Frédéric MALIGNE

Prélèvement d'un échantillon de feuille de tabac "Nicotiana benthamiana" pour son observation au microscope confocal en vue d'une expérience de FRET-FLIM. Le FRET-FLIM est la combinaison du transfert d’énergie par résonance Förster (FRET) à de la microscopie d'imagerie à durée de vie par fluorescence (FLIM). La durée de vie de fluorescence d'un fluorophore (FLT) est un paramètre qui peut mettre en évidence des différences dans l'environnement entourant la protéine qui y est accrochée. Parmi ces…

Prélèvement d'hydathodes de chou-fleur infectés par la bactérie "Xanthomonas". La bactérie "Xanthomonas campestris pv. campestris" est l'agent responsable de la nervation noire chez des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Il s'agit de la bactériose des crucifères la plus importante au niveau mondial. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries phytopathogènes à leurs hôtes. L'objectif à long…

Infiltration à l’aide d’une seringue, d'une culture liquide d'"Agrobacterium tumefaciens" dans les cellules de feuilles de tabac "Nicotiana benthamiana". "A. tumefaciens" est une bactérie du sol parcouru par les racines de plantes. Elle est utilisée comme un outil de transfert du matériel génétique, c'est-à-dire qu'elle peut transférer dans la cellule végétale un fragment d’ADN défini. Pour ce faire, les scientifiques introduisent au préalable l'ADN qui code la protéine qu'ils souhaitent…

Infection de plants de chou-fleur par la bactérie "Xanthomonas campestris pv. campestris". Une suspension bactérienne est poussée à l'intérieur de la feuille. Cette bactérie phytopathogène est responsable de la nervation noire chez des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Cette nervation noire est une maladie majeure des crucifères au niveau mondial. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries…

Prélèvement de surnageants lors de l'extraction d'ADN pour une analyse métagénomique. L'objectif de cette analyse est de déterminer la diversité et la composition des communautés bactériennes présentes dans des échantillons de sol. Ils proviennent de 160 populations naturelles d'arabette localisées dans l'ouest de la région Midi-Pyrénées. Le microbiote présent dans le sol est crucial pour la santé des plantes, à la fois pour la croissance et la survie des plantes. L'objectif de ce projet est d…

Pot dans lequel une plante d'arabette des dames, "Arabidopsis thaliana", est mise en compétition avec du pâturin annuel, "Poa. annua". Les scientifiques cherchent à mieux comprendre la réponse d'"Arabidopsis thaliana" à la compétition. Il s'agit plus exactement d’identifier les bases génétiques de l'adaptation d'"Arabidopsis thaliana", afin de déterminer sa capacité à répondre aux conditions de compétition.

Gouttes de guttation à la marge de feuilles d'arabette des dames, "Arabidopsis thaliana". La guttation est l'exsudation de sève sous forme de gouttes au niveau des feuilles de végétaux. Ce processus biologique se produit au niveau d'organes présents à la marge des feuilles appelés "hydathodes" quand trop d'eau s'accumule dans la feuille. Les hydathodes sont aussi les points d’entrée majeurs pour la bactérie phytopatogène "Xanthomonas". En d'autres termes, c'est à ce niveau que l'infection s…

Préparation de cultures bactériennes pour étalement à l'aide d'un spiraleur. Ces bactéries "Ralstonia solanacearum" proviennent d'une plante d'"Arabidopsis thaliana" où elles ont été préalablement inoculées. Cette bactérie phytopathogène colonise la plante hôte et cause son flétrissement irréversible. Ici, les bactéries récupérées par écrasement de la plante infectée sont étalées sur une boîte de culture à l'aide d'un appareil, le spiraleur, afin de pouvoir quantifier le nombre de bactéries…

Infection par trempage des hydathodes de plants de chou-fleur par la bactérie "Xanthomonas". La bactérie "Xanthomonas campestris pv. campestris" est l'agent responsable de la nervation noire chez des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Il s'agit de la bactériose des crucifères la plus importante au niveau mondial. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries phytopathogènes à leurs hôtes. L…

