Crépuscule aux trente mille variables

La technique récente de séquençage du transcriptome en cellule unique permet d'identifier tous les gènes exprimés par des cellules isolées à partir d'un tissu complexe. Ceci permet d'accéder aux dé-terminants moléculaires de l'identité de chaque cellule et de déchiffrer les mécanismes de leur diffé-rentiation. La quantité de données générées est énorme : dans cet exemple, le niveau d'expression de quelques 30 000 gènes a été déterminé pour 10 000 cellules d'un pétale de pétunia. Pour réduire la complexité des données, on utilise des algorithmes mathématiques (Uniform Manifold Approxima-tion Projection, ou UMAP) qui permettent de réduire la dimension des données. La vue d'artiste représente ici la simplification des 30 000 données d'expression en seulement 3 paramètres, représen-tables dans l'espace.