Frédéric MALIGNE

Suivi de la croissance de thalles d'hépatiques "Marchantia polymorpha". Les scientifiques comparent les stades propagules et thalles dans deux boîtes de Petri, un mois après la mise en culture in vitro des propagules (organes de dissémination et de reproduction de la plante). "Marchantia polymorpha" est utilisée comme plante modèle pour étudier les parois cellulaires végétales. En effet, elle se prête bien à la transformation génétique, sa morphologie est simple, et ses familles de gènes peu…

Observation d’une plantule d’arabette des dames "Arabidopsis thaliana" après traitement avec un miPEP, peptide naturel pouvant moduler le développement des plantes.

Prélèvement de la zone méristématique d’un thalle d'hépatique "Marchantia polymorpha" qui sera transféré dans un nouveau substrat pour donner au bout de quelques jours une plante mature de la même forme que celle d'origine.

Prélèvement de feuilles d'arabette des dames, "Arabidopsis thaliana", génétiquement modifiées pour un gène de transport du fer, afin d’extraire leur ADN génomique et de caractériser leur génotype (patrimoine héréditaire). Comprendre les mécanismes de régulation contrôlant l’absorption du fer du sol est le premier pas vers la création de plantes ayant une teneur en fer biodisponible plus importante.

Préparation du repiquage de thalles d'une lignée d'hépatiques "Marchantia polymorpha" deux mois après leur mise en culture in vitro. Le repiquage consiste transférer une portion de la plante (boîte de gauche) dans un nouveau milieu de culture (boîte de droite) pour en assurer la propagation. La scientifique identifie la nouvelle boîte en notant le numéro de la lignée et la date. "Marchantia polymorpha" est utilisée comme plante modèle pour étudier les parois cellulaires végétales. En effet,…

Coupe de nodule de luzerne tronquée, "Medicago truncatula", observée en microscopie confocale à balayage laser. Une nodosité est l'organe issu d'une symbiose bactérie-plante. Les différents lasers disponibles à l’excitation permettent d’imager des organites marqués avec plusieurs fluorochromes à une résolution latérale de 200 nm.

Préparation d'un système d’analyse par chromatographie en phase liquide ultra haute performance, couplée à la spectrométrie de masse (U-HPLC-MS Q Exactive Plus, Thermo Scientific), au sein du plateau technique "MetaToul - Métabolites végétaux". Cette technique permet de caractériser, d’identifier et de quantifier les molécules présentes dans des échantillons de végétaux et de micro-organismes, par séparation sur une colonne de chromatographie et par analyse par spectrométrie de masse en haute…

Marquage d'une feuille de tabac "Nicotiana benthamiana" après infiltration par la bactérie "Agrobacterium tumefaciens". Après avoir inséré dans la bactérie un ou plusieurs gènes d’intérêt, les scientifiques utilisent la capacité naturelle d’Agrobacterium à transférer une partie de son matériel génétique dans les cellules de tabac, afin d’exprimer de façon transitoire le ou les gènes introduits. Ce transfert de gènes, appelé transgénèse, n’est pas héritable et se limite aux tissus infectés. La…

Vérification des connexions avant de débuter une analyse d’un extrait végétal par chromatographie en phase liquide ultra haute performance, couplée à la spectrométrie de masse (U-HPLC-MS Q Exactive Plus, Thermo Scientific), au sein du plateau technique "MetaToul - Métabolites végétaux". Cette technique permet de caractériser, d’identifier et de quantifier les molécules présentes dans un échantillon biologique de végétaux ou de micro-organismes, par séparation sur une colonne de chromatographie…

Croisement d’une arabette des dames, "Arabidopsis thaliana ", avec une autre espèce, dans la serre S2 OGM. Une des premières étapes consiste à retirer les siliques (fruits contenant des graines) afin de ne laisser qu’une fleur isolée non fécondée. Croiser ainsi deux espèces permet d'intégrer le caractère d'intérêt de l'une dans l'autre.

Sélection de zones racinaires de plantules de luzerne pour les préparer afin de les observer en microscopie à champ large, en lumière blanche ou fluorescence. Il s’agit d’une culture in vitro de plantules de luzerne, "Medicago truncatula", en milieu gélosé, infectées par un champignon, "Aphanomyces euteiches", avec dépôts de spores au niveau de la racine. L’objectif est de localiser à l'échelle cellulaire le champignon dans la racine de luzerne (intra ou extracellulaire).

Observation d’échantillons biologiques végétaux en microscopie confocale à balayage laser. Le but est d’explorer l’échantillon plan par plan à l’aide de marqueurs fluorescents (plusieurs centaines de microns) dans l’objectif de reconstruire la structure en 3D.

Collecte de racines et de feuilles de la fougère "Pteris vittata" en association avec un champignon symbiotique du sol. Les ARN de ces tissus seront extraits pour tester l’activation de certains gènes de la fougère en présence du champignon. Ces données seront comparées à celles obtenues chez les plantes à fleurs, afin de comprendre la conservation de cette symbiose depuis plus de 450 millions d’années.

