont se disperser pour pondre dans des tubes ouverts contenant un milieu nutritif, composé de sucre et de levure, qui servira de nourriture pour les larves. Cette petite mouche asiatique arrivée il y a 10/15 ans en France, est un très grand ravageur des cultures, notamment des petits fruits : cerises, framboises, fraises. Contrairement aux autres drosophiles elles ne s'attaquent pas aux fruits déjà un…

Sélection de plantes en vue de prélèvements de jeunes feuilles, ici chez "Spartina versicolor", pour en extraire de l’ADN. "Spartina versicolor" était considérée native des côtes méditerranéennes, mais s’avère être une espèce introduite d’Amérique du Nord (synonyme de "Spartina patens") envahissante. Les scientifiques étudient l’histoire évolutive et les mécanismes tels que la polyploïdie (duplication du génome) à l’origine de la formation de nouvelles espèces envahissantes.

Culture de plantes des îles Kerguelen et Crozet (Terres australes et antarctiques françaises) en phytotron froid (4 °C, Centre ECOLEX), en vue d’étudier leur plasticité physiologique et morphologique face à un changement de conditions, ainsi que leur diversité cytogénétique et génétique. Le but du programme de recherches PlantEvol / PlantADAPT soutenu par l’Institut polaire français Paul-Emile Victor est de reconstituer l’évolution et d'évaluer la capacité d’adaptation des espèces de plantes…

Empotage de plantes bouturées, pour la conservation et la perpétuation des différentes espèces, au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio. Cette serre regroupe les différentes collections végétales qui sont utilisées pour les activités d’enseignement et accueille également des visites de publics variés. Elle est subdivisée en trois cellules de 70 m² représentant chacune un climat spécifique adapté aux plantes de la collection (zone tempérée, zone tropicale, cactées).

Un carabe, la féronie noire, "Carabus intricatus" mis dans un pilulier avec de l'éthanol à 70%. Le carabe est beaucoup utilisé dans le monde de la recherche, c'est un modèle biologique. Les spécimens sont identifiés et conservés quelques années, le temps de la recherche. Ce coléoptère est réparti un peu partout en France pour 60 à 70% des espèces, mais il existe tout de même des espèces endémiques à la région Bretagne et au type de paysage. Certains carabes sont inféodés à des haies, des bois,…

Tube contenant des drosophiles du cerisier, "Drosophila suzukii". Les mâles sont visibles ici, ils ont deux petits points noirs au bout des ailes. Cette petite mouche asiatique arrivée il y a 10/15 ans en France, est un très grand ravageur des cultures, notamment des petits fruits : cerises, framboises, fraises. Contrairement aux autres drosophiles elles ne s'attaquent pas aux fruits déjà un peu trop mûrs, mais pondent dans des fruits qui commencent à être matures. C'est donc quand le fruit…

Stockage dans un congélateur à -80 °C d'échantillons environnementaux. Chaque échantillon issu de prélèvements réalisés sur le terrain est rangé en boîte, référencée dans une base de données. L'objectif de ces études de microbiologie environnementale est de comprendre le fonctionnement de milieux comme les vases. Les microorganismes qui y pratiquent des réactions pouvant aider à dépolluer sont détectés grâce à leurs acides nucléiques. La transformation des nitrates en diazote (dénitrification)…

Pointe très fine d'une microsonde plongée dans une carotte de sédiment prélevée en zone humide, dans la vasière de la réserve naturelle nationale de l'estuaire de la Seine, sous le pont de Normandie. La pointe plonge progressivement dans le sédiment (100 micromètres par 100 micromètres) pour effectuer des mesures d'oxygène à différentes profondeurs. Un micromanipulateur piloté par ordinateur permet de faire cette opération très précisément et d'enregistrer les taux d'oxygène à chaque palier. Ce…

Apport de coccinelles "Cryptolaemus montrouzieri", sur des plantes au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio. Les différents insectes auxiliaires (coccinelles, chrysopes...) apportés dans la serre sont particulièrement intéressants dans le cadre de la lutte biologique puisqu' ils évitent les traitements chimiques pour réguler certains ravageurs (cochenilles, thrips, pucerons...). La serre de collection du laboratoire Ecobio regroupe les différentes collections végétales qui sont…

