Frédéric MALIGNE

Boîte de Petri contenant des racines de carotte colonisées par le champignon symbiotique "Rhizophagus irregularis". L’intérieur de la boîte est maintenu stérile. N’ayant pas de parties aériennes, les racines se nourrissent grâce à du sucre dissous dans le milieu. Le scientifique observe la boîte pour vérifier la présence de contaminations.

Observation des symptômes d’arabettes des dames "Arabidopsis thaliana" après leur transformation par la bactérie "Agrobacterium tumefaciens". La plante est transformée par transgénèse : un gène provenant d'un microorganisme pathogène est introduit dans l'arabette via la bactérie, afin d'étudier ses effets sur le développement de la plante. L'arabette des dames constitue un organisme modèle très utilisé car elle présente de nombreux avantages (petite taille, multiplication rapide, culture simple…

Flacon Vial contenant un extrait végétal dont la teneur en phytohormones sera déterminée par chromatographie en phase liquide ultra haute performance couplée à la spectrométrie de masse (U-HPLC-MS Q Exactive Plus, Thermo Scientific). Cette technique permet de caractériser, d’identifier et de quantifier les petites molécules présentes dans un échantillon biologique, par séparation sur une colonne de chromatographie et par analyse par spectrométrie de masse en haute résolution. Les analyses sont…

Croisement d’une arabette des dames, "Arabidopsis thaliana ", avec une autre espèce, dans la serre S2 OGM. La fleur isolée non fécondée est encore fermée. A l’aide d’une pince fine, la scientifique retire délicatement les sépales, les pétales et les étamines (parties reproductrices mâles de la fleur qui contiennent le pollen) non matures sans abîmer le pistil (partie reproductrice femelle de la fleur). Croiser ainsi deux espèces permet d'intégrer le caractère d'intérêt de l'une dans l'autre.

Installation de sachets d'acariens "Amblyseius cucumeris" sur du soja, dans la serre S2 OGM. Cette démarche s'inscrit dans le cadre de la lutte biologique, méthode qui consiste à lutter contre les parasites des plantes en utilisant leurs prédateurs naturels. L’acarien "Amblyseuis cucumeris" est utilisé ici pour lutter contre les insectes appelés thrips.

Observation d'une plante entière avec une loupe binoculaire haute performance. Cette loupe permet un zoom optique dynamique des régions à visualiser (dans la gamme centimétrique-millimétrique), pour des images acquises en éclairage épiscopique ou diascopique et en lumière fluorescente multicanaux.

Stérilisation à la flamme d’une pince, en vue du repiquage des peupliers "Populus tremula x alba" transgéniques cultivés en laboratoire. Le repiquage consiste à transférer un échantillon de la plante dans un nouveau milieu de culture pour en assurer la propagation (technique de multiplication végétative). Ce peuplier transgénique est utilisé pour étudier le rôle de gènes dont la fonction est encore inconnue mais qui s’expriment fortement dans un tissu particulier appelé xylème (bois). Les…

Amincissement par coupe d'objets biologiques constitués de zones racinaires de plantules de luzerne, "Medicago truncatula", incluses dans une matrice d’agarose. Des sections transversales de l’ordre de 100 µm sont réalisées au moyen d’un vibratome (lame vibrante de vitesse et fréquence variables). Les racines prélevées proviennent d'une culture in vitro de plantules de luzerne en milieu gélosé, infectées par un champignon, "Aphanomyces euteiches", avec dépôts de spores au niveau de la racine. L…

Collecte de racines et de feuilles de la fougère "Pteris vittata" en association avec un champignon symbiotique du sol. Les ARN de ces tissus seront extraits pour tester l’activation de certains gènes de la fougère en présence du champignon. Ces données seront comparées à celles obtenues chez les plantes à fleurs, afin de comprendre la conservation de cette symbiose depuis plus de 450 millions d’années.

Prélèvement de gemmae de l'hépatique "Marchantia polymorpha". À partir d’une gemma sur substrat on obtient une plante identique à la plante mère. Cette technique de culture de "Marchantia polymorpha" est une alternative à la propagation à partir du thalle méristématique.