Coloration au rouge Ponceau des protéines totales extraites d'un plant de tabac. Cette manipulation a lieu après le transfert des protéines d'un gel d'acrylamide vers une membrane de nitrocellulose. Elle permet de contrôler la quantité de protéines déposées sur le gel et présentes sur la membrane. Ici, la membrane est incubée avec le colorant. Le plant de tabac sert "d'usine" à fabriquer des protéines d'intérêt. Une fois produites, les protéines sont extraites, purifiées, puis visualisées sur…

Infection d'un plant de chou-fleur par la bactérie "Xanthomonas campestris pv. campestris". Cette bactérie phytopathogène est responsable de la nervation noire chez des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Cette nervation noire est une maladie majeure des crucifères au niveau mondial. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries phytopathogènes à leurs hôtes. L'objectif à long terme est de…

Prélèvement d'une colonie bactérienne issue du microbiote d'arabette des dames, "Arabidopsis thaliana", sur un milieu gélosé en conditions stériles. Cette colonie bactérienne sera incorporée à la collection de souches bactériennes représentatives du microbiote foliaire des populations naturelles d'"Arabidopsis thaliana" dans l'ouest de la région Occitanie. Après identification de son affiliation taxonomique, cette souche pourrait être caractérisée au niveau de son génome et de son effet sur la…

Évaluation en milieu naturel des caractères morphologiques d'une plante d'arabette des dames, "Arabidopsis thaliana", en fleur. Dans un contexte de changements globaux, les scientifiques cherchent à mieux comprendre la réponse adaptative potentielle de cette espèce face à de nouvelles perturbations abiotiques et/ou biotiques. L'objectif consiste plus précisément à identifier les bases génétiques de l'adaptation des espèces végétales, afin de déterminer leur capacité à répondre aux modifications…

Échantillon de tabac "Nicotiana benthamiana" mis sur une lame pour son observation au microscope confocal en vue d'une expérience de FRET-FLIM. Le FRET-FLIM est la combinaison du transfert d’énergie par résonance Förster (FRET) à de la microscopie d'imagerie à durée de vie par fluorescence (FLIM). La durée de vie de fluorescence d'un fluorophore (FLT) est un paramètre qui peut mettre en évidence des différences dans l'environnement entourant la protéine qui y est accrochée. Parmi ces…

Prélèvement d'hydathodes de chou-fleur infectés par la bactérie "Xanthomonas". La bactérie "Xanthomonas campestris pv. campestris" est l'agent responsable de la nervation noire chez des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Il s'agit de la bactériose des crucifères la plus importante au niveau mondial. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries phytopathogènes à leurs hôtes. L'objectif à long…

Délimitation de la zone de la feuille de "Nicotiana benthamiana" infiltrée par la bactérie "Agrobacterium tumefaciens". La zone infiltrée est délimitée afin de repérer la partie exacte de la feuille qui a été en contact avec la bactérie. En effet, certaines protéines produites suite à l’infiltration avec "A. tumefaciens", provoquent une mort cellulaire localisée. Cette mort des cellules foliaires a pour rôle de limiter la propagation du pathogène, qui meurt à son tour. La plante résiste donc à…

Feuille de chou-fleur infectée par la bactérie "Xanthomonas campestris pv. campestris". Une suspension bactérienne a été poussée à l'intérieur de la feuille. Cette bactérie phytopathogène est responsable de la nervation noire chez des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Cette nervation noire est une maladie majeure des crucifères au niveau mondial. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries…

Transfert de protéines exprimées transitoirement chez "Nicotiana benthamiana", d'un gel d'acrylamide vers une membrane de nitrocellulose. Ici, le plant de tabac "Nicotiana benthamiana" sert "d'usine" à fabriquer les protéines d'intérêt. Une fois produites, les protéines sont extraites, purifiées, puis visualisées sur un western par immunodétection (migration des protéines sur un gel d'acrylamide, transfert de ces dernières sur une membrane de nitrocellulose et immunodétection). Les…

Observation de symptômes de nervation noire sur des plants de chou-fleur. L'agent responsable de la nervation noire est la bactérie phytopathogène "Xanthomonas campestris pv. campestris". Elle infecte des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Il s'agit de la bactériose des crucifères la plus importante au niveau mondial. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries phytopathogènes à leurs hôtes…