Mise en terreau d'un thalle méristématique de l'hépatique "Marchantia polymorpha". Le thalle a été prélevé depuis une plante mature puis transféré dans un nouveau substrat pour donner au bout de quelques jours une plante de la même forme que celle d'origine.

Repiquage en terreau de l'hépatique "Marchantia polymorpha".

Prélèvement de propagules de l'hépatique "Marchantia polymorpha" en vue d'un repiquage (multiplication végétative). La propagule est l'organe de dissémination et de reproduction de la plante. Elle est transférée ici dans un nouveau milieu de culture pour assurer la propagation de la plante. "Marchantia polymorpha" est utilisée comme plante modèle pour étudier les parois cellulaires végétales. En effet, elle se prête bien à la transformation génétique, sa morphologie est simple, et ses familles…

Observation de la croissance d' "hairy-roots" (chevelu racinaire) d’Eucalyptus grandis en culture hydroponique. Les racines ont été transformées par la bactérie "Agrobacterium rhizogenes", par transgénèse. L'objectif est de caractériser fonctionnellement des gènes potentiellement impliqués dans la formation du bois.

Mise en place d’un flacon Vial dans un passeur d’échantillons, au sein du plateau technique "MetaToul - Métabolites végétaux". Il sera analysé en métabolomique globale d’échantillons par chromatographie en phase liquide ultra haute performance couplée à la spectrométrie de masse, Cette technique permet d’identifier les molécules présentes dans un échantillon biologique, par séparation sur une colonne de chromatographie liquide et par analyse par spectrométrie de masse en haute résolution. La…

Boîte de Petri contenant des racines de carotte colonisées par le champignon symbiotique "Rhizophagus irregularis". L’intérieur de la boîte est maintenu stérile. N’ayant pas de parties aériennes, les racines se nourrissent grâce à du sucre dissous dans le milieu. Le scientifique observe la boîte pour vérifier la présence de contaminations.

Récupération des spores d’une actinobactérie, au laboratoire commun BioPlantProducts LRSV/De Sangosse, pour repiquage. Les spores sont récupérées en grattant des colonies à la surface avec un étaleur et sont ensuite réintroduites dans un nouveau milieu de culture. L’objectif de BioPlantProducts est de développer des produits d’origine naturelle capables de protéger les cultures végétales des maladies ou de stimuler la croissance des plantes. BioPlantProducts réunit le LRSV et l’entreprise…

Observation des symptômes d’arabettes des dames "Arabidopsis thaliana" après leur transformation par la bactérie "Agrobacterium tumefaciens". La plante est transformée par transgénèse : un gène provenant d'un microorganisme pathogène est introduit dans l'arabette via la bactérie, afin d'étudier ses effets sur le développement de la plante. L'arabette des dames constitue un organisme modèle très utilisé car elle présente de nombreux avantages (petite taille, multiplication rapide, culture simple…

Flacon Vial contenant un extrait végétal dont la teneur en phytohormones sera déterminée par chromatographie en phase liquide ultra haute performance couplée à la spectrométrie de masse (U-HPLC-MS Q Exactive Plus, Thermo Scientific). Cette technique permet de caractériser, d’identifier et de quantifier les petites molécules présentes dans un échantillon biologique, par séparation sur une colonne de chromatographie et par analyse par spectrométrie de masse en haute résolution. Les analyses sont…

Croisement d’une arabette des dames, "Arabidopsis thaliana ", avec une autre espèce, dans la serre S2 OGM. La fleur isolée non fécondée est encore fermée. A l’aide d’une pince fine, la scientifique retire délicatement les sépales, les pétales et les étamines (parties reproductrices mâles de la fleur qui contiennent le pollen) non matures sans abîmer le pistil (partie reproductrice femelle de la fleur). Croiser ainsi deux espèces permet d'intégrer le caractère d'intérêt de l'une dans l'autre.

Installation de sachets d'acariens "Amblyseius cucumeris" sur du soja, dans la serre S2 OGM. Cette démarche s'inscrit dans le cadre de la lutte biologique, méthode qui consiste à lutter contre les parasites des plantes en utilisant leurs prédateurs naturels. L’acarien "Amblyseuis cucumeris" est utilisé ici pour lutter contre les insectes appelés thrips.

Stérilisation à la flamme d’une pince, en vue du repiquage des peupliers "Populus tremula x alba" transgéniques cultivés en laboratoire. Le repiquage consiste à transférer un échantillon de la plante dans un nouveau milieu de culture pour en assurer la propagation (technique de multiplication végétative). Ce peuplier transgénique est utilisé pour étudier le rôle de gènes dont la fonction est encore inconnue mais qui s’expriment fortement dans un tissu particulier appelé xylème (bois). Les…

Amincissement par coupe d'objets biologiques constitués de zones racinaires de plantules de luzerne, "Medicago truncatula", incluses dans une matrice d’agarose. Des sections transversales de l’ordre de 100 µm sont réalisées au moyen d’un vibratome (lame vibrante de vitesse et fréquence variables). Les racines prélevées proviennent d'une culture in vitro de plantules de luzerne en milieu gélosé, infectées par un champignon, "Aphanomyces euteiches", avec dépôts de spores au niveau de la racine. L…

Observation d'une plante entière avec une loupe binoculaire haute performance. Cette loupe permet un zoom optique dynamique des régions à visualiser (dans la gamme centimétrique-millimétrique), pour des images acquises en éclairage épiscopique ou diascopique et en lumière fluorescente multicanaux.