Mise en terreau d'un thalle méristématique de l'hépatique "Marchantia polymorpha". Le thalle a été prélevé depuis une plante mature puis transféré dans un nouveau substrat pour donner au bout de quelques jours une plante de la même forme que celle d'origine.

Jeunes thalles de l'hépatique "Marchantia polymorpha" issus de propagules cultivées in vitro pendant un mois. La propagule est l'organe de dissémination et de reproduction de la plante. "Marchantia polymorpha" est utilisée comme plante modèle pour étudier les parois cellulaires végétales. En effet, elle se prête bien à la transformation génétique, sa morphologie est simple, et ses familles de gènes peu complexes. Etudier "Marchantia polymorpha" permet aussi de savoir si certaines fonctions ont…

Remplissage du classeur de suivi de l’équipement analytique dans le cadre de la démarche qualité du plateau "MetaToul - Métabolites végétaux". Ce classeur permet de tracer les vérifications techniques et le suivi des performances de l’appareil analytique, pour s’assurer que l’analyse réalisée sera fiable et de bonne qualité.

Culture en boîte de Petri d’une souche de Fusarium au laboratoire commun BioPlantProducts LRSV/De Sangosse. Le Fusarium est un champignon phytopathogène, c'est-à-dire un champignon parasite qui provoque des maladies sur les plantes. L’objectif de BioPlantProducts est de développer des produits d’origine naturelle, capables de protéger les cultures végétales des maladies (comme celles provoquées par le Fusarium) ou de stimuler la croissance des plantes. Il réunit le LRSV et l’entreprise agenaise…

Inoculation d’un milieu de culture liquide à partir d’une suspension de spores d’actinobactéries au laboratoire commun BioPlantProducts LRSV/De Sangosse. L’objectif de BioPlantProducts est de développer des produits d’origine naturelle capables de protéger les cultures végétales des maladies ou de stimuler la croissance des plantes. BioPlantProducts réunit le LRSV et l’entreprise agenaise De Sangosse afin d'associer recherche et développement industriel.

Repiquage de racines de carotte colonisées par le champignon symbiotique "Rhizophagus irregularis". Prélevées depuis leur boîte d'origine, elles sont repiquées dans une nouvelle boîte pour assurer la propagation. Les outils sont stérilisés et l’opération est réalisée sous une hotte à flux stérile.

Observation des symptômes d’arabettes des dames "Arabidopsis thaliana" après leur transformation par la bactérie "Agrobacterium tumefaciens". La plante est transformée par transgénèse : un gène provenant d'un microorganisme pathogène est introduit dans l'arabette via la bactérie, afin d'étudier ses effets sur le développement de la plante. L'arabette des dames constitue un organisme modèle très utilisé car elle présente de nombreux avantages (petite taille, multiplication rapide, culture simple…

Installation d’une colonne de chromatographie en phase gazeuse dans le four du chromatographe en phase gazeuse (GC-MS TSQ Quantum, Thermo Scientific), au sein du plateau technique "MetaToul - Métabolites végétaux". La chromatographie en phase gazeuse (GC) permet de séparer les différentes molécules volatiles de l’échantillon végétal à analyser. Couplée à la détection par spectrométrie de masse (MS), la GC-MS permet d’identifier les molécules volatiles et de les quantifier d’après leur spectre…

Peuplier "Populus tremula x alba" transgénique, croisement entre peuplier tremble et peuplier blanc. Le but de cette transformation est d’étudier le rôle de gènes dont la fonction est encore inconnue mais qui s’expriment fortement dans un tissu particulier appelé xylème (bois). Les scientifiques sur-expriment ces gènes dans le peuplier puis étudient les changements phénotypiques induits (paroi des cellules plus ou moins épaisses ou lignifiées, etc.). Âgé de deux mois, ce peuplier est cultivé en…

Croisement d’une arabette des dames, "Arabidopsis thaliana ", avec une autre espèce, dans la serre S2 OGM. A la loupe binoculaire, la scientifique vérifie que le pistil (partie reproductrice femelle de la fleur) n’est pas endommagé, ni fécondé, puis elle le pollinise à l’aide de la fleur d’intérêt. Croiser ainsi deux espèces permet d'intégrer le caractère d'intérêt de l'une dans l'autre.