Carotte de sédiment prélevée en zone humide, dans la vasière de la réserve naturelle nationale de l'estuaire de la Seine, sous le pont de Normandie. La pointe très fine d'une microsonde va être plongée progressivement dans le sédiment (100 micromètres par 100 micromètres) pour effectuer des mesures d'oxygène à différentes profondeurs. Un micromanipulateur piloté par ordinateur permet de faire cette opération très précisément et d'enregistrer les taux d'oxygène à chaque palier. Ce taux d'oxygène…

Echantillons de vase stockés dans un congélateur à -80 °C. Chaque échantillon issu de prélèvements réalisés sur le terrain est rangé en boîte, référencée dans une base de données. L'objectif de ces études de microbiologie environnementale est de comprendre le fonctionnement de milieux comme les vases. Les microorganismes qui y pratiquent des réactions pouvant aider à dépolluer sont détectés grâce à leurs acides nucléiques. La transformation des nitrates en diazote (dénitrification) peut ainsi…

Introduction de drosophiles du cerisier, "Drosophila suzukii", dans une cage d'élevage. Elles vont se disperser pour pondre dans des tubes ouverts contenant un milieu nutritif, composé de sucre et de levure, qui servira de nourriture pour les larves. Cette petite mouche asiatique arrivée il y a 10/15 ans en France, est un très grand ravageur des cultures, notamment des petits fruits : cerises, framboises, fraises. Contrairement aux autres drosophiles elles ne s'attaquent pas aux fruits déjà un…

Prélèvement de jeunes feuilles de "Spartina versicolor" en vue d’extractions d’ADN. Cette plante était considérée native des côtes méditerranéennes, mais s’avère être une espèce introduite d’Amérique du Nord (synonyme de "Spartina patens") envahissante. Les scientifiques étudient l’histoire évolutive et les mécanismes tels que la polyploïdie (duplication du génome) à l’origine de la formation de nouvelles espèces envahissantes.

Saisie d'un ver de terre qui va être observé à la loupe binoculaire, sous hotte aspirante, à la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1). Ce lombricien a été prélevé par méthode chimique ou physique sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Tous les vers de terre prélevés sont comptés et pesés pour déterminer leur abondance et leur biomasse au m². L'espèce, la sous-espèce ou la variété à laquelle ils appartiennent sont…

Extraction d'un bloc de sol avec une bêche dans le cadre d'une formation aux protocoles de prélèvements de vers de terre, sur des terrains expérimentaux de la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1), en Ille-et-Vilaine. Les scientifiques de la plateforme EcoBioSoil y forment aux prélèvements de vers de terre, des stagiaires et contractuels qui iront ensuite sur le terrain à travers toute la France pour récolter des échantillons. Les prélèvements s'effectuent selon des protocoles…

Observation d'un ver de terre à la loupe binoculaire, sous hotte aspirante, à la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1). Ce lombricien a été prélevé par méthode chimique ou physique sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Tous les vers de terre prélevés sont comptés et pesés pour déterminer leur abondance et leur biomasse au m². L'espèce, la sous-espèce ou la variété à laquelle ils appartiennent sont aussi identifiées…

Tunnel dans lequel une volontaire passe sous une route pour aller d'une prairie à une autre, sur des terrains expérimentaux de la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1), en Ille-et-Vilaine. Elle emporte un kit de prélèvement de vers de terre. Les scientifiques de la plateforme EcoBioSoil forment aux prélèvements de vers de terre, des stagiaires et contractuels qui iront ensuite sur le terrain à travers toute la France pour récolter des échantillons. Les prélèvements s…

Tri manuel de blocs de sol dans le cadre d'une formation aux protocoles de prélèvements de vers de terre, sur des terrains expérimentaux de la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1), en Ille-et-Vilaine. Les scientifiques de la plateforme EcoBioSoil y forment des stagiaires et contractuels qui iront ensuite sur le terrain à travers toute la France pour récolter des échantillons. Les prélèvements s'effectuent selon des protocoles standardisés pour obtenir de nouvelles données de…

Ver de terre, de type anécique, qui va être observé à la loupe binoculaire, sous hotte aspirante, à la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1). Ce lombricien a été prélevé par méthode chimique ou physique sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Tous les vers de terre prélevés sont comptés et pesés pour déterminer leur abondance et leur biomasse au m². L'espèce, la sous-espèce ou la variété à laquelle ils appartiennent…

