Séquençage du génome viral du SARS-CoV-2

Séquençage du génome viral du SARS-CoV-2 sur un séquenceur de troisième génération. Cette technique permet de détecter les mutations du génome du virus. Les mutations résultent d’erreurs lors de la réplication virale (le processus par lequel le virus se multiplie). Les étudier permet de tracer la diffusion de l’épidémie de covid-19 en suivant les lignées de virus dans l’espace et dans le temps. On peut aussi repérer les mutations qui impactent l'évolution de l’épidémie, comme la résistance des variants aux vaccins par exemple. L’équipe "Infection virale : persistance, réponse de l’hôte et physiopathologie" s’intéresse à la physiopathologie des infections par le virus de l'immunodéficience humaine (HIV) responsable du sida, celui de l’hépatite E (HEV) et SARS-CoV-2, le virus de la covid-19. Elle étudie les mécanismes de persistance de ces virus chez l’hôte immunocompétent (HIV) ou chez l’immunodéprimé (HEV, SARS-CoV-2). Elle s’intéresse aux mécanismes d’entrée du HIV par les récepteurs de chimiokines, ainsi que la physiopathologie de l’infection HIV dans la muqueuse intestinale. Les membre de cette équipe étudient également les modes de transmission et la pathogénèse du HEV et du SARS-CoV-2.