Préparation d’échantillons végétaux par extraction sur phase solide (SPE), au sein du plateau technique "MetaToul - Métabolites végétaux". Cette méthode permet d’extraire, de purifier et de concentrer des molécules d’intérêt biologique contenues dans un échantillon complexe, avant analyse chimique.

Prélèvement d’un échantillon d'un peuplier "Populus tremula x alba" transgénique âgé de deux mois à l'aide d'une pince stérile. Cet échantillon, appelée explant, va servir à produire un clone du peuplier pour assurer sa propagation en culture in vitro. Le tube a été ouvert sous poste de sécurité microbiologique (PSM). Ce peuplier transgénique est utilisé pour étudier le rôle de gènes dont la fonction est encore inconnue mais qui s’expriment fortement dans un tissu particulier appelé xylème …

Dépôt de sections (100 µm) de racine de luzerne, "Medicago truncatula", sur une lame de verre, en vue de les observer ensuite au microscope. Les coupes ont été préalablement marquées avec des colorants fluorescents dans le but de visualiser les tissus qui composent la racine et la propagation d’un champignon pathogène dans celle-ci. Les échantillons proviennent d'une culture in vitro de plantules de luzerne en milieu gélosé, infectées par un champignon, "Aphanomyces euteiches", avec dépôts de…

Collecte de racines et de feuilles de la fougère "Pteris vittata" en association avec un champignon symbiotique du sol. Les ARN de ces tissus seront extraits pour tester l’activation de certains gènes de la fougère en présence du champignon. Ces données seront comparées à celles obtenues chez les plantes à fleurs, afin de comprendre la conservation de cette symbiose depuis plus de 450 millions d’années.

Resuspension des gemmae de l'hépatique "Marchantia polymorpha" dans des tubes Eppendorf contenant de l’eau. À partir d’une gemma sur substrat on obtient une plante identique à la plante mère. Cette technique de culture de "Marchantia polymorpha" est une alternative à la propagation à partir du thalle méristématique.

Resuspension des gemmae de l'hépatique "Marchantia polymorpha" dans des tubes Eppendorf contenant de l’eau. À partir d’une gemma sur substrat on obtient une plante identique à la plante mère. Cette technique de culture de "Marchantia polymorpha" est une alternative à la propagation à partir du thalle méristématique.

Souche bactérienne libérant des composés antifongiques en confrontation avec "Botrytis cinerea" (en marron), au laboratoire commun BioPlantProducts LRSV/De Sangosse. "Botrytis cinerea" est un champignon phytopathogène, c'est-à-dire un parasite qui provoque des maladies sur les plantes. L’objectif de BioPlantProducts est de développer des produits d’origine naturelle, comme cette souche bactérienne, capables de protéger les cultures végétales des maladies ou de stimuler la croissance des plantes…

Calibration en masse du spectromètre de masse en haute résolution (U-HPLC-MS Q Exactive Plus, Thermo Scientific) avant l’analyse des échantillons, au sein du plateau technique "MetaToul - Métabolites végétaux". Cette étape permet de s’assurer que les mesures réalisées seront précises et de bonne qualité. La spectrométrie de masse couplée à la chromatographie permet de caractériser, d’identifier et de quantifier les molécules présentes dans un échantillon biologique.

Plants en pots d’arabettes des dames, "Arabidopsis thaliana", au laboratoire commun BioPlantProducts LRSV/De Sangosse. Les plants sont conservés dans un phytotron, une enceinte climatique permettant de contrôler la température, l’éclairage et l’hygrométrie. L’objectif de BioPlantProducts est de développer des produits d’origine naturelle capables de protéger les cultures végétales des maladies ou de stimuler la croissance des plantes. Les produits développés sont testés sur les arabettes des…

Repiquage de racines de carotte colonisées par le champignon symbiotique "Rhizophagus irregularis". Les outils sont stérilisés et l’opération, qui sert à assurer la propagation de la plante, est réalisée sous une hotte à flux stérile. La nouvelle boîte contient un milieu gélosé composé des différentes substances nécessaires au développement des racines et du champignon.