Collecte de racines et de feuilles de la fougère "Pteris vittata" en association avec un champignon symbiotique du sol. Les ARN de ces tissus seront extraits pour tester l’activation de certains gènes de la fougère en présence du champignon. Ces données seront comparées à celles obtenues chez les plantes à fleurs, afin de comprendre la conservation de cette symbiose depuis plus de 450 millions d’années.

Prélèvement de gemmae de l'hépatique "Marchantia polymorpha". À partir d’une gemma sur substrat on obtient une plante identique à la plante mère. Cette technique de culture de "Marchantia polymorpha" est une alternative à la propagation à partir du thalle méristématique.

Mise en terreau d'un thalle méristématique de l'hépatique "Marchantia polymorpha". Le thalle a été prélevé depuis une plante mature puis transféré dans un nouveau substrat pour donner au bout de quelques jours une plante de la même forme que celle d'origine.

Jeunes thalles de l'hépatique "Marchantia polymorpha" issus de propagules cultivées in vitro pendant un mois. La propagule est l'organe de dissémination et de reproduction de la plante. "Marchantia polymorpha" est utilisée comme plante modèle pour étudier les parois cellulaires végétales. En effet, elle se prête bien à la transformation génétique, sa morphologie est simple, et ses familles de gènes peu complexes. Etudier "Marchantia polymorpha" permet aussi de savoir si certaines fonctions ont…

Remplissage du classeur de suivi de l’équipement analytique dans le cadre de la démarche qualité du plateau "MetaToul - Métabolites végétaux". Ce classeur permet de tracer les vérifications techniques et le suivi des performances de l’appareil analytique, pour s’assurer que l’analyse réalisée sera fiable et de bonne qualité.

Repiquage de racines de carotte colonisées par le champignon symbiotique "Rhizophagus irregularis". Prélevées depuis leur boîte d'origine, elles sont repiquées dans une nouvelle boîte pour assurer la propagation. Les outils sont stérilisés et l’opération est réalisée sous une hotte à flux stérile.

Culture en boîte de Petri d’une souche de Fusarium au laboratoire commun BioPlantProducts LRSV/De Sangosse. Le Fusarium est un champignon phytopathogène, c'est-à-dire un champignon parasite qui provoque des maladies sur les plantes. L’objectif de BioPlantProducts est de développer des produits d’origine naturelle, capables de protéger les cultures végétales des maladies (comme celles provoquées par le Fusarium) ou de stimuler la croissance des plantes. Il réunit le LRSV et l’entreprise agenaise…

Inoculation d’un milieu de culture liquide à partir d’une suspension de spores d’actinobactéries au laboratoire commun BioPlantProducts LRSV/De Sangosse. L’objectif de BioPlantProducts est de développer des produits d’origine naturelle capables de protéger les cultures végétales des maladies ou de stimuler la croissance des plantes. BioPlantProducts réunit le LRSV et l’entreprise agenaise De Sangosse afin d'associer recherche et développement industriel.

Peuplier "Populus tremula x alba" transgénique, croisement entre peuplier tremble et peuplier blanc. Le but de cette transformation est d’étudier le rôle de gènes dont la fonction est encore inconnue mais qui s’expriment fortement dans un tissu particulier appelé xylème (bois). Les scientifiques sur-expriment ces gènes dans le peuplier puis étudient les changements phénotypiques induits (paroi des cellules plus ou moins épaisses ou lignifiées, etc.). Âgé de deux mois, ce peuplier est cultivé en…

Observation des symptômes d’arabettes des dames "Arabidopsis thaliana" après leur transformation par la bactérie "Agrobacterium tumefaciens". La plante est transformée par transgénèse : un gène provenant d'un microorganisme pathogène est introduit dans l'arabette via la bactérie, afin d'étudier ses effets sur le développement de la plante. L'arabette des dames constitue un organisme modèle très utilisé car elle présente de nombreux avantages (petite taille, multiplication rapide, culture simple…

Installation d’une colonne de chromatographie en phase gazeuse dans le four du chromatographe en phase gazeuse (GC-MS TSQ Quantum, Thermo Scientific), au sein du plateau technique "MetaToul - Métabolites végétaux". La chromatographie en phase gazeuse (GC) permet de séparer les différentes molécules volatiles de l’échantillon végétal à analyser. Couplée à la détection par spectrométrie de masse (MS), la GC-MS permet d’identifier les molécules volatiles et de les quantifier d’après leur spectre…

Croisement d’une arabette des dames, "Arabidopsis thaliana ", avec une autre espèce, dans la serre S2 OGM. A la loupe binoculaire, la scientifique vérifie que le pistil (partie reproductrice femelle de la fleur) n’est pas endommagé, ni fécondé, puis elle le pollinise à l’aide de la fleur d’intérêt. Croiser ainsi deux espèces permet d'intégrer le caractère d'intérêt de l'une dans l'autre.