Caractérisation de l'interaction entre un plant d'arabette des dames, "Arabidopsis thaliana" et du pâturin annuel, "Poa annua", au cours d'une expérimentation en conditions contrôlées de chambre de culture. Au cours de leur cycle de vie, les plantes interagissent avec plusieurs plantes voisines. Afin d'identifier les mécanismes moléculaires impliqués dans les interactions entre plantes, un projet visant à identifier les gènes associés à la réponse d'"Arabidopsis thaliana" à la présence d'une…

Récolte de gouttes de guttation à la marge de feuilles d'arabette des dames, "Arabidopsis thaliana". La guttation est l'exsudation de sève sous forme de gouttes au niveau des feuilles de végétaux. Ce processus biologique se produit au niveau d'organes présents à la marge des feuilles appelés "hydathodes" quand trop d'eau s'accumule dans la feuille. Les hydathodes sont aussi les points d’entrée majeurs pour la bactérie phytopatogène "Xanthomonas". En d'autres termes, c'est à ce niveau que l…

Dilution du broyage d'arabette des dames, "Arabidopsis thaliana". Cette plante est écrasée dans le but de récupérer puis quantifier le nombre de bactéries "Ralstonia solanacearum" qui l'ont infectée. A cause du grand nombre de bactéries présentes dans la plante après infection, la dilution facilite la quantification et donc le dénombrement des bactéries. Cette bactérie phytopathogène colonise la plante hôte et cause son flétrissement irréversible.

Infection par trempage des hydathodes de plants de chou-fleur par la bactérie "Xanthomonas". La bactérie "Xanthomonas campestris pv. campestris" est l'agent responsable de la nervation noire chez des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Il s'agit de la bactériose des crucifères la plus importante au niveau mondial. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries phytopathogènes à leurs hôtes. L…

Rinçage de la membrane de nitrocellulose après coloration des protéines totales au rouge Ponceau. Sur cette membrane, des protéines extraites d'un plant de tabac "Nicotiana benthamiana" ont été transférées. Cette coloration permet de contrôler la quantité de protéines présentes sur la membrane. Le plant de tabac "Nicotiana benthamiana" sert "d'usine" à fabriquer des protéines d'intérêt. Une fois produites, les protéines sont extraites, purifiées, puis visualisées sur un western par…

Infection d'un plant de chou-fleur par la bactérie "Xanthomonas campestris pv. campestris". Cette bactérie phytopathogène est responsable de la nervation noire chez des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Cette nervation noire est une maladie majeure des crucifères au niveau mondial. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries phytopathogènes à leurs hôtes. L'objectif à long terme est de…

Centrifugation d'échantillons de sol lors de l'extraction de l'ADN pour une analyse métagénomique. L'objectif de cette analyse est de déterminer la diversité et la composition des communautés bactériennes présentes dans des échantillons de sol. Ils proviennent de 160 populations naturelles d'arabette localisées dans l'ouest de la région Midi-Pyrénées. Le microbiote présent dans le sol est crucial pour la santé des plantes, à la fois pour la croissance et la survie des plantes. L'objectif de ce…

Plante d'arabette des dames, "Arabidopsis thaliana", ayant poussé en milieu naturel. Cette plante est considérée comme un modèle pour la recherche en biologie et en génétique végétale car son génome a été entièrement séquencé.

Prélèvement d'un échantillon de feuille de tabac "Nicotiana benthamiana" pour son observation au microscope confocal en vue d'une expérience de FRET-FLIM. Le FRET-FLIM est la combinaison du transfert d’énergie par résonance Förster (FRET) à de la microscopie d'imagerie à durée de vie par fluorescence (FLIM). La durée de vie de fluorescence d'un fluorophore (FLT) est un paramètre qui peut mettre en évidence des différences dans l'environnement entourant la protéine qui y est accrochée. Parmi ces…

Prélèvement d'hydathodes de chou-fleur infectés par la bactérie "Xanthomonas". La bactérie "Xanthomonas campestris pv. campestris" est l'agent responsable de la nervation noire chez des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Il s'agit de la bactériose des crucifères la plus importante au niveau mondial. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries phytopathogènes à leurs hôtes. L'objectif à long…

