Laboratoire ECOBIO

Écosystèmes, biodiversité, évolution (ECOBIO)

RENNES CEDEX

Le laboratoire ECOBIO couvre l’ensemble des domaines de l’écologie : écologie évolutive, écologie comportementale, écologie des communautés, écologie fonctionnelle et écologie du paysage. Il analyse les dynamiques de la biodiversité et le fonctionnement des écosystèmes continentaux face aux changements globaux (climat, usage des terres) dans une optique de Développement Durable (gestion sobre des ressources naturelles, conservation).

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Nathalie Josselin Le Bris, lauréate de la médaille de cristal du CNRS 2022, met en place des échantillons en vue de quantifier des métabolites primaires par chromatographie en phase gazeuse et spectrométrie de masse (GC-MS). Spécialisée dans l’analyse chimique de matrices environnementales, elle exerce au CNRS depuis 2003. Elle a participé a la création de la plateforme d’analyse physico-chimique EcoChim de l'Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes / UMR ECOBIO, qui permet de…

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Nathalie Josselin Le Bris met en place des échantillons pour quantifier des métabolites primaires par GC-MS
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Nathalie Josselin Le Bris, lauréate de la médaille de cristal du CNRS 2022, et une ingénieure manipulent un appareil de chromatographie liquide couplée à un spectromètre de masse en tandem (LC-TQs) permettant la quantification de pesticides dans des matrices environnementales (sol, végétaux, insectes etc.). Spécialisée dans l’analyse chimique de matrices environnementales, Nathalie Josselin Le Bris, exerce au CNRS depuis 2003. Elle a participé a la création de la plateforme d’analyse physico…

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Nathalie Josselin Le Bris et une ingénieure manipulent un appareil de LC-TQs
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Nathalie Josselin Le Bris, lauréate de la médaille de cristal du CNRS 2022, est spécialisée dans l'analyse chimique de matrice environnementales, et exerce au CNRS depuis 2003. Elle a participé a la création de la plateforme d’analyse physico-chimique EcoChim de l'Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes / UMR ECOBIO, qui permet de quantifier et de caractériser divers échantillons biologiques et environnementaux pour répondre, en particulier, à des questions d'écologie fonctionnelle…

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Nathalie Josselin Le Bris, lauréate de la médaille de cristal du CNRS 2022
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Nathalie Josselin Le Bris, lauréate de la médaille de cristal du CNRS 2022, est spécialisée dans l'analyse chimique de matrice environnementales, et exerce au CNRS depuis 2003. Elle a participé a la création de la plateforme d’analyse physico-chimique EcoChim de l'Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes / UMR ECOBIO, qui permet de quantifier et de caractériser divers échantillons biologiques et environnementaux pour répondre, en particulier, à des questions d'écologie fonctionnelle…

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Nathalie Josselin Le Bris, lauréate de la médaille de cristal du CNRS 2022
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Nathalie Josselin Le Bris, lauréate de la médaille de cristal du CNRS 2022, est spécialisée dans l'analyse chimique de matrice environnementales, et exerce au CNRS depuis 2003. Elle a participé a la création de la plateforme d’analyse physico-chimique EcoChim de l'Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes / UMR ECOBIO, qui permet de quantifier et de caractériser divers échantillons biologiques et environnementaux pour répondre, en particulier, à des questions d'écologie fonctionnelle…

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Nathalie Josselin Le Bris, lauréate de la médaille de cristal du CNRS 2022
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Drosophile à ailes tachetées, "Drosophila suzukii". Cette espèce de mouche invasive et susceptible d'occasionner des dégâts (nuisible), peut dévaster jusqu’à 80 % de la production d’un champ de framboises ou de cerises. Alors que les drosophiles pondent habituellement dans les fruits en décomposition, la drosophile à ailes tachetées dépose ses œufs dans des fruits encore sur pied. Cela oblige les agriculteurs à changer leurs pratiques. Ils récoltent les fruits plus régulièrement et les…

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Drosophile à ailes tachetées, "Drosophila suzukii"
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Nettoyage d'un faux philodendron, "Monstera deliciosa", dont certaines feuilles mesurent plus d'un mètre, au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio. Cette serre regroupe les différentes collections végétales qui sont utilisées pour les activités d’enseignement et accueille également des visites de publics variés. Elle est subdivisée en trois cellules de 70 m² représentant chacune un climat spécifique adapté aux plantes de la collection (zone tempérée, zone tropicale, cactées).