Extraction et tri de blocs de sol dans le cadre d'une formation aux protocoles de prélèvements de vers de terre, sur des terrains expérimentaux de la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1), en Ille-et-Vilaine. Les scientifiques de la plateforme EcoBioSoil y forment des stagiaires et contractuels qui iront ensuite sur le terrain à travers toute la France pour récolter des échantillons. Les prélèvements s'effectuent selon des protocoles standardisés pour obtenir de nouvelles…

Tri manuel de blocs de sol dans le cadre d'une formation aux protocoles de prélèvements de vers de terre, sur des terrains expérimentaux de la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1), en Ille-et-Vilaine. Les scientifiques de la plateforme EcoBioSoil y forment des stagiaires et contractuels qui iront ensuite sur le terrain à travers toute la France pour récolter des échantillons. Les prélèvements s'effectuent selon des protocoles standardisés pour obtenir de nouvelles données de…

Ver de terre, de type anécique, avec une tête foncée et une queue claire, qui va être observé à la loupe binoculaire à la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1). Ce lombricien a été prélevé par méthode chimique ou physique sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Tous les vers de terre prélevés sont comptés et pesés pour déterminer leur abondance et leur biomasse au m². L'espèce, la sous-espèce ou la variété à laquelle…

Prise en photo de vers de terre vivants extraits du sol dans le cadre d'une formation aux protocoles de prélèvements, sur des terrains expérimentaux de la station biologique de Paimpont (Université de Rennes 1), en Ille-et-Vilaine. Les photos prises sur le terrain par la suite par les différents observateurs lors des prélèvements réels, seront envoyées à l'Observatoire participatif des vers de terre (OPVT) pour améliorer l'identification des spécimens conservés dans l'alcool envoyés par la…

Réception et vérification des échantillons de vers de terre envoyés par des partenaires volontaires à l’Observatoire Participatif des Vers de Terre (OPVT). Les prélèvements s'effectuent selon des protocoles standardisés pour obtenir de nouvelles données de biodiversité lombricienne dans différentes occupations et modes de gestion des sols. EcoBioSoil est une plateforme collaborative du laboratoire Ecobio qui propose à la fois des protocoles participatifs d'observation de la biodiversité…

Échantillon de crotte de gorille des plaines de l’Ouest, "Gorilla gorilla gorilla", collectée au Congo et conservée au sec. Il fait partie d'une collection de plus de 1700 crottes de gorilles collectées depuis 2000 et conservées au laboratoire EcoBio. L’ADN des cellules intestinales des gorilles présent dans les crottes est extrait puis amplifié. Les fragments d’ADN amplifiés permettent de déterminer un code barre génétique unique pour chaque individu suivi. Parmi ces individus, environ 600…

Enregistreur audio, fixé sur un arbre, qui se déclenche au moindre bruit, sur un terrain boisé de la station biologique de Paimpont, en Ille-et-Vilaine, en région Bretagne. Ces enregistrements sont effectués en complément de clichés photographiques, pour déterminer les espèces présentes dans le périmètre dans le cadre du projet ERC Synergy Lifeplan. L'objectif de ce projet est d'échantillonner la biodiversité dans 120 stations de terrain dans le monde entier par différents moyens : tentes…

Tri d'un échantillon de sol dans le cadre d'un échantillonnage de vers de terre, sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Cet extrait correspond à 1/16e d'1 m² de terrain délimité par une grille, où une solution formolée a d'abord été épandue pour faire remonter les vers de terre à la surface. L'extraction physique ou tri manuel sur ce 1/16e de m² vient en complément pour trier les vers de terre qui ne sont pas remontés à la surface…

Bouteille contenant de l'éthanol dans laquelle sont piégés les insectes volants rentrés dans une tente Malaise, sur un terrain boisé de la station biologique de Paimpont, en Ille-et-Vilaine, en région Bretagne. Cette tente est assez ouverte, avec une paroi en toile au milieu que les insectes ne peuvent traverser. Ils montent donc au travers d'un trou pour être piégés et recueillis dans cette bouteille. Des prélèvements de ces insectes vont être effectués une fois par semaine pendant 6 ans, dans…

Arrosage d'1 m² de terrain, délimité par une grille, avec une solution formolée pour faire remonter les vers de terre à la surface, dans le cadre d'un échantillonnage sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Cette extraction chimique est couplée ensuite à une phase d'extraction physique ou tri manuel. Tous les vers de terre prélevés dans ce mètre carré sont mis dans un pilulier pour les identifier ensuite à la station biologique de…