Observation des symptômes d’arabettes des dames "Arabidopsis thaliana" après leur transformation par la bactérie "Agrobacterium tumefaciens". La plante est transformée par transgénèse : un gène provenant d'un microorganisme pathogène est introduit dans l'arabette via la bactérie, afin d'étudier ses effets sur le développement de la plante. L'arabette des dames constitue un organisme modèle très utilisé car elle présente de nombreux avantages (petite taille, multiplication rapide, culture simple…

Croisement d’une arabette des dames, "Arabidopsis thaliana ", avec une autre espèce, dans la serre S2 OGM. Au bout de la tige se trouvent des petites grappes de fleurs à différents stades. La scientifique sélectionne une fleur fermée (car non fécondée) et élimine les autres délicatement pour l'isoler avant sa fécondation et éviter les contaminations croisées. Croiser ainsi deux espèces permet d'intégrer le caractère d'intérêt de l'une dans l'autre.

Observation sous une loupe binoculaire de thalles de l'hépatique "Marchantia polymorpha", deux mois après leur mise en culture in vitro. "Marchantia polymorpha" est utilisée comme plante modèle pour étudier les parois cellulaires végétales. En effet, elle se prête bien à la transformation génétique, sa morphologie est simple, et ses familles de gènes peu complexes. Etudier "Marchantia polymorpha" permet aussi de savoir si certaines fonctions ont été conservées au cours de l'évolution de la…

Observation macroscopique de plants d'arabette des dames, "Arabidopsis thaliana", transformés génétiquement. Cette transformation leur permet de sur-exprimer le récepteur aux hormones stéroïdes végétales, c'est-à-dire d'augmenter son effet. Augmenter le niveau du récepteur aux hormones stéroïdes par transgénèse permet de créer des plantes produisant une biomasse plus importante.

Explications et vérifications d’un protocole de préparation d’échantillons par extraction sur phase solide (SPE), au sein du plateau technique "MetaToul - Métabolites végétaux". Cette méthode permet d’extraire, de purifier et de concentrer des molécules d’intérêt biologique contenues dans un échantillon complexe avant analyse chimique.

Repiquage d’un échantillon d'un peuplier "Populus tremula x alba" transgénique en culture in vitro. Cet échantillon, appelée explant, a été prélevé depuis un peuplier âgé de deux mois et est introduit stérilement à l’aide de pinces dans un tube contenant le milieu de culture nécessaire au développement de la nouvelle plante (milieu de Murashige et Skoog). Ce peuplier transgénique est utilisé pour étudier le rôle de gènes dont la fonction est encore inconnue mais qui s’expriment fortement dans…

Dépôt de sections (100 µm) de racine de luzerne, "Medicago truncatula", sur une lame de verre, en vue de les observer ensuite au microscope. Les coupes ont été préalablement marquées avec des colorants fluorescents dans le but de visualiser les tissus qui composent la racine et la propagation d’un champignon pathogène dans celle-ci. Les échantillons proviennent d'une culture in vitro de plantules de luzerne en milieu gélosé, infectées par un champignon, "Aphanomyces euteiches", avec dépôts de…

Collecte de racines et de feuilles de la fougère "Pteris vittata" en association avec un champignon symbiotique du sol. Les ARN de ces tissus seront extraits pour tester l’activation de certains gènes de la fougère en présence du champignon. Ces données seront comparées à celles obtenues chez les plantes à fleurs, afin de comprendre la conservation de cette symbiose depuis plus de 450 millions d’années.

Infiltration d'une feuille de tabac "Nicotiana benthamiana" par la bactérie "Agrobacterium tumefaciens". Après avoir inséré dans la bactérie un ou plusieurs gènes d’intérêt, les chercheurs utilisent la capacité naturelle d’Agrobacterium à transférer une partie de son matériel génétique dans les cellules de tabac, afin d’exprimer de façon transitoire le ou les gènes introduits. Ce transfert de gènes, appelé transgénèse, n’est pas héritable et se limite aux tissus infectés. Cette technique est…