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Nettoyage d'un faux philodendron au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio
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Screening de métabolites non ciblés par un système analytique composé d’une chaîne chromatographique ultra haute performance, d’une source d’ionisation par électrospray et d’un analyseur quadripôle-temps de vol en tandem. L’objectif de l’analyse est de mettre en évidence les métabolites d’intérêt impliqués dans l’adaptation aux changements climatiques (températures par exemple) ou aux activités humaines (pesticides) chez différents organismes (drosophiles, vers de terre, plantes, par exemple).

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Analyse métabolomique non ciblée par Chromatographie Liquide couplée à la Spectrométrie de Masse Haute résolution
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Cladocères, "Bosmina longirostris", observé au microscope inversé. Cette puce d'eau fait partie du zooplancton prélevé dans le lac de Grand-Lieu en Loire-Atlantique, et identifié dans le cadre d’un suivi de ce grand lac, qui est une réserve naturelle dont le fonctionnement écologique et la diversité planctonique sont peu connus. Le zooplancton est un des premiers maillons du réseau trophique. Il se nourrit du phytoplancton et est prédaté par les poissons. Il existe beaucoup d’espèces…

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Cladocères, "Bosmina longirostris", observé au microscope inversé
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Observation d'une carotte de sédiment prélevée en zone humide, dans la vasière de la réserve naturelle nationale de l'estuaire de la Seine, sous le pont de Normandie. La pointe très fine d'une microsonde va être plongée progressivement dans le sédiment (100 micromètres par 100 micromètres) pour effectuer des mesures d'oxygène à différentes profondeurs. Un micromanipulateur piloté par ordinateur permet de faire cette opération très précisément et d'enregistrer les taux d'oxygène à chaque palier…

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Observation d'une carotte de sédiment prélevée en zone humide
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Plantes placées sur un chariot pour être amenées au laboratoire afin de réaliser des analyses génétiques (extractions d'ADN), sur la plateforme d’écologie moléculaire (PEM) de l'unité de recherche Ecobio. Ces plantes sont des spécimens de spartines (genre "Spartina") et de renouées (genre "Reynoutria"), elles proviennent de différentes régions du monde et certaines sont envahissantes. Elles font partie des collections conservées dans la serre expérimentale d'Ecobio et sont notamment utilisées…

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Plantes placées sur un chariot pour être amenées au laboratoire afin de réaliser des analyses génétiques
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Culture de plantes des îles Kerguelen et Crozet (Terres australes et antarctiques françaises) en phytotron froid (4 °C, ECOLEX), en vue d’étudier leur plasticité physiologique et morphologique face à un changement de conditions, ainsi que leur diversité cytogénétique et génétique. Le but du programme de recherches PlantEvol / PlantADAPT soutenu par l’Institut polaire français Paul-Emile Victor est de reconstituer l’évolution et d'évaluer la capacité d’adaptation des espèces de plantes…

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Culture de plantes des îles Kerguelen et Crozet en phytotron froid
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"Ranunculus pseudotrullifolius Skottsb.", plante d’origine magellanique, récoltée aux îles Kerguelen (Terres australes et antarctiques françaises) et en culture en phytotron froid (4 °C, Centre ECOLEX). Le programme de recherches PlantEvol / PlantADAPT soutenu par l’Institut polaire français Paul-Emile Victor porte sur les plantes des îles Kerguelen et Crozet (Terres australes et antarctiques françaises) et vise à évaluer leur plasticité physiologique et morphologique face au changement…

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"Ranunculus pseudotrullifolius Skottsb.", plante d’origine magellanique, récoltée aux îles Kerguelen
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Electrolyte à l'intérieur d'une microsonde qui mesure l'oxygène à différentes profondeurs dans une carotte de sédiment. La pointe très fine de la microsonde est plongée progressivement (100 micromètres par 100 micromètres) dans le sédiment prélevé en zone humide, dans la vasière de la réserve naturelle nationale de l'estuaire de la Seine, sous le pont de Normandie. Un micromanipulateur piloté par ordinateur permet de faire cette opération très précisément et d'enregistrer les taux d'oxygène à…

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Electrolyte à l'intérieur d'une microsonde qui mesure l'oxygène dans une carotte de sédiment
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Consultation de la clé de détermination des carabides pour les paysages agricoles du nord-ouest de la France. Ce document de référence permet l'identification au genre et espèce des spécimens de carabes prélevés sur le terrain. Il a été réalisé par Jean-Luc Roger (Inrae) et Olivier Jambon (Ecobio – CNRS). Le carabe est beaucoup utilisé dans le monde de la recherche, c'est un modèle biologique. Les spécimens sont identifiés et conservés quelques années, le temps de la recherche, dans des…