Prélèvement d'un lombricien dans le cadre d'un échantillonnage de vers de terre, sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Une solution formolée a été épandue sur 1 m² de terrain délimité par une grille, pour faire remonter les vers de terre à la surface. Cette extraction chimique est couplée ensuite à une phase d'extraction physique ou tri manuel. Tous les vers de terre prélevés dans ce mètre carré sont mis dans un pilulier pour les…

Crotte de gorille des plaines de l’Ouest, "Gorilla gorilla gorilla", collectée au Congo et conservée au sec, sur laquelle un minuscule prélèvement est effectué pour analyses. Cet échantillon fait partie d'une collection de plus de 1700 crottes de gorilles collectées depuis 2000 et conservées au laboratoire EcoBio. Les gorilles sont des animaux frugivores et herbivores. Leurs crottes contiennent donc de nombreux fragments de végétaux et quelques cellules épithéliales du gorille. L’ADN des…

Mise en sachet de 3 cuillères de prélèvement de sol effectué sur un terrain boisé de la station biologique de Paimpont, en Ille-et-Vilaine, en région Bretagne. Des extractions d'ADN seront effectuées sur cet échantillon pour déterminer par analyse génétique les espèces présentes dans le sol. Ces prélèvements sont effectués à chaque coin du périmètre, un carré de 100 x 100 m, dans le cadre du projet ERC Synergy Lifeplan. L'objectif de ce projet est d'échantillonner la biodiversité dans 120…

Image d'un sanglier réalisée par une caméra piège photographique qui se déclenche au moindre mouvement, sur un terrain boisé de la station biologique de Paimpont, en Ille-et-Vilaine, en région Bretagne. Ces clichés sont effectués pour déterminer les espèces présentes dans le périmètre dans le cadre du projet ERC Synergy Lifeplan. L'objectif de ce projet est d'échantillonner la biodiversité dans 120 stations de terrain dans le monde entier par différents moyens : tentes Malaise, caméras,…

Lombricien de type anécique, avec une tête foncée et une queue claire, placé dans un pilulier dans le cadre d'un échantillonnage de vers de terre sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Une solution formolée a été épandue sur 1 m² de terrain délimité par une grille, pour faire remonter les vers de terre à la surface. Cette extraction chimique est couplée ensuite à une phase d'extraction physique ou tri manuel. Tous les vers de terre…

Vérification de la bonne installation d'une tente Malaise sur un terrain boisé de la station biologique de Paimpont, en Ille-et-Vilaine, en région Bretagne. Ce piège est assez ouvert, avec une paroi en toile au milieu que les insectes ne peuvent traverser. Ils montent donc au travers d'un trou pour être piégés et recueillis dans une bouteille contenant de l'éthanol. Des prélèvements d'insectes vont être effectués une fois par semaine pendant 6 ans, dans le cadre du projet ERC Synergy Lifeplan…

Relevé sur une fiche de notes des propriétés de la parcelle (état de surface, végétation, météo…) et des vers de terre qui commencent à remonter à la surface après un arrosage avec une solution formolée, sur le dispositif expérimental EFELE (réseau SOERE-PRO) de la commune de Le Rheu en Ille-et-Vilaine. Cette feuille sert de "backup" en complément et en cas de perte du pilulier ou de son code. Une solution formolée a été épandue sur 1 m² de terrain délimité par une grille, pour faire remonter…

Échantillons de crottes de gorille des plaines de l’Ouest, "Gorilla gorilla gorilla", collectées au Congo, conservées au sec et congelées par -80 °C. Ils font partie d'une collection de plus de 1700 crottes de gorilles collectées depuis 2000 et conservées au laboratoire EcoBio. L’ADN des cellules intestinales des gorilles présent dans les crottes est extrait puis amplifié. Les fragments d’ADN amplifiés permettent de déterminer un code barre génétique unique pour chaque individu suivi. Parmi ces…

Prélèvement de sol effectué sur un terrain boisé de la station biologique de Paimpont, en Ille-et-Vilaine, en région Bretagne. Des extractions d'ADN seront effectuées sur cet échantillon pour déterminer par analyse génétique les espèces présentes dans le sol. Ces prélèvements sont effectués à chaque coin du périmètre, un carré de 100 x 100 m, dans le cadre du projet ERC Synergy Lifeplan. L'objectif de ce projet est d'échantillonner la biodiversité dans 120 stations de terrain dans le monde…