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L'un des atouts du poisson zèbre "Danio rerio" est la transparence de ses embryons. Ainsi, les territoires d'expression de différents gènes peuvent être rapidement caractérisés par hybridation in situ sur embryons entiers. En haut à droite : en bleu, marquage des rhombomères 3 et 5 du cerveau postérieur, en rouge, musculature somatique. En bas à gauche : sous-population neuronale de la plaque neurale. Au milieu : interneurones de la rétine. A droite : musculature de la tête du poisson.

Femelle adulte du poisson zèbre "Danio rerio". Ce petit poisson d'eau douce (4 cm à l'âge adulte) est devenu au cours des vingt dernières années l'un des organismes modèles pour l'étude du développement embryonnaire des vertébrés. Parmi ses avantages, la transparence totale des embryons de cette espèce permet d'identifier l'expression spatiale des gènes lors de l'embryogenèse.(Réf. CNRS-INFO N°401 Avril 2002)

Chez un embryon du poisson zèbre "Danio rerio", exemple de gènes présentant une expression spatialement restreinte au cours du développement embryonnaire. On voit ici chez un embryon de 18 somites, l'expression d'un gène (snail 1) visualisé par hybridation in situ dans les somites et le bourgeon caudal.