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Consultation de la clé de détermination des carabides pour les paysages agricoles du nord-ouest de la France
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Cage d'élevage contenant des drosophiles du cerisier, "Drosophila suzukii", placée dans un incubateur. Il permet de faire varier la température d'élevage, de -20 °C à +40 °C, et aussi la lumière en intensité et durée. Cette petite mouche asiatique arrivée il y a 10/15 ans en France, est un très grand ravageur des cultures, notamment des petits fruits : cerises, framboises, fraises. Contrairement aux autres drosophiles elles ne s'attaquent pas aux fruits déjà un peu trop mûrs, mais pondent dans…

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Cage d'élevage contenant des drosophiles du cerisier placée dans un incubateur.
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Nettoyage d'un faux philodendron, "Monstera deliciosa", dont certaines feuilles mesurent plus d'un mètre, au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio. Cette serre regroupe les différentes collections végétales qui sont utilisées pour les activités d’enseignement et accueille également des visites de publics variés. Elle est subdivisée en trois cellules de 70 m² représentant chacune un climat spécifique adapté aux plantes de la collection (zone tempérée, zone tropicale, cactées).

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Nettoyage d'un faux philodendron au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio
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Stockage dans un congélateur à -80 °C d'échantillons environnementaux. Chaque échantillon issu de prélèvements réalisés sur le terrain est rangé en boîte, référencée dans une base de données. L'objectif de ces études de microbiologie environnementale est de comprendre le fonctionnement de milieux comme les vases. Les microorganismes qui y pratiquent des réactions pouvant aider à dépolluer sont détectés grâce à leurs acides nucléiques. La transformation des nitrates en diazote (dénitrification)…

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Stockage dans un congélateur à -80 °C d'échantillons environnementaux
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Cladocères, "Bosmina longirostris", observé au microscope inversé. Cette puce d'eau fait partie du zooplancton prélevé dans le lac de Grand-Lieu en Loire-Atlantique, et identifié dans le cadre d’un suivi de ce grand lac, qui est une réserve naturelle dont le fonctionnement écologique et la diversité planctonique sont peu connus. Le zooplancton est un des premiers maillons du réseau trophique. Il se nourrit du phytoplancton et est prédaté par les poissons. Il existe beaucoup d’espèces…

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Cladocères, "Bosmina longirostris", observé au microscope inversé
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Observation d'une carotte de sédiment prélevée en zone humide, dans la vasière de la réserve naturelle nationale de l'estuaire de la Seine, sous le pont de Normandie. La pointe très fine d'une microsonde va être plongée progressivement dans le sédiment (100 micromètres par 100 micromètres) pour effectuer des mesures d'oxygène à différentes profondeurs. Un micromanipulateur piloté par ordinateur permet de faire cette opération très précisément et d'enregistrer les taux d'oxygène à chaque palier…

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Observation d'une carotte de sédiment prélevée en zone humide
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Collection d’échantillons de spartines (genre "Spartina") originaires d’Europe et d’Amérique du Nord, au premier plan. Au second plan, des plantes sont transférées de la serre expérimentale vers le laboratoire par une doctorante, pour l'analyse de l’évolution du génome des spartines. Ces plantes font partie des collections conservées dans la serre expérimentale d'Ecobio et sont notamment utilisées pour l’étude de l’histoire évolutive des espèces (par des approches génétiques et génomiques) et…

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Collection d’échantillons de spartines originaires d’Europe et d’Amérique du Nord au premier plan
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Culture de jeunes individus de "Lyallia kerguelensis Hook. f." ("Montiaceae"), plante en coussin strictement endémique des îles subantarctiques de Kerguelen, en phytotron froid (4°C, ECOLEX). Les îles Kerguelen (Terres australes et antarctiques françaises), dans l’océan Indien austral, sont soumises à un changement climatique rapide et intense. Le programme de recherches PlantEvol / PlantADAPT soutenu par l’Institut polaire français Paul-Emile Victor cherche à reconstituer l’évolution d'espèces…

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Culture en phytotron froid de jeunes individus d'une plante en coussin endémique des Kerguelen
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Serre de collection du laboratoire Ecobio, regroupant les différentes collections végétales qui sont utilisées pour les activités d’enseignement et accueillant également des visites de publics variés. Elle est subdivisée en trois cellules de 70 m² représentant chacune un climat spécifique adapté aux plantes de la collection (zone tempérée, zone tropicale, cactées).

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Serre de collection du laboratoire Ecobio
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Deux espèces de carabes, la féronie noire, "Carabus intricatus", au centre et autour plus petits, des carabes embrouillés, "Abax parallelepipedus". Ils sont plutôt inféodés aux zones de bois et de haies à végétation dense. Le carabe est beaucoup utilisé dans le monde de la recherche, c'est un modèle biologique. Les spécimens sont identifiés et conservés quelques années, le temps de la recherche, dans des piluliers avec de l'éthanol à 70%. Ce coléoptère est réparti un peu partout en France pour…

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Deux espèces de carabes, la féronie noire au centre et autour plus petits, des carabes embrouillés
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Tube contenant des drosophiles du cerisier, "Drosophila suzukii". Cette petite mouche asiatique arrivée il y a 10/15 ans en France, est un très grand ravageur des cultures, notamment des petits fruits : cerises, framboises, fraises. Contrairement aux autres drosophiles elles ne s'attaquent pas aux fruits déjà un peu trop mûrs, mais pondent dans des fruits qui commencent à être matures. C'est donc quand le fruit peut être récolté que les larves commencent à sortir. Dans certaines cultures, près…

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Tube contenant des drosophiles du cerisier
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Apport de coccinelles "Cryptolaemus montrouzieri", sur des plantes au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio. Les différents insectes auxiliaires (coccinelles, chrysopes...) apportés dans la serre sont particulièrement intéressants dans le cadre de la lutte biologique puisqu'ils évitent les traitements chimiques pour réguler certains ravageurs (cochenilles, thrips, pucerons...). La serre de collection du laboratoire Ecobio regroupe les différentes collections végétales qui sont…

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Apport de coccinelles sur des plantes au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio
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Acides nucléiques extraits de la vase et stockés dans un congélateur à -80 °C. Chaque échantillon issu de prélèvements réalisés sur le terrain est rangé en boîte, référencée dans une base de données. L'objectif de ces études de microbiologie environnementale est de comprendre le fonctionnement de milieux comme les vases. Les microorganismes qui y pratiquent des réactions pouvant aider à dépolluer sont détectés grâce à leurs acides nucléiques. La transformation des nitrates en diazote …

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Acides nucléiques extraits de la vase et stockés dans un congélateur à -80 °C
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Carotte de sédiment prélevée en zone humide, dans la vasière de la réserve naturelle nationale de l'estuaire de la Seine, sous le pont de Normandie. La pointe très fine d'une microsonde va être plongée progressivement dans le sédiment (100 micromètres par 100 micromètres) pour effectuer des mesures d'oxygène à différentes profondeurs. Un micromanipulateur piloté par ordinateur permet de faire cette opération très précisément et d'enregistrer les taux d'oxygène à chaque palier. Ce taux d'oxygène…

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Carotte de sédiment prélevée en zone humide
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Introduction de drosophiles du cerisier, "Drosophila suzukii", dans une cage d'élevage. Elles vont se disperser pour pondre dans des tubes ouverts contenant un milieu nutritif, composé de sucre et de levure, qui servira de nourriture pour les larves. Cette petite mouche asiatique arrivée il y a 10/15 ans en France, est un très grand ravageur des cultures, notamment des petits fruits : cerises, framboises, fraises. Contrairement aux autres drosophiles elles ne s'attaquent pas aux fruits déjà un…

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Introduction de drosophiles du cerisier dans une cage d'élevage
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Sélection de plantes en vue de prélèvements de jeunes feuilles, ici chez "Spartina versicolor", pour en extraire de l’ADN. "Spartina versicolor" était considérée native des côtes méditerranéennes, mais s’avère être une espèce introduite d’Amérique du Nord (synonyme de "Spartina patens") envahissante. Les scientifiques étudient l’histoire évolutive et les mécanismes tels que la polyploïdie (duplication du génome) à l’origine de la formation de nouvelles espèces envahissantes.

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Sélection de plantes en vue de prélèvements de jeunes feuilles pour en extraire de l’ADN
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Culture de plantes des îles Kerguelen et Crozet (Terres australes et antarctiques françaises) en phytotron froid (4 °C, Centre ECOLEX), en vue d’étudier leur plasticité physiologique et morphologique face à un changement de conditions, ainsi que leur diversité cytogénétique et génétique. Le but du programme de recherches PlantEvol / PlantADAPT soutenu par l’Institut polaire français Paul-Emile Victor est de reconstituer l’évolution et d'évaluer la capacité d’adaptation des espèces de plantes…

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Culture de plantes des îles Kerguelen et Crozet en phytotron froid
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Empotage de plantes bouturées, pour la conservation et la perpétuation des différentes espèces, au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio. Cette serre regroupe les différentes collections végétales qui sont utilisées pour les activités d’enseignement et accueille également des visites de publics variés. Elle est subdivisée en trois cellules de 70 m² représentant chacune un climat spécifique adapté aux plantes de la collection (zone tempérée, zone tropicale, cactées).

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Empotage de plantes bouturées au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio
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Un carabe, la féronie noire, "Carabus intricatus" mis dans un pilulier avec de l'éthanol à 70%. Le carabe est beaucoup utilisé dans le monde de la recherche, c'est un modèle biologique. Les spécimens sont identifiés et conservés quelques années, le temps de la recherche. Ce coléoptère est réparti un peu partout en France pour 60 à 70% des espèces, mais il existe tout de même des espèces endémiques à la région Bretagne et au type de paysage. Certains carabes sont inféodés à des haies, des bois,…

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Un carabe, la féronie noire, mis dans un pilulier avec de l'éthanol à 70%
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Tube contenant des drosophiles du cerisier, "Drosophila suzukii". Les mâles sont visibles ici, ils ont deux petits points noirs au bout des ailes. Cette petite mouche asiatique arrivée il y a 10/15 ans en France, est un très grand ravageur des cultures, notamment des petits fruits : cerises, framboises, fraises. Contrairement aux autres drosophiles elles ne s'attaquent pas aux fruits déjà un peu trop mûrs, mais pondent dans des fruits qui commencent à être matures. C'est donc quand le fruit…

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Tube contenant des drosophiles du cerisier
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Stockage dans un congélateur à -80 °C d'échantillons environnementaux. Chaque échantillon issu de prélèvements réalisés sur le terrain est rangé en boîte, référencée dans une base de données. L'objectif de ces études de microbiologie environnementale est de comprendre le fonctionnement de milieux comme les vases. Les microorganismes qui y pratiquent des réactions pouvant aider à dépolluer sont détectés grâce à leurs acides nucléiques. La transformation des nitrates en diazote (dénitrification)…

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Stockage dans un congélateur à -80 °C d'échantillons environnementaux
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Pointe très fine d'une microsonde plongée dans une carotte de sédiment prélevée en zone humide, dans la vasière de la réserve naturelle nationale de l'estuaire de la Seine, sous le pont de Normandie. La pointe plonge progressivement dans le sédiment (100 micromètres par 100 micromètres) pour effectuer des mesures d'oxygène à différentes profondeurs. Un micromanipulateur piloté par ordinateur permet de faire cette opération très précisément et d'enregistrer les taux d'oxygène à chaque palier. Ce…

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Pointe très fine d'une microsonde plongée dans une carotte de sédiment prélevée en zone humide
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Apport de coccinelles "Cryptolaemus montrouzieri", sur des plantes au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio. Les différents insectes auxiliaires (coccinelles, chrysopes...) apportés dans la serre sont particulièrement intéressants dans le cadre de la lutte biologique puisqu' ils évitent les traitements chimiques pour réguler certains ravageurs (cochenilles, thrips, pucerons...). La serre de collection du laboratoire Ecobio regroupe les différentes collections végétales qui sont…

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Apport de coccinelles sur des plantes au sein de la serre de collection du laboratoire Ecobio
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Echantillons de vase stockés dans un congélateur à -80 °C. Chaque échantillon issu de prélèvements réalisés sur le terrain est rangé en boîte, référencée dans une base de données. L'objectif de ces études de microbiologie environnementale est de comprendre le fonctionnement de milieux comme les vases. Les microorganismes qui y pratiquent des réactions pouvant aider à dépolluer sont détectés grâce à leurs acides nucléiques. La transformation des nitrates en diazote (dénitrification) peut ainsi…

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Echantillons de vase stockés dans un congélateur à -80 °C
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Carotte de sédiment prélevée en zone humide, dans la vasière de la réserve naturelle nationale de l'estuaire de la Seine, sous le pont de Normandie. La pointe très fine d'une microsonde va être plongée progressivement dans le sédiment (100 micromètres par 100 micromètres) pour effectuer des mesures d'oxygène à différentes profondeurs. Un micromanipulateur piloté par ordinateur permet de faire cette opération très précisément et d'enregistrer les taux d'oxygène à chaque palier. Ce taux d'oxygène…

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Carotte de sédiment prélevée en zone humide

CNRS Images,

Nous mettons en images les recherches scientifiques pour contribuer à une meilleure compréhension du monde, éveiller la curiosité et susciter l'émerveillement de tous.