Observation de la bactérie "Agrobacterium tumefaciens" après culture sur milieu gélosé et en milieu liquide. Pour assurer la conservation des souches bactériennes étudiées, les bactéries sont stockées à l’état latent dans un congélateur à -80 °C, en présence de glycérol. Il est possible de réactiver leur croissance en les transférant sur une boîte de Petri contenant le milieu de culture gélosé adapté. Chaque bactérie se multiplie pour former une colonie bactérienne qui est ensuite transférée…

Observation des symptômes de maladie causés par la bactérie "Xanthomonas" chez le chou-fleur. La bactérie "Xanthomonas campestris pv. campestris" est l'agent responsable de la nervation noire chez des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Cette nervation noire est une maladie majeure des crucifères au niveau mondial. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries phytopathogènes à leurs hôtes. L…

Gel d'acrylamide placé dans un tampon de transfert. Il s'agit de la première étape du transfert de protéines d'un plant de tabac, "Nicotiana benthamiana", du gel d'acrylamide vers la membrane de nitrocellulose. Le plant de tabac sert "d'usine" à fabriquer les protéines d'intérêt. Les scientifiques étudient ainsi les interactions plantes-microorganismes, au niveau protéique.

Observation de symptômes de nervation noire sur des plants de chou-fleur. L'agent responsable de la nervation noire est la bactérie phytopathogène "Xanthomonas campestris pv. campestris". Elle infecte des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Il s'agit de la bactériose des crucifères la plus importante au niveau mondial. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries phytopathogènes à leurs hôtes…

Arrosages de plants d'arabette des dames, "Arabidopsis thaliana", mis en compétition avec du pâturin annuel, "Poa annua" en conditions contrôlées de chambre de culture. Au cours de leur cycle de vie, les plantes interagissent avec plusieurs plantes voisines. Afin d'identifier les mécanismes moléculaires impliqués dans les interactions entre plantes, un projet visant à identifier les gènes associés à la réponse d'"Arabidopsis thaliana" à la présence d'une espèce compétitrice a été mis en place…

Récolte de gouttes de guttation à la marge de feuilles d'arabette des dames, "Arabidopsis thaliana". La guttation est l'exsudation de sève sous forme de gouttes au niveau des feuilles de végétaux. Ce processus biologique se produit au niveau d'organes présents à la marge des feuilles appelés "hydathodes" quand trop d'eau s'accumule dans la feuille. Les hydathodes sont aussi les points d’entrée majeurs pour la bactérie phytopatogène "Xanthomonas". En d'autres termes, c'est à ce niveau que l…

Observation de phénotypes d’auto-immunité (mort cellulaire) chez des plantules d’arabette des dames, "Arabidopsis thaliana". La mort cellulaire est une réponse immunitaire mise en place chez les plantes pour contrer le développement des pathogènes dans les tissus. Elle est mise en place suite à l’activation de récepteurs immunitaires intracellulaires. Pour étudier la fonction de ces récepteurs, il est possible de contrôler leur activation et l’induction de la mort cellulaire grâce à des…

Feuille de plants de chou-fleur après inoculation par trempage de la bactérie "Xanthomonas". La bactérie "Xanthomonas campestris pv. campestris" est l'agent responsable de la nervation noire chez des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Il s'agit de la bactériose des crucifères la plus importante au niveau mondial. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries phytopathogènes à leurs hôtes. L…

Membrane de nitrocellulose révélant les protéines totales extraites d'un plant de tabac "Nicotiana benthamiana" et colorées au rouge Ponceau. Cette coloration permet de contrôler la quantité de protéines présentes sur la membrane. Le plant de tabac "Nicotiana benthamiana" sert "d'usine" à fabriquer des protéines d'intérêt. Une fois produites, les protéines sont extraites, purifiées, puis visualisées sur un western par immunodétection (migration des protéines sur un gel d'acrylamide, transfert…

Infection d'un plant de chou-fleur par la bactérie "Xanthomonas campestris pv. campestris". Cette bactérie phytopathogène est responsable de la nervation noire chez des plantes d’intérêt agronomique telles que le chou-fleur, le brocoli ou le chou. Cette nervation noire est une maladie majeure des crucifères au niveau mondial. Les scientifiques cherchent à éclaircir les mécanismes moléculaires permettant l’adaptation de bactéries phytopathogènes à leurs hôtes. L'objectif à long